More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1441 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0699  elongation factor 1-alpha  76.71 
 
 		 425 aa  699    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.085121 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1553  elongation factor 1-alpha  73.82 
 
 		 426 aa  682    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1441  elongation factor 1-alpha  100 
 
 		 425 aa  879    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.891927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1592  elongation factor 1-alpha  72.47 
 
 		 425 aa  643    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1170  elongation factor 1-alpha  70.55 
 
 		 422 aa  638    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0730  elongation factor 1-alpha  74.35 
 
 		 425 aa  667    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3685  elongation factor 1-alpha  69.43 
 
 		 422 aa  625  1e-178  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.222951 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0821  elongation factor 1-alpha  68.65 
 
 		 424 aa  622  1e-177  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0073  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  65.49 
 
 		 424 aa  604  9.999999999999999e-173  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000421656  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0156  elongation factor 1-alpha  63.88 
 
 		 421 aa  593  1e-168  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3066  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  63.7 
 
 		 420 aa  589  1e-167  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2516  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  63.7 
 
 		 420 aa  588  1e-167  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0811  elongation factor 1-alpha  61.47 
 
 		 423 aa  581  1.0000000000000001e-165  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0782  elongation factor 1-alpha  63.7 
 
 		 428 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0615  elongation factor 1-alpha  63.7 
 
 		 428 aa  578  1e-164  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0208  elongation factor 1-alpha  63.93 
 
 		 428 aa  579  1e-164  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371461  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3261  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  61.14 
 
 		 423 aa  580  1e-164  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664199  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1303  elongation factor 1-alpha  63.93 
 
 		 428 aa  580  1e-164  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0497  elongation factor 1-alpha  62.74 
 
 		 420 aa  575  1.0000000000000001e-163  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0680  elongation factor 1-alpha  62.53 
 
 		 428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0647  elongation factor 1-alpha  58.18 
 
 		 433 aa  532  1e-150  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000513743  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1034  elongation factor 1-alpha  57.88 
 
 		 432 aa  525  1e-148  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1196  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  55.74 
 
 		 435 aa  503  1e-141  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0397  elongation factor 1-alpha  54.52 
 
 		 444 aa  503  1e-141  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209425  normal  0.0958678 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1111  elongation factor 1-alpha  54.29 
 
 		 444 aa  499  1e-140  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1731  elongation factor 1-alpha  54.06 
 
 		 444 aa  500  1e-140  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00222772 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0041  elongation factor 1-alpha  53.83 
 
 		 435 aa  496  1e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000171412  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65303  Elongation factor 1-alpha (EF-1-alpha)  52.95 
 
 		 458 aa  495  1e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.977722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1362  elongation factor 1-alpha  54.06 
 
 		 444 aa  497  1e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.91449  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77514  translational elongation factor EF-1 alpha  52.95 
 
 		 458 aa  495  1e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1745  elongation factor 1-alpha  53.76 
 
 		 444 aa  493  9.999999999999999e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01300  translation elongation factor EF1-alpha, putative  53.08 
 
 		 459 aa  491  1e-137  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18475  translation elongation factor, EF-1, alpha subunit  53.05 
 
 		 439 aa  485  1e-136  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00280729  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28737  predicted protein  52.82 
 
 		 439 aa  483  1e-135  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723788  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04218  elongation factor 1-alpha (Broad)  51.58 
 
 		 468 aa  480  1e-134  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300924  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29711  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  38.54 
 
 		 467 aa  323  2e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105785  hitchhiker  0.00273357 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27060  Eukaryotic elongation factor 1 alpha  38.54 
 
 		 467 aa  323  2e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293222  hitchhiker  0.0000941001 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27198  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  38.54 
 
 		 467 aa  323  2e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00593045 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83594  elongation release factor  36.38 
 
 		 707 aa  290  3e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.432493  normal  0.18618 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04740  conserved hypothetical protein  35.86 
 
 		 914 aa  282  1e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.810548  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01540  translation release factor, putative  35.29 
 
 		 757 aa  276  6e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02063  translation elongation factor EF-1 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04630)  38.15 
 
 		 576 aa  268  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02080  translation release factor eRF3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04820)  33.94 
 
 		 708 aa  263  4.999999999999999e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1718  elongation factor Tu GTP binding domain-containing protein  34.6 
 
 		 516 aa  262  8e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1194  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.77 
 
 		 564 aa  261  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34493  predicted protein  33.18 
 
 		 447 aa  260  3e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.36 
 
 		 639 aa  259  8e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1042  adenylylsulfate kinase  34.99 
 
 		 642 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1153  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.99 
 
 		 642 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14961  predicted protein  33.99 
 
 		 406 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000165599  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3564  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.57 
 
 		 641 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0824  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.74 
 
 		 636 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.533102  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36881  predicted protein  34.56 
 
 		 481 aa  250  3e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1629  protein synthesis factor GTP-binding  35.42 
 
 		 408 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.418105  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2764  adenylylsulfate kinase  32.86 
 
 		 641 aa  246  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4017  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.29 
 
 		 639 aa  245  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897015  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6984  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  33.33 
 
 		 636 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6447  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.01 
 
 		 601 aa  244  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.832867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2623  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.21 
 
 		 470 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0651162  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1400  sulfate adenylyltransferase, large subunit  36.06 
 
 		 645 aa  239  8e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1559  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.36 
 
 		 599 aa  238  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909063  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3828  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.57 
 
 		 615 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2537  adenylylsulfate kinase / sulfate adenylyltransferase subunit 1  32.56 
 
 		 599 aa  231  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  36.68 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0250  elongation factor Tu  36.13 
 
 		 405 aa  227  4e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0263  elongation factor Tu  36.13 
 
 		 405 aa  227  4e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516793  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  35.98 
 
 		 396 aa  226  8e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  35.98 
 
 		 396 aa  226  8e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  35.83 
 
 		 399 aa  226  9e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2971  sulfate adenylate transferase, large subunit/adenylylsulfate kinase  32.2 
 
 		 604 aa  225  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2586  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.2 
 
 		 614 aa  225  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4111  sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.55 
 
 		 598 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  36.36 
 
 		 395 aa  223  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48738  predicted protein  33.48 
 
 		 581 aa  223  4.9999999999999996e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.655952 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  34.89 
 
 		 400 aa  223  6e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2979  elongation factor Tu  35.2 
 
 		 396 aa  223  7e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.990994  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3933  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.94 
 
 		 619 aa  222  8e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  35.88 
 
 		 397 aa  222  9e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2692  elongation factor Tu  35.2 
 
 		 396 aa  222  9e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  35.88 
 
 		 397 aa  222  9e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1247  elongation factor Tu  34.82 
 
 		 396 aa  222  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.727206  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23641  elongation factor Tu  34.51 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  35.88 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3918  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.94 
 
 		 619 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.720978  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3992  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.94 
 
 		 619 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.610707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65888  mitochondrial translation elongation factor TU  35.66 
 
 		 430 aa  220  3e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.77122  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  36.26 
 
 		 397 aa  221  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17111  elongation factor Tu  35.36 
 
 		 399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  35.66 
 
 		 396 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  35.66 
 
 		 396 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  35.9 
 
 		 400 aa  220  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  35.66 
 
 		 396 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  35.66 
 
 		 396 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  35.32 
 
 		 399 aa  219  6e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1672  elongation factor Tu  35.46 
 
 		 399 aa  219  6e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000990168  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1600  elongation factor Tu  35.13 
 
 		 399 aa  219  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  34.76 
 
 		 396 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  34.76 
 
 		 396 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16991  elongation factor Tu  35.13 
 
 		 399 aa  219  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  34.74 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>