124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3388 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3388  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 		 389 aa  811    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.2674 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0560  hypothetical protein  88.4 
 
 		 389 aa  713    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2647  hypothetical protein  66.92 
 
 		 391 aa  561  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0290  N-acylglucosamine 2-epimerase  67.35 
 
 		 395 aa  551  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0118  N-acylglucosamine 2-epimerase  66.32 
 
 		 395 aa  545  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.969015  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4285  putative N-acylglucosamine 2-epimerase  52.7 
 
 		 427 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01231  N-acylglucosamine 2-epimerase  52.44 
 
 		 401 aa  411  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.5 
 
 		 408 aa  409  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0332  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.49 
 
 		 406 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0370198  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2968  N-acylglucosamine 2-epimerase  51.15 
 
 		 426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0149  N-acylglucosamine 2-epimerase  51.44 
 
 		 420 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0424  N-acylglucosamine 2-epimerase  51.16 
 
 		 427 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.441616 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1271  hypothetical protein  51.95 
 
 		 401 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0453  N-acylglucosamine 2-epimerase  50 
 
 		 412 aa  399  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1239  N-acylglucosamine 2-epimerase  51.95 
 
 		 401 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3020  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.87 
 
 		 426 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343521  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2883  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.36 
 
 		 426 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3488  N-acylglucosamine 2-epimerase  51.01 
 
 		 411 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2973  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.87 
 
 		 426 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2993  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.87 
 
 		 426 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6322  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.11 
 
 		 426 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0299  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  50.38 
 
 		 470 aa  388  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1756  N-acylglucosamine 2-epimerase  49.87 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01636  N-acylglucosamine 2-epimerase  50.89 
 
 		 401 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3387  hypothetical protein  50.64 
 
 		 483 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0835382  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0527  N-acylglucosamine 2-epimerase (GlcNAc 2-epimerase) family protein  50.64 
 
 		 485 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491705  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3061  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  50.64 
 
 		 483 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2032  hypothetical protein  50.64 
 
 		 483 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0335  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  50.64 
 
 		 500 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.448131  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0348  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  50.89 
 
 		 489 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2252  N-acylglucosamine 2-epimerase family protein  50.64 
 
 		 483 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  47.84 
 
 		 944 aa  363  3e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5844  N-acylglucosamine 2-epimerase  47.95 
 
 		 398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.742486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2359  N-acylglucosamine 2-epimerase  52.45 
 
 		 343 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2732  N-acylglucosamine 2-epimerase  40.05 
 
 		 403 aa  272  6e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0502  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.86 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2652  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.02 
 
 		 414 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2967  hypothetical protein  32.9 
 
 		 418 aa  189  9e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1773  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.59 
 
 		 419 aa  186  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1277  hypothetical protein  35.03 
 
 		 435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2912  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.82 
 
 		 419 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  35.13 
 
 		 418 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1919  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.01 
 
 		 419 aa  178  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  38.98 
 
 		 408 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2707  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.01 
 
 		 418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3177  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.68 
 
 		 410 aa  150  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0554967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4210  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.97 
 
 		 408 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1736  hypothetical protein  33.61 
 
 		 407 aa  149  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3261  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.75 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522006  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1942  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.33 
 
 		 416 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3491  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.74 
 
 		 425 aa  144  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0507934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4409  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.61 
 
 		 413 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10140  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  32.64 
 
 		 415 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4231  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.35 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1306  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.95 
 
 		 404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5327  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.82 
 
 		 413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.78432 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03765  predicted glucosamine isomerase  27.56 
 
 		 413 aa  135  8e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4106  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.56 
 
 		 413 aa  135  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4403  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.56 
 
 		 413 aa  135  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4265  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.56 
 
 		 413 aa  136  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03714  hypothetical protein  27.56 
 
 		 413 aa  135  8e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3278  hypothetical protein  32.84 
 
 		 414 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198731  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1762  N-acylglucosamine 2-epimerase  34.17 
 
 		 418 aa  135  9e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0295295 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4298  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.82 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4344  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.82 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.395722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4253  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.82 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1014  hypothetical protein  33.15 
 
 		 416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3113  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.84 
 
 		 414 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1052  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.78 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0420922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  29.95 
 
 		 634 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2629  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.77 
 
 		 417 aa  129  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0199  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  30.08 
 
 		 411 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552163  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0269  N-acylglucosamine 2-epimerase  32.86 
 
 		 417 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.475155  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4598  N-acylglucosamine 2-epimerase  33.45 
 
 		 427 aa  123  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00161711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0790  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.68 
 
 		 417 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.942264  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4855  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.14 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331313  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4371  N-acylglucosamine 2-epimerase  28.03 
 
 		 419 aa  111  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.931508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0388  N-acylglucosamine 2-epimerase  29.49 
 
 		 424 aa  106  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4956  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.44 
 
 		 396 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.117097  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4659  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.1 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.44 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1975  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.48 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5652  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.69 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.9 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2630  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.11 
 
 		 417 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.680867  normal  0.436823 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3983  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.45 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.82 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1947  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.37 
 
 		 393 aa  69.3  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.904714  normal  0.0967574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3567  N-acylglucosamine 2-epimerase  30.83 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4916  mannose-6-phosphate isomerase  26 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  25 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3476  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.38 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2987  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.94 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.700011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6381  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.94 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0652  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.69 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.33 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3251  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.09 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.947715  decreased coverage  0.0046378 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3002  N-acylglucosamine 2-epimerase  20.87 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3549  mannose-6-phosphate isomerase  24.66 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5399  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.02 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0761169 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>