133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0663 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
392 aa  781    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4240  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.87 
 
 
383 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163425  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  36.34 
 
 
385 aa  213  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  36.48 
 
 
386 aa  196  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1847  Mannose-6-phosphate isomerase  35.48 
 
 
401 aa  179  5.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  34.25 
 
 
374 aa  179  7e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1032  mannose-6-phosphate isomerase  35.46 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.03 
 
 
382 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0539  mannose-6-phosphate isomerase  32.14 
 
 
390 aa  151  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3549  mannose-6-phosphate isomerase  36.76 
 
 
384 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2871  mannose-6-phosphate isomerase  33.94 
 
 
382 aa  145  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  32.8 
 
 
408 aa  144  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.5 
 
 
395 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5499  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.5 
 
 
395 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2131  mannose-6-phosphate isomerase  33.77 
 
 
389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0831943  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4306  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.48 
 
 
365 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4772  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.23 
 
 
369 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.504836 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0158  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.58 
 
 
369 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5379  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.87 
 
 
369 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.407012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4304  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.13 
 
 
375 aa  122  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4833  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.38 
 
 
394 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.84 
 
 
369 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.11 
 
 
377 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.39 
 
 
366 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  30.16 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3294  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.32 
 
 
394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0909  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.18 
 
 
377 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.33 
 
 
376 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  28.69 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.85 
 
 
365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3713  putative isomerase  32.05 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.51 
 
 
404 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.53 
 
 
377 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2177  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) superfamily protein  29.11 
 
 
399 aa  95.9  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.242352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.93 
 
 
412 aa  94.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0395  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.49 
 
 
367 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1857  hypothetical protein  28.23 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0333762  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0864  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.23 
 
 
400 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1151  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.23 
 
 
400 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0305  isomerase  28.23 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2128  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.23 
 
 
400 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309196  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3338  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.28 
 
 
413 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0557801  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.57 
 
 
403 aa  90.5  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1747  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  27.96 
 
 
403 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.76 
 
 
392 aa  90.5  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.3 
 
 
434 aa  87  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2991  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.97 
 
 
438 aa  86.3  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.98 
 
 
423 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.6 
 
 
419 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  26.22 
 
 
418 aa  76.3  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.55 
 
 
419 aa  76.3  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.1 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0761169 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.3 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.97 
 
 
418 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0508  hypothetical protein  23.78 
 
 
410 aa  70.5  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0801762  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.79 
 
 
427 aa  70.1  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  27.97 
 
 
435 aa  69.7  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.9 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3058  mannose-6-phosphate isomerase protein  26.87 
 
 
410 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.473545 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.27 
 
 
408 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0271  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.49 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386108  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.09 
 
 
419 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.78 
 
 
419 aa  65.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.79 
 
 
418 aa  63.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.3 
 
 
416 aa  62.8  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.54 
 
 
402 aa  62.4  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10140  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  27.4 
 
 
415 aa  62  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0199  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  27.06 
 
 
411 aa  60.5  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552163  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  28.94 
 
 
407 aa  59.3  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.15 
 
 
396 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  27.11 
 
 
401 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.54 
 
 
392 aa  59.7  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.47 
 
 
426 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.03 
 
 
426 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.33 
 
 
389 aa  57.8  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.03 
 
 
343 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0269  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.96 
 
 
417 aa  57.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.475155  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.03 
 
 
426 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.14 
 
 
401 aa  57.4  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1977  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.72 
 
 
391 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057308  normal  0.460832 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.14 
 
 
401 aa  56.2  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.53 
 
 
426 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2557  N-acylglucosamine 2-epimerase  21.25 
 
 
390 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000338325  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2262  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.42 
 
 
393 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.6 
 
 
426 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1366  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.58 
 
 
393 aa  53.9  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  32.5 
 
 
470 aa  53.9  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3784  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.71 
 
 
392 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.039561  normal  0.0465307 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.16 
 
 
401 aa  53.1  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.79 
 
 
406 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.95 
 
 
410 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.27 
 
 
426 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.27 
 
 
408 aa  52.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2629  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.44 
 
 
417 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257892  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.59 
 
 
403 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.27 
 
 
425 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  37.5 
 
 
485 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4598  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.37 
 
 
427 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00161711  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  37.5 
 
 
500 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  37.5 
 
 
489 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>