87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1032 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1032  mannose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 376 aa  768    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  34.82 
 
 		 386 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3549  mannose-6-phosphate isomerase  35.31 
 
 		 384 aa  182  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0539  mannose-6-phosphate isomerase  33.51 
 
 		 390 aa  176  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  35 
 
 		 392 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  30.36 
 
 		 374 aa  173  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1847  Mannose-6-phosphate isomerase  33.88 
 
 		 401 aa  169  9e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  30.06 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2871  mannose-6-phosphate isomerase  31.03 
 
 		 382 aa  153  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2131  mannose-6-phosphate isomerase  32.61 
 
 		 389 aa  146  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0831943  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.41 
 
 		 382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4240  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.65 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.19 
 
 		 404 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  28.73 
 
 		 404 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.15 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4833  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.86 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5379  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.3 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.407012 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.34 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.34 
 
 		 365 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3294  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.75 
 
 		 394 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0909  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.76 
 
 		 377 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  30.19 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3713  putative isomerase  28.11 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.82 
 
 		 395 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4772  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.82 
 
 		 369 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504836 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5499  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.82 
 
 		 395 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.13 
 
 		 376 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2177  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) superfamily protein  29.23 
 
 		 399 aa  96.3  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.242352  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.66 
 
 		 366 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0158  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.37 
 
 		 369 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.93 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3338  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.1 
 
 		 413 aa  94  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0557801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2991  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.58 
 
 		 438 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3058  mannose-6-phosphate isomerase protein  28.76 
 
 		 410 aa  90.9  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.473545 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1857  hypothetical protein  28.88 
 
 		 367 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0333762  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0305  isomerase  28.88 
 
 		 367 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2128  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.88 
 
 		 400 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309196  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1151  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.88 
 
 		 400 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0864  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.88 
 
 		 400 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  26.81 
 
 		 408 aa  89.7  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0395  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.88 
 
 		 367 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1747  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  28.34 
 
 		 403 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4306  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.39 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4304  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.27 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.47 
 
 		 423 aa  82.8  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.71 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.39 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.06 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  27.06 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.41 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.16 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.88 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.49 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.49 
 
 		 396 aa  62.8  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.42 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.67 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.72 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2630  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.01 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.680867  normal  0.436823 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.47 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2987  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.28 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.700011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.73 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.47 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.27 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  23.71 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.68 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  23.78 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0508  hypothetical protein  22.58 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0801762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.15 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.49 
 
 		 394 aa  57  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.66 
 
 		 401 aa  57  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.6 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.59 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.36 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.57 
 
 		 393 aa  53.5  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  25.13 
 
 		 391 aa  53.1  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1306  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.14 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.77 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.94 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.93 
 
 		 411 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.16 
 
 		 419 aa  49.7  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.88 
 
 		 403 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.57 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  22.76 
 
 		 427 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.7 
 
 		 427 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.09 
 
 		 403 aa  43.9  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.95 
 
 		 398 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.88 
 
 		 389 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.2674 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>