More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0699 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0730  elongation factor 1-alpha  82.12 
 
 		 425 aa  726    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425571  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0699  elongation factor 1-alpha  100 
 
 		 425 aa  876    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.085121 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3685  elongation factor 1-alpha  72.99 
 
 		 422 aa  647    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.222951 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1592  elongation factor 1-alpha  77.41 
 
 		 425 aa  692    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1170  elongation factor 1-alpha  74.58 
 
 		 422 aa  664    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1553  elongation factor 1-alpha  87.03 
 
 		 426 aa  786    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1441  elongation factor 1-alpha  76.71 
 
 		 425 aa  699    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.891927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0821  elongation factor 1-alpha  72.17 
 
 		 424 aa  644    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0073  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  66.9 
 
 		 424 aa  610  1e-173  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000421656  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0156  elongation factor 1-alpha  64.52 
 
 		 421 aa  600  1e-170  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0615  elongation factor 1-alpha  64.87 
 
 		 428 aa  585  1e-166  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0680  elongation factor 1-alpha  64.17 
 
 		 428 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1303  elongation factor 1-alpha  64.87 
 
 		 428 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0811  elongation factor 1-alpha  61.94 
 
 		 423 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0208  elongation factor 1-alpha  64.64 
 
 		 428 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371461  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3066  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  63.7 
 
 		 420 aa  583  1.0000000000000001e-165  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2516  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  64.18 
 
 		 420 aa  582  1.0000000000000001e-165  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0782  elongation factor 1-alpha  63.23 
 
 		 428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0497  elongation factor 1-alpha  63.22 
 
 		 420 aa  575  1.0000000000000001e-163  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3261  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  61.37 
 
 		 423 aa  573  1.0000000000000001e-162  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664199  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0647  elongation factor 1-alpha  56.78 
 
 		 433 aa  530  1e-149  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000513743  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1111  elongation factor 1-alpha  54.52 
 
 		 444 aa  506  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0397  elongation factor 1-alpha  54.29 
 
 		 444 aa  505  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209425  normal  0.0958678 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1731  elongation factor 1-alpha  54.52 
 
 		 444 aa  504  1e-141  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00222772 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1034  elongation factor 1-alpha  54.82 
 
 		 432 aa  498  1e-140  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77514  translational elongation factor EF-1 alpha  53.86 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65303  Elongation factor 1-alpha (EF-1-alpha)  53.86 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.977722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1362  elongation factor 1-alpha  53.83 
 
 		 444 aa  496  1e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.91449  normal  0.0102191 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1196  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  53.36 
 
 		 435 aa  493  9.999999999999999e-139  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1745  elongation factor 1-alpha  53.49 
 
 		 444 aa  494  9.999999999999999e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0041  elongation factor 1-alpha  52.44 
 
 		 435 aa  487  1e-136  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000171412  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01300  translation elongation factor EF1-alpha, putative  53.1 
 
 		 459 aa  484  1e-135  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28737  predicted protein  53.5 
 
 		 439 aa  481  1e-135  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723788  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18475  translation elongation factor, EF-1, alpha subunit  53.74 
 
 		 439 aa  484  1e-135  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00280729  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04218  elongation factor 1-alpha (Broad)  51.01 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300924  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27198  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  35.68 
 
 		 467 aa  306  6e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00593045 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27060  Eukaryotic elongation factor 1 alpha  35.68 
 
 		 467 aa  306  6e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293222  hitchhiker  0.0000941001 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29711  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  35.68 
 
 		 467 aa  306  6e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105785  hitchhiker  0.00273357 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83594  elongation release factor  36.02 
 
 		 707 aa  285  8e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.432493  normal  0.18618 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04740  conserved hypothetical protein  35.94 
 
 		 914 aa  276  4e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.810548  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02080  translation release factor eRF3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04820)  35.02 
 
 		 708 aa  272  8.000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02063  translation elongation factor EF-1 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04630)  37.12 
 
 		 576 aa  267  2.9999999999999995e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.89 
 
 		 639 aa  263  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34493  predicted protein  33.41 
 
 		 447 aa  263  6e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01540  translation release factor, putative  32.86 
 
 		 757 aa  261  2e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1718  elongation factor Tu GTP binding domain-containing protein  34.99 
 
 		 516 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1194  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.13 
 
 		 564 aa  258  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14961  predicted protein  32.92 
 
 		 406 aa  258  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000165599  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36881  predicted protein  35.09 
 
 		 481 aa  253  3e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6984  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  34.76 
 
 		 636 aa  249  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0824  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.33 
 
 		 636 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.533102  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1153  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.02 
 
 		 642 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1042  adenylylsulfate kinase  33.25 
 
 		 642 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4017  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.65 
 
 		 639 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897015  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3828  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.94 
 
 		 615 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3564  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.95 
 
 		 641 aa  239  8e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2623  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.97 
 
 		 470 aa  238  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0651162  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  36.53 
 
 		 400 aa  235  9e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2764  adenylylsulfate kinase  30.71 
 
 		 641 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1400  sulfate adenylyltransferase, large subunit  37.38 
 
 		 645 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1629  protein synthesis factor GTP-binding  34.86 
 
 		 408 aa  232  9e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.418105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4111  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.91 
 
 		 598 aa  232  9e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6447  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.48 
 
 		 601 aa  232  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.832867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1290  elongation factor Tu  36.38 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000272484  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1396  elongation factor Tu  36.38 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.147055  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0792  elongation factor Tu  34.98 
 
 		 399 aa  230  4e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.640379  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1559  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.38 
 
 		 599 aa  229  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909063  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  34.82 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1140  elongation factor Tu  35.45 
 
 		 400 aa  226  5.0000000000000005e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000019246  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2537  adenylylsulfate kinase / sulfate adenylyltransferase subunit 1  32.57 
 
 		 599 aa  226  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0250  elongation factor Tu  34.89 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0263  elongation factor Tu  34.89 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516793  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12800  sulfate adenylyltransferase subunit 1  32.86 
 
 		 425 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6267  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.49 
 
 		 456 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  36.36 
 
 		 397 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  36.36 
 
 		 397 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  34.43 
 
 		 396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  34.43 
 
 		 396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  35.15 
 
 		 395 aa  223  6e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1235  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.01 
 
 		 444 aa  220  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  35.45 
 
 		 399 aa  220  3e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  36.58 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3253  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  31.7 
 
 		 644 aa  219  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438405  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23641  elongation factor Tu  35.45 
 
 		 399 aa  219  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  33.41 
 
 		 400 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  34.82 
 
 		 396 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  34.82 
 
 		 396 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  35.06 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  34.82 
 
 		 396 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  34.82 
 
 		 396 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  35.06 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0596  elongation factor Tu  36.64 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00435785  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  34.58 
 
 		 396 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  34.58 
 
 		 396 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4432  sulfate adenylate transferase, subunit 1/adenylylsulfate kinase  31.91 
 
 		 632 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000187918  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  33.95 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  33.95 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  36.34 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3933  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.52 
 
 		 619 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  33.97 
 
 		 399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>