87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2131 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2131  mannose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
389 aa  775    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0831943  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2871  mannose-6-phosphate isomerase  45.24 
 
 
382 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0539  mannose-6-phosphate isomerase  41.41 
 
 
390 aa  270  4e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3549  mannose-6-phosphate isomerase  46.01 
 
 
384 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  34.15 
 
 
385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  35.56 
 
 
386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1847  Mannose-6-phosphate isomerase  37.15 
 
 
401 aa  169  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1032  mannose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 
376 aa  162  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  32.53 
 
 
374 aa  149  7e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  33.6 
 
 
392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.82 
 
 
395 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5499  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.82 
 
 
395 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4240  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.43 
 
 
383 aa  99.4  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163425  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4772  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.82 
 
 
369 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.504836 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.41 
 
 
382 aa  99  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.13 
 
 
369 aa  93.2  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  30.18 
 
 
408 aa  90.1  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.38 
 
 
366 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4304  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.65 
 
 
375 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.12 
 
 
377 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5379  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.21 
 
 
369 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.407012 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.5 
 
 
376 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2177  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) superfamily protein  28.8 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.242352  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0395  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.53 
 
 
367 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.87 
 
 
365 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3294  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.17 
 
 
394 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3713  putative isomerase  28.01 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4833  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.32 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1857  hypothetical protein  28.53 
 
 
367 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0333762  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0305  isomerase  28.53 
 
 
367 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0864  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.06 
 
 
400 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1151  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.06 
 
 
400 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2128  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.06 
 
 
400 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309196  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0158  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.31 
 
 
369 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.03 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1747  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  28.8 
 
 
403 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.27 
 
 
404 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  27.86 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3338  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.12 
 
 
413 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0557801  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.13 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4306  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.27 
 
 
365 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  27.64 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0909  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.15 
 
 
377 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2991  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.92 
 
 
438 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  28.85 
 
 
435 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.25 
 
 
418 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.16 
 
 
434 aa  63.5  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.49 
 
 
403 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.95 
 
 
418 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.16 
 
 
394 aa  53.5  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3058  mannose-6-phosphate isomerase protein  29.72 
 
 
410 aa  53.5  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.473545 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.25 
 
 
419 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.32 
 
 
427 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.87 
 
 
414 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.89 
 
 
392 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3784  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.93 
 
 
392 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.039561  normal  0.0465307 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.75 
 
 
395 aa  50.4  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.56 
 
 
416 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  20 
 
 
396 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.45 
 
 
408 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2630  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.64 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.680867  normal  0.436823 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  33.54 
 
 
407 aa  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.44 
 
 
420 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.43 
 
 
402 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  26.87 
 
 
483 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  26.87 
 
 
483 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  26.87 
 
 
483 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3251  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.96 
 
 
403 aa  47  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.947715  decreased coverage  0.0046378 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  26.87 
 
 
483 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  26.32 
 
 
401 aa  46.6  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  26.99 
 
 
489 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  26.87 
 
 
500 aa  46.2  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.01 
 
 
401 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.87 
 
 
403 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.76 
 
 
426 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0508  hypothetical protein  22.3 
 
 
410 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0801762  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  26.43 
 
 
485 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.57 
 
 
389 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  25 
 
 
427 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3567  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.43 
 
 
392 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.21 
 
 
426 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.84 
 
 
401 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.58 
 
 
401 aa  43.5  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  24.31 
 
 
470 aa  43.1  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0790  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.48 
 
 
417 aa  43.1  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.942264  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.16 
 
 
426 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  24.37 
 
 
391 aa  43.1  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>