More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_27060 on replicon NC_009367
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009367  OSTLU_27198  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  100 
 
 
467 aa  967    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00593045 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29711  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  100 
 
 
467 aa  967    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105785  hitchhiker  0.00273357 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27060  Eukaryotic elongation factor 1 alpha  100 
 
 
467 aa  967    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293222  hitchhiker  0.0000941001 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0073  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  40.04 
 
 
424 aa  349  7e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000421656  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65303  Elongation factor 1-alpha (EF-1-alpha)  42.46 
 
 
458 aa  347  2e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.977722  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77514  translational elongation factor EF-1 alpha  42.46 
 
 
458 aa  347  2e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18475  translation elongation factor, EF-1, alpha subunit  41.09 
 
 
439 aa  338  9.999999999999999e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00280729  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28737  predicted protein  40.87 
 
 
439 aa  335  9e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723788  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04218  elongation factor 1-alpha (Broad)  41.06 
 
 
468 aa  330  3e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300924  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01300  translation elongation factor EF1-alpha, putative  40.73 
 
 
459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1441  elongation factor 1-alpha  38.54 
 
 
425 aa  323  3e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.891927  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1553  elongation factor 1-alpha  38.46 
 
 
426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0821  elongation factor 1-alpha  38.65 
 
 
424 aa  319  6e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1196  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  38.48 
 
 
435 aa  318  1e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0811  elongation factor 1-alpha  38.06 
 
 
423 aa  317  4e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0156  elongation factor 1-alpha  38.65 
 
 
421 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0647  elongation factor 1-alpha  37.63 
 
 
433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000513743  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0730  elongation factor 1-alpha  38.86 
 
 
425 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425571  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3066  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  37.83 
 
 
420 aa  314  2.9999999999999996e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0041  elongation factor 1-alpha  37.72 
 
 
435 aa  312  7.999999999999999e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000171412  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1170  elongation factor 1-alpha  39.18 
 
 
422 aa  311  1e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0615  elongation factor 1-alpha  38.63 
 
 
428 aa  311  2e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1592  elongation factor 1-alpha  38.86 
 
 
425 aa  310  4e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1745  elongation factor 1-alpha  38.91 
 
 
444 aa  310  4e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2516  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  37.42 
 
 
420 aa  310  5e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0208  elongation factor 1-alpha  38.63 
 
 
428 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371461  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3261  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  36.7 
 
 
423 aa  309  8e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664199  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0680  elongation factor 1-alpha  37.98 
 
 
428 aa  309  9e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1303  elongation factor 1-alpha  38.41 
 
 
428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0497  elongation factor 1-alpha  37.72 
 
 
420 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0699  elongation factor 1-alpha  35.68 
 
 
425 aa  306  7e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.085121 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1362  elongation factor 1-alpha  38.26 
 
 
444 aa  305  9.000000000000001e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.91449  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0782  elongation factor 1-alpha  39.14 
 
 
428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1731  elongation factor 1-alpha  38.26 
 
 
444 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222772 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0397  elongation factor 1-alpha  37.61 
 
 
444 aa  302  1e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209425  normal  0.0958678 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3685  elongation factor 1-alpha  37.12 
 
 
422 aa  301  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.222951 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1111  elongation factor 1-alpha  37.61 
 
 
444 aa  300  4e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1034  elongation factor 1-alpha  36.62 
 
 
432 aa  290  3e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83594  elongation release factor  30.67 
 
 
707 aa  215  9.999999999999999e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.432493  normal  0.18618 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01540  translation release factor, putative  31.24 
 
 
757 aa  212  1e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1194  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.07 
 
 
564 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04740  conserved hypothetical protein  34.75 
 
 
914 aa  204  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.810548  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34493  predicted protein  30.13 
 
 
447 aa  202  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02063  translation elongation factor EF-1 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04630)  32.71 
 
 
576 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1559  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.37 
 
 
599 aa  193  7e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909063  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.67 
 
 
639 aa  191  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1718  elongation factor Tu GTP binding domain-containing protein  32.13 
 
 
516 aa  189  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3828  sulfate adenylyltransferase, large subunit  29.74 
 
 
615 aa  186  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2537  adenylylsulfate kinase / sulfate adenylyltransferase subunit 1  29.41 
 
 
599 aa  186  7e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02080  translation release factor eRF3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04820)  28.51 
 
 
708 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4111  sulfate adenylyltransferase, large subunit  29 
 
 
598 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1400  sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.33 
 
 
645 aa  180  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6447  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.98 
 
 
601 aa  180  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.832867  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2764  adenylylsulfate kinase  31.44 
 
 
641 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48738  predicted protein  30.16 
 
 
581 aa  174  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.655952 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6984  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  31.25 
 
 
636 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3564  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.58 
 
 
641 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14961  predicted protein  28.25 
 
 
406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000165599  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4017  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.2 
 
 
639 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897015  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1042  adenylylsulfate kinase  30.09 
 
 
642 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36881  predicted protein  31.99 
 
 
481 aa  169  9e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416405  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0250  elongation factor Tu  31.37 
 
 
405 aa  168  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0263  elongation factor Tu  31.37 
 
 
405 aa  168  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516793  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18760  sulfate adenylyltransferase subunit 1  28.04 
 
 
421 aa  168  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.97603  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1296  sulfate adenylyltransferase large subunit  28.78 
 
 
421 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2623  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.37 
 
 
470 aa  167  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0651162  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0158  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.35 
 
 
470 aa  167  5e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0740316  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0824  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.94 
 
 
636 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.533102  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1153  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.67 
 
 
642 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3978  sulfate adenylyltransferase, large subunit  29.7 
 
 
422 aa  163  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2735  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.55 
 
 
552 aa  163  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0420  sulfate adenylyltransferase subunit 1  28.88 
 
 
422 aa  162  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2617  sulfate adenylyltransferase, large subunit  26.97 
 
 
445 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0738  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.71 
 
 
435 aa  160  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20107  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1674  sulfate adenylyltransferase subunit 1  26.26 
 
 
432 aa  160  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.313363  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65888  mitochondrial translation elongation factor TU  31.33 
 
 
430 aa  159  7e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.77122  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0327  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  27.17 
 
 
631 aa  159  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.171522 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0421  sulfate adenylyltransferase subunit 1  27.45 
 
 
478 aa  159  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0794  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.71 
 
 
435 aa  159  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2628  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  26.94 
 
 
549 aa  158  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3126  Sulfate adenylyltransferase., Adenylyl-sulfate kinase  32.19 
 
 
626 aa  158  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2352  sulfate adenylyltransferase, large subunit  26.29 
 
 
551 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.924472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5014  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.14 
 
 
632 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.688954  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57710  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.14 
 
 
633 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1687  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  26.16 
 
 
638 aa  156  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1865  sulfate adenylyltransferase, large subunit  26.12 
 
 
551 aa  156  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4422  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  26.75 
 
 
618 aa  156  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2552  sulfate adenylyltransferase subunit 1  26.16 
 
 
474 aa  156  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2143  sulfate adenylate transferase, subunit 1  27.35 
 
 
466 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.43414  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3042  sulfate adenylyltransferase subunit 1  27.56 
 
 
480 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4126  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  29.8 
 
 
632 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1491  sulfate adenylyltransferase, large subunit  25.44 
 
 
412 aa  155  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0878  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.95 
 
 
632 aa  154  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.844643 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1687  sulfate adenylyltransferase, large subunit  26.74 
 
 
469 aa  154  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  29.4 
 
 
400 aa  154  5e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3933  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.11 
 
 
559 aa  153  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1342  sulfate adenylyltransferase subunit 1  28.17 
 
 
414 aa  153  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0489751  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4208  sulfate adenylyltransferase subunit 1  27.23 
 
 
432 aa  153  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4545  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  29.23 
 
 
633 aa  153  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2960  Sulfate adenylyltransferase  26.8 
 
 
473 aa  153  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.938148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>