283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1146 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1146  nitroreductase  100 
 
 
157 aa  310  6.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.814573  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  35.03 
 
 
170 aa  93.6  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  31.68 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  38.1 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  31.29 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  32.7 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  34.18 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  29.81 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  36.99 
 
 
169 aa  73.9  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  32.7 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  30.13 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  30.38 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4023  nitroreductase  33.33 
 
 
202 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  31.21 
 
 
197 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  31.17 
 
 
178 aa  70.9  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  30.97 
 
 
194 aa  70.9  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  29.94 
 
 
168 aa  70.5  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  32.7 
 
 
166 aa  70.5  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  31.61 
 
 
194 aa  70.5  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  36.99 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  36.99 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  26.71 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  31.17 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  29.19 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  34.87 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  29.19 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  30.54 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  29.19 
 
 
173 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  33.14 
 
 
186 aa  67.4  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  30.94 
 
 
169 aa  67.4  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  30.54 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  33.54 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  26.45 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  31.45 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  27.33 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  30.43 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  28.08 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  26.83 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  33.8 
 
 
167 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  31.69 
 
 
175 aa  64.3  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  29.03 
 
 
180 aa  63.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  34.13 
 
 
196 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  31.21 
 
 
175 aa  62.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  24.68 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  33.33 
 
 
169 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  31.58 
 
 
167 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  24.86 
 
 
204 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  29.41 
 
 
171 aa  61.2  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  29.81 
 
 
170 aa  60.8  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  25.48 
 
 
166 aa  60.5  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  34.84 
 
 
274 aa  60.5  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  30.83 
 
 
187 aa  60.5  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  28.47 
 
 
174 aa  60.5  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  27.92 
 
 
169 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  28.3 
 
 
163 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  30.19 
 
 
171 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  27.92 
 
 
181 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  27.92 
 
 
181 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0353  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.24 
 
 
212 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261778  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.59 
 
 
186 aa  58.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  27.85 
 
 
171 aa  58.2  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  26.62 
 
 
167 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  27.78 
 
 
180 aa  57.4  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  33.95 
 
 
174 aa  57.4  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  27.63 
 
 
170 aa  57.4  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  29.45 
 
 
179 aa  57  0.00000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  31.01 
 
 
175 aa  57  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  31.11 
 
 
192 aa  57  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  29.03 
 
 
173 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  32.89 
 
 
274 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  26.83 
 
 
176 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  25.33 
 
 
178 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  30.43 
 
 
278 aa  56.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  32.43 
 
 
288 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  26.52 
 
 
200 aa  55.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  30.46 
 
 
176 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  27.04 
 
 
213 aa  54.7  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  29.41 
 
 
182 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  25.5 
 
 
170 aa  54.3  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  23.31 
 
 
183 aa  53.5  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  28.75 
 
 
240 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  28.57 
 
 
176 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  29.48 
 
 
188 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  36 
 
 
199 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  28.74 
 
 
246 aa  53.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  22.08 
 
 
177 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0992  hypothetical protein  28.86 
 
 
175 aa  52.4  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.911499 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  25.58 
 
 
202 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  23.49 
 
 
246 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1013  nitroreductase family protein  26.98 
 
 
214 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  31.06 
 
 
190 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2909  nitroreductase  27.01 
 
 
206 aa  52  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  27.6 
 
 
239 aa  52  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  26.32 
 
 
172 aa  51.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7192  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.55 
 
 
228 aa  51.6  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  29.14 
 
 
211 aa  50.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  27.04 
 
 
169 aa  50.4  0.000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  29.08 
 
 
181 aa  50.4  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  33.57 
 
 
169 aa  50.8  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  27.38 
 
 
201 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>