101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3338 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3338  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 		 413 aa  836    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0557801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2991  N-acylglucosamine 2-epimerase  92.74 
 
 		 438 aa  754    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3058  mannose-6-phosphate isomerase protein  76.27 
 
 		 410 aa  567  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.473545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4913  hypothetical protein  44.19 
 
 		 404 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.81 
 
 		 404 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2949  putative isomerase  45.83 
 
 		 369 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6904  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.67 
 
 		 369 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4306  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.39 
 
 		 365 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4304  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.77 
 
 		 375 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5361  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.09 
 
 		 395 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5499  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.09 
 
 		 395 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4772  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.09 
 
 		 369 aa  266  7e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.504836 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0909  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.63 
 
 		 377 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  42.75 
 
 		 408 aa  259  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4833  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.56 
 
 		 394 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3294  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.45 
 
 		 394 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.25 
 
 		 377 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2177  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) superfamily protein  42.57 
 
 		 399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.242352  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0158  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.55 
 
 		 369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5379  N-acylglucosamine 2-epimerase  45 
 
 		 369 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.407012 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1747  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  43.32 
 
 		 403 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0395  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.28 
 
 		 367 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0864  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.41 
 
 		 400 aa  249  9e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1151  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.41 
 
 		 400 aa  249  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2128  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.41 
 
 		 400 aa  249  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309196  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1857  hypothetical protein  43.28 
 
 		 367 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0333762  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0305  isomerase  43.28 
 
 		 367 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.04 
 
 		 365 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3713  putative isomerase  43.8 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.15 
 
 		 376 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4860  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.41 
 
 		 377 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000600017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.25 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.1 
 
 		 382 aa  117  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1032  mannose-6-phosphate isomerase  29.1 
 
 		 376 aa  94  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0663  Mannose-6-phosphate isomerase  28.28 
 
 		 392 aa  89  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.540171 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1847  Mannose-6-phosphate isomerase  30.35 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0539  mannose-6-phosphate isomerase  28.32 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  26.63 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3549  mannose-6-phosphate isomerase  30.34 
 
 		 384 aa  76.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0505  mannose-6-phosphate isomerase  25 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0573939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2131  mannose-6-phosphate isomerase  30.38 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0831943  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  27.11 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.45 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2871  mannose-6-phosphate isomerase  26.86 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.3 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0388  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.94 
 
 		 424 aa  57  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.15 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4409  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.15 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4240  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.36 
 
 		 383 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.163425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.04 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  32.22 
 
 		 407 aa  54.3  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.17 
 
 		 394 aa  53.1  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.06 
 
 		 395 aa  53.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03765  predicted glucosamine isomerase  26.64 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.64 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4371  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.66 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.931508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.64 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4265  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.64 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.59 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4344  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.59 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.395722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4253  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.59 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  26.64 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.43 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5327  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.64 
 
 		 413 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.78432 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  29.89 
 
 		 435 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1762  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.13 
 
 		 418 aa  50.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0295295 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  29.67 
 
 		 944 aa  50.1  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.26 
 
 		 426 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.83 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1306  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.34 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.89 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.83 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.59 
 
 		 434 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  28.24 
 
 		 470 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.24 
 
 		 343 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.02 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.21 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.94 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.39 
 
 		 426 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10140  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  31.25 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.07 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.63 
 
 		 401 aa  47.4  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.41 
 
 		 406 aa  47  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3278  hypothetical protein  30.04 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198731  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  29.17 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.06 
 
 		 427 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.1 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.67 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.92 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  30.34 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  33.54 
 
 		 634 aa  44.7  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.29 
 
 		 419 aa  43.9  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  28.4 
 
 		 483 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  28.4 
 
 		 483 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  28.4 
 
 		 483 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  28.4 
 
 		 483 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0269  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.9 
 
 		 417 aa  43.5  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.475155  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  28.4 
 
 		 485 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  28.4 
 
 		 500 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  28.4 
 
 		 489 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>