More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0821 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3685  elongation factor 1-alpha  74.11 
 
 
422 aa  661    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.222951 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1441  elongation factor 1-alpha  68.65 
 
 
425 aa  639    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.891927  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1592  elongation factor 1-alpha  72.64 
 
 
425 aa  642    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1170  elongation factor 1-alpha  74.53 
 
 
422 aa  656    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1553  elongation factor 1-alpha  71.93 
 
 
426 aa  668    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0699  elongation factor 1-alpha  72.17 
 
 
425 aa  664    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.085121 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0073  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  71.73 
 
 
424 aa  647    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000421656  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0730  elongation factor 1-alpha  75 
 
 
425 aa  677    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425571  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0821  elongation factor 1-alpha  100 
 
 
424 aa  876    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0156  elongation factor 1-alpha  65.8 
 
 
421 aa  605  9.999999999999999e-173  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3066  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  67.07 
 
 
420 aa  597  1e-170  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3261  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  65.33 
 
 
423 aa  597  1e-169  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664199  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0680  elongation factor 1-alpha  65.65 
 
 
428 aa  596  1e-169  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0811  elongation factor 1-alpha  64.39 
 
 
423 aa  593  1e-168  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2516  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  65.07 
 
 
420 aa  593  1e-168  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0208  elongation factor 1-alpha  64.95 
 
 
428 aa  593  1e-168  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371461  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1303  elongation factor 1-alpha  65.19 
 
 
428 aa  593  1e-168  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0615  elongation factor 1-alpha  65.19 
 
 
428 aa  594  1e-168  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0497  elongation factor 1-alpha  65.31 
 
 
420 aa  588  1e-167  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0782  elongation factor 1-alpha  65.19 
 
 
428 aa  590  1e-167  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0647  elongation factor 1-alpha  60.61 
 
 
433 aa  553  1e-156  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000513743  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1196  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  58.92 
 
 
435 aa  539  9.999999999999999e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0041  elongation factor 1-alpha  57.28 
 
 
435 aa  538  9.999999999999999e-153  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000171412  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1034  elongation factor 1-alpha  56.51 
 
 
432 aa  525  1e-148  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0397  elongation factor 1-alpha  56.88 
 
 
444 aa  507  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209425  normal  0.0958678 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1111  elongation factor 1-alpha  56.64 
 
 
444 aa  502  1e-141  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1731  elongation factor 1-alpha  55.94 
 
 
444 aa  503  1e-141  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222772 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1362  elongation factor 1-alpha  56.18 
 
 
444 aa  501  1e-140  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.91449  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1745  elongation factor 1-alpha  54.31 
 
 
444 aa  498  1e-140  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65303  Elongation factor 1-alpha (EF-1-alpha)  50.11 
 
 
458 aa  472  1e-132  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.977722  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77514  translational elongation factor EF-1 alpha  50.11 
 
 
458 aa  472  1e-132  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28737  predicted protein  51.76 
 
 
439 aa  474  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723788  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18475  translation elongation factor, EF-1, alpha subunit  51.76 
 
 
439 aa  473  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00280729  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04218  elongation factor 1-alpha (Broad)  50.11 
 
 
468 aa  463  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300924  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01300  translation elongation factor EF1-alpha, putative  50.11 
 
 
459 aa  462  1e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29711  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  39.74 
 
 
467 aa  334  2e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105785  hitchhiker  0.00273357 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27198  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  39.74 
 
 
467 aa  334  2e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00593045 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27060  Eukaryotic elongation factor 1 alpha  39.74 
 
 
467 aa  334  2e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293222  hitchhiker  0.0000941001 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83594  elongation release factor  36.47 
 
 
707 aa  291  2e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.432493  normal  0.18618 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01540  translation release factor, putative  34.64 
 
 
757 aa  281  2e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02080  translation release factor eRF3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04820)  35.84 
 
 
708 aa  277  3e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02063  translation elongation factor EF-1 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04630)  36 
 
 
576 aa  272  7e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6984  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  36.52 
 
 
636 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14961  predicted protein  34.16 
 
 
406 aa  268  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000165599  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1718  elongation factor Tu GTP binding domain-containing protein  36.88 
 
 
516 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36881  predicted protein  36.41 
 
 
481 aa  263  4e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416405  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04740  conserved hypothetical protein  36.07 
 
 
914 aa  263  4.999999999999999e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.810548  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34493  predicted protein  34.6 
 
 
447 aa  259  6e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6447  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.98 
 
 
601 aa  253  7e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.832867  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.9 
 
 
639 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3564  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.48 
 
 
641 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1042  adenylylsulfate kinase  33.41 
 
 
642 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1290  elongation factor Tu  36.89 
 
 
400 aa  241  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000272484  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1153  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.25 
 
 
642 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1396  elongation factor Tu  36.89 
 
 
400 aa  241  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.147055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4111  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.82 
 
 
598 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1400  sulfate adenylyltransferase, large subunit  37.25 
 
 
645 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0824  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.03 
 
 
636 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.533102  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2623  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.05 
 
 
470 aa  239  9e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0651162  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3828  sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.45 
 
 
615 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  37.04 
 
 
400 aa  238  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2764  adenylylsulfate kinase  31.78 
 
 
641 aa  238  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4017  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.81 
 
 
639 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897015  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  36.95 
 
 
396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  36.95 
 
 
396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  35.5 
 
 
400 aa  233  3e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1194  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33 
 
 
564 aa  231  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2537  adenylylsulfate kinase / sulfate adenylyltransferase subunit 1  33.02 
 
 
599 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23641  elongation factor Tu  36.21 
 
 
399 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1140  elongation factor Tu  35.27 
 
 
400 aa  229  6e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000019246  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0263  elongation factor Tu  35.03 
 
 
405 aa  228  1e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516793  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  36.6 
 
 
400 aa  228  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0250  elongation factor Tu  35.03 
 
 
405 aa  228  1e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  36.6 
 
 
400 aa  228  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19491  elongation factor Tu  36.98 
 
 
399 aa  227  4e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  36.18 
 
 
395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  35.81 
 
 
399 aa  226  8e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0792  elongation factor Tu  34.73 
 
 
399 aa  225  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.640379  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  36.21 
 
 
396 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  35.51 
 
 
395 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  36.21 
 
 
396 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  35.35 
 
 
397 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1074  elongation factor Tu  36.51 
 
 
399 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  36.21 
 
 
396 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  36.21 
 
 
396 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1672  elongation factor Tu  33.8 
 
 
399 aa  224  3e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000990168  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16311  elongation factor Tu  36.49 
 
 
399 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  35.8 
 
 
405 aa  223  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  35.8 
 
 
405 aa  223  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2022  elongation factor Tu  35.73 
 
 
399 aa  223  4.9999999999999996e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.466852  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17111  elongation factor Tu  36.49 
 
 
399 aa  223  6e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1600  elongation factor Tu  36.57 
 
 
399 aa  223  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  35.81 
 
 
397 aa  223  6e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  34.8 
 
 
396 aa  223  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  34.66 
 
 
397 aa  222  8e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  36.13 
 
 
396 aa  222  8e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  36.13 
 
 
396 aa  222  8e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  34.66 
 
 
397 aa  222  8e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0560  translation elongation factor Tu  37.06 
 
 
397 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1629  protein synthesis factor GTP-binding  34.46 
 
 
408 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.418105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>