More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1170 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1553  elongation factor 1-alpha  75.95 
 
 		 426 aa  695    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3685  elongation factor 1-alpha  82.86 
 
 		 422 aa  719    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.222951 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1592  elongation factor 1-alpha  75.95 
 
 		 425 aa  662    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1170  elongation factor 1-alpha  100 
 
 		 422 aa  877    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0699  elongation factor 1-alpha  74.58 
 
 		 425 aa  685    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.085121 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0730  elongation factor 1-alpha  76.01 
 
 		 425 aa  680    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425571  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0821  elongation factor 1-alpha  74.53 
 
 		 424 aa  656    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1441  elongation factor 1-alpha  70.55 
 
 		 425 aa  655    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.891927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0156  elongation factor 1-alpha  67.46 
 
 		 421 aa  627  1e-178  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0811  elongation factor 1-alpha  67.86 
 
 		 423 aa  622  1e-177  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3066  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  68.17 
 
 		 420 aa  620  1e-176  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2516  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  67.55 
 
 		 420 aa  613  9.999999999999999e-175  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3261  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  66.67 
 
 		 423 aa  607  9.999999999999999e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664199  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0073  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  66.51 
 
 		 424 aa  603  1.0000000000000001e-171  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000421656  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0497  elongation factor 1-alpha  66.27 
 
 		 420 aa  599  1e-170  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0615  elongation factor 1-alpha  63.83 
 
 		 428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0208  elongation factor 1-alpha  64.07 
 
 		 428 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371461  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1303  elongation factor 1-alpha  63.59 
 
 		 428 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0782  elongation factor 1-alpha  62.65 
 
 		 428 aa  565  1e-160  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0680  elongation factor 1-alpha  63.03 
 
 		 428 aa  567  1e-160  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0647  elongation factor 1-alpha  57.18 
 
 		 433 aa  528  1e-148  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000513743  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1034  elongation factor 1-alpha  54.78 
 
 		 432 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1196  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  54.76 
 
 		 435 aa  507  9.999999999999999e-143  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0041  elongation factor 1-alpha  53.83 
 
 		 435 aa  502  1e-141  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000171412  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1731  elongation factor 1-alpha  54.98 
 
 		 444 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00222772 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0397  elongation factor 1-alpha  54.27 
 
 		 444 aa  491  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209425  normal  0.0958678 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1111  elongation factor 1-alpha  54.74 
 
 		 444 aa  490  1e-137  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1362  elongation factor 1-alpha  54.03 
 
 		 444 aa  486  1e-136  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.91449  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1745  elongation factor 1-alpha  51.88 
 
 		 444 aa  481  1e-134  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65303  Elongation factor 1-alpha (EF-1-alpha)  50.46 
 
 		 458 aa  472  1e-132  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.977722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77514  translational elongation factor EF-1 alpha  50.46 
 
 		 458 aa  472  1e-132  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18475  translation elongation factor, EF-1, alpha subunit  52.13 
 
 		 439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00280729  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28737  predicted protein  51.9 
 
 		 439 aa  466  9.999999999999999e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723788  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04218  elongation factor 1-alpha (Broad)  49.1 
 
 		 468 aa  456  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300924  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01300  translation elongation factor EF1-alpha, putative  49.31 
 
 		 459 aa  455  1e-127  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27060  Eukaryotic elongation factor 1 alpha  39.18 
 
 		 467 aa  327  3e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293222  hitchhiker  0.0000941001 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29711  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  39.18 
 
 		 467 aa  327  3e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105785  hitchhiker  0.00273357 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27198  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  39.18 
 
 		 467 aa  327  3e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00593045 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83594  elongation release factor  34.83 
 
 		 707 aa  284  2.0000000000000002e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.432493  normal  0.18618 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01540  translation release factor, putative  35.03 
 
 		 757 aa  277  2e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02080  translation release factor eRF3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04820)  35.09 
 
 		 708 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02063  translation elongation factor EF-1 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04630)  38.15 
 
 		 576 aa  274  3e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04740  conserved hypothetical protein  37.13 
 
 		 914 aa  268  1e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.810548  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14961  predicted protein  35.26 
 
 		 406 aa  268  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000165599  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34493  predicted protein  35.28 
 
 		 447 aa  265  1e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6984  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  35.29 
 
 		 636 aa  263  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36881  predicted protein  36.47 
 
 		 481 aa  261  1e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416405  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1042  adenylylsulfate kinase  35.71 
 
 		 642 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1194  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.8 
 
 		 564 aa  259  7e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0824  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.87 
 
 		 636 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.533102  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1718  elongation factor Tu GTP binding domain-containing protein  35.07 
 
 		 516 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3564  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.65 
 
 		 641 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.98 
 
 		 639 aa  250  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1153  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.29 
 
 		 642 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4017  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.97 
 
 		 639 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897015  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2764  adenylylsulfate kinase  33.17 
 
 		 641 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1629  protein synthesis factor GTP-binding  36.54 
 
 		 408 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.418105  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1400  sulfate adenylyltransferase, large subunit  36.49 
 
 		 645 aa  239  6.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6447  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.5 
 
 		 601 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.832867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4111  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.93 
 
 		 598 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2586  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.5 
 
 		 614 aa  233  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2971  sulfate adenylate transferase, large subunit/adenylylsulfate kinase  33.41 
 
 		 604 aa  233  6e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  35.27 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2623  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.25 
 
 		 470 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0651162  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2537  adenylylsulfate kinase / sulfate adenylyltransferase subunit 1  33.18 
 
 		 599 aa  229  6e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  33.95 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3828  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.25 
 
 		 615 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1396  elongation factor Tu  33.8 
 
 		 400 aa  226  6e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.147055  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1290  elongation factor Tu  33.8 
 
 		 400 aa  226  6e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000272484  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  35.63 
 
 		 395 aa  226  6e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3456  elongation factor Tu  34.68 
 
 		 395 aa  226  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0019954  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3253  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  32.31 
 
 		 644 aa  224  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438405  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  34.44 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23641  elongation factor Tu  34.34 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16311  elongation factor Tu  35.03 
 
 		 399 aa  223  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  33.96 
 
 		 399 aa  223  6e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19491  elongation factor Tu  34.73 
 
 		 399 aa  222  9e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  33.95 
 
 		 397 aa  222  9e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  33.95 
 
 		 397 aa  222  9e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3933  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.17 
 
 		 619 aa  222  9e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  34.11 
 
 		 396 aa  222  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  33.96 
 
 		 399 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1559  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.46 
 
 		 599 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909063  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  34.11 
 
 		 396 aa  222  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0792  elongation factor Tu  33.72 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.640379  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1530  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  33.57 
 
 		 651 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861038  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  34.03 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0611  elongation factor Tu  35.58 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.016281  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1247  elongation factor Tu  36.45 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.727206  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2450  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  31.16 
 
 		 631 aa  221  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16991  elongation factor Tu  34.8 
 
 		 399 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3918  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.17 
 
 		 619 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.720978  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3992  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.17 
 
 		 619 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.610707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0250  elongation factor Tu  33.33 
 
 		 405 aa  220  3.9999999999999997e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1074  elongation factor Tu  34.27 
 
 		 399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0345  elongation factor Tu  35.63 
 
 		 399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000030513  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  33.88 
 
 		 395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17111  elongation factor Tu  34.95 
 
 		 399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0263  elongation factor Tu  33.33 
 
 		 405 aa  220  3.9999999999999997e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516793  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  33.97 
 
 		 399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>