12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1928 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0358  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  52.3 
 
 
668 aa  677    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0710047  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1904  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  100 
 
 
660 aa  1384    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1928  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  100 
 
 
660 aa  1384    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4714  hypothetical protein  41.01 
 
 
732 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.823146 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2861  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  38 
 
 
620 aa  372  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5018  hypothetical protein  36.39 
 
 
606 aa  353  5e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0816  hypothetical protein  35 
 
 
719 aa  328  2.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0362395  hitchhiker  0.000117327 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5878  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  65 
 
 
203 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000504158 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.81 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2742  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.55 
 
 
434 aa  53.9  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00284359 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2309  N-acylglucosamine 2-epimerase  22.51 
 
 
403 aa  50.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0674246  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1366  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.25 
 
 
393 aa  45.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>