124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3278 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3278  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  850    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3113  N-acylglucosamine 2-epimerase  91.79 
 
 		 414 aa  753    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4371  N-acylglucosamine 2-epimerase  72.88 
 
 		 419 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.931508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4210  N-acylglucosamine 2-epimerase  69.33 
 
 		 408 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1014  hypothetical protein  64.81 
 
 		 416 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1052  N-acylglucosamine 2-epimerase  63.54 
 
 		 417 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0420922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2629  N-acylglucosamine 2-epimerase  55.91 
 
 		 417 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4598  N-acylglucosamine 2-epimerase  52.94 
 
 		 427 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00161711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  53.25 
 
 		 425 aa  388  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  53.44 
 
 		 425 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0790  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.88 
 
 		 417 aa  376  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.942264  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1306  N-acylglucosamine 2-epimerase  54.68 
 
 		 404 aa  375  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.14 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4265  N-acylglucosamine 2-epimerase  45.41 
 
 		 413 aa  371  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03765  predicted glucosamine isomerase  44.91 
 
 		 413 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.91 
 
 		 413 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  44.91 
 
 		 413 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.91 
 
 		 413 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5327  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.91 
 
 		 413 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.78432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  53.06 
 
 		 410 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  51.28 
 
 		 407 aa  361  1e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.8 
 
 		 413 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4344  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.8 
 
 		 413 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.395722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4253  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.8 
 
 		 413 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.55 
 
 		 413 aa  355  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4409  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.55 
 
 		 413 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0388  N-acylglucosamine 2-epimerase  48.31 
 
 		 424 aa  335  1e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  48.64 
 
 		 634 aa  333  4e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10140  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  45.68 
 
 		 415 aa  330  3e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0269  N-acylglucosamine 2-epimerase  43.45 
 
 		 417 aa  317  3e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.475155  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1762  N-acylglucosamine 2-epimerase  44.61 
 
 		 418 aa  303  5.000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0295295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4855  N-acylglucosamine 2-epimerase  46.17 
 
 		 391 aa  288  8e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331313  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0199  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  40.9 
 
 		 411 aa  287  2e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552163  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  40.62 
 
 		 418 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  41.23 
 
 		 418 aa  275  9e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  40.99 
 
 		 435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.68 
 
 		 419 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.51 
 
 		 414 aa  272  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  42.93 
 
 		 418 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  39.76 
 
 		 419 aa  264  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.03 
 
 		 403 aa  183  6e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.46 
 
 		 398 aa  177  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.69 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.46 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.64 
 
 		 392 aa  157  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.88 
 
 		 412 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.66 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.53 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.58 
 
 		 426 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.16 
 
 		 426 aa  156  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  32.37 
 
 		 427 aa  156  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.41 
 
 		 406 aa  156  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  32.79 
 
 		 470 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.43 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.06 
 
 		 394 aa  153  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.77 
 
 		 408 aa  152  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.16 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.16 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  33.06 
 
 		 485 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.27 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  33.06 
 
 		 489 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.29 
 
 		 426 aa  150  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  32.79 
 
 		 500 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  32.79 
 
 		 483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  32.79 
 
 		 483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  32.79 
 
 		 483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  32.79 
 
 		 483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  33.83 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.53 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  36.84 
 
 		 411 aa  146  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.61 
 
 		 401 aa  144  4e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  30.81 
 
 		 401 aa  143  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.11 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  32.85 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.96 
 
 		 395 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  34.22 
 
 		 944 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.59 
 
 		 419 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.44 
 
 		 408 aa  123  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.36 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4306  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.37 
 
 		 365 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0559  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.55 
 
 		 377 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0708498  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2432  mannose-6-phosphate isomerase  25.4 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.05 
 
 		 419 aa  53.5  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3338  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.77 
 
 		 413 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0557801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4738  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.19 
 
 		 366 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000129483  hitchhiker  0.00000124856 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3294  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.57 
 
 		 394 aa  53.5  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0603  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.17 
 
 		 404 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1747  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  29.95 
 
 		 403 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.41 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4917  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.85 
 
 		 376 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122235  hitchhiker  0.0000000000225976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4653  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.92 
 
 		 365 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00263974  hitchhiker  0.00306786 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4175  phosphomannose isomerase  29.34 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.693379 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1857  hypothetical protein  29.95 
 
 		 367 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0333762  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2991  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.5 
 
 		 438 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0864  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.95 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1151  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.95 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0395  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.95 
 
 		 367 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0305  isomerase  29.95 
 
 		 367 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2128  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.95 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.309196  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  28.24 
 
 		 386 aa  50.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>