16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3354 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3354  N-acylglucosamine 2-epimerase  100 
 
 
419 aa  820    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5333  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.64 
 
 
401 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0669473  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2987  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.74 
 
 
400 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.700011  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2066  N-acylglucosamine 2-epimerase  23.87 
 
 
389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000010406  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3784  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.54 
 
 
392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.039561  normal  0.0465307 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3251  N-acylglucosamine 2-epimerase  25.06 
 
 
403 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.947715  decreased coverage  0.0046378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1977  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.45 
 
 
391 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057308  normal  0.460832 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2630  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.78 
 
 
417 aa  123  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.680867  normal  0.436823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3567  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.31 
 
 
392 aa  120  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1366  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.14 
 
 
393 aa  106  9e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1947  N-acylglucosamine 2-epimerase  24.63 
 
 
393 aa  89.7  9e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.904714  normal  0.0967574 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1778  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.63 
 
 
408 aa  50.4  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212898  normal  0.77071 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5917  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase-like protein  26.45 
 
 
415 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0887  N-acylglucosamine 2-epimerase  27.44 
 
 
416 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2439  N-acylglucosamine 2-epimerase  31.48 
 
 
412 aa  43.5  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.560128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2936  N-acylglucosamine 2-epimerase  26.09 
 
 
418 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>