More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3066 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0156  elongation factor 1-alpha  88.36 
 
 
421 aa  774    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2516  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  93.81 
 
 
420 aa  816    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0497  elongation factor 1-alpha  92.14 
 
 
420 aa  796    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0811  elongation factor 1-alpha  89.9 
 
 
423 aa  771    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3261  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  91.71 
 
 
423 aa  795    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664199  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3066  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  100 
 
 
420 aa  856    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1170  elongation factor 1-alpha  68.17 
 
 
422 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0730  elongation factor 1-alpha  67.79 
 
 
425 aa  600  1e-170  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425571  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1553  elongation factor 1-alpha  66.11 
 
 
426 aa  599  1e-170  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1441  elongation factor 1-alpha  63.7 
 
 
425 aa  589  1e-167  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.891927  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3685  elongation factor 1-alpha  65.87 
 
 
422 aa  590  1e-167  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.222951 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1592  elongation factor 1-alpha  66.11 
 
 
425 aa  586  1e-166  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0699  elongation factor 1-alpha  63.7 
 
 
425 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.085121 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0821  elongation factor 1-alpha  67.07 
 
 
424 aa  579  1e-164  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0073  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  61.32 
 
 
424 aa  562  1.0000000000000001e-159  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000421656  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0615  elongation factor 1-alpha  62.2 
 
 
428 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0782  elongation factor 1-alpha  62.2 
 
 
428 aa  558  1e-158  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0208  elongation factor 1-alpha  61.72 
 
 
428 aa  559  1e-158  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371461  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1303  elongation factor 1-alpha  61.72 
 
 
428 aa  558  1e-158  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0680  elongation factor 1-alpha  60.77 
 
 
428 aa  552  1e-156  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0647  elongation factor 1-alpha  53.15 
 
 
433 aa  488  1e-136  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000513743  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1196  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  52.37 
 
 
435 aa  482  1e-135  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1034  elongation factor 1-alpha  52.8 
 
 
432 aa  483  1e-135  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0041  elongation factor 1-alpha  50.24 
 
 
435 aa  466  9.999999999999999e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000171412  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1731  elongation factor 1-alpha  52.83 
 
 
444 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222772 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0397  elongation factor 1-alpha  52.12 
 
 
444 aa  466  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209425  normal  0.0958678 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1362  elongation factor 1-alpha  52.59 
 
 
444 aa  462  1e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.91449  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1111  elongation factor 1-alpha  52.59 
 
 
444 aa  461  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1745  elongation factor 1-alpha  51.18 
 
 
444 aa  460  9.999999999999999e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65303  Elongation factor 1-alpha (EF-1-alpha)  48.05 
 
 
458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.977722  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77514  translational elongation factor EF-1 alpha  48.05 
 
 
458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01300  translation elongation factor EF1-alpha, putative  48.96 
 
 
459 aa  449  1e-125  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18475  translation elongation factor, EF-1, alpha subunit  50.96 
 
 
439 aa  448  1e-125  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00280729  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28737  predicted protein  50.72 
 
 
439 aa  445  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723788  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04218  elongation factor 1-alpha (Broad)  47.18 
 
 
468 aa  442  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300924  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27198  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  37.83 
 
 
467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00593045 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29711  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  37.83 
 
 
467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105785  hitchhiker  0.00273357 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27060  Eukaryotic elongation factor 1 alpha  37.83 
 
 
467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293222  hitchhiker  0.0000941001 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04740  conserved hypothetical protein  37.96 
 
 
914 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.810548  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1194  sulfate adenylyltransferase, large subunit  36.48 
 
 
564 aa  265  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6447  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.83 
 
 
601 aa  263  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.832867  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83594  elongation release factor  32.94 
 
 
707 aa  262  6.999999999999999e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.432493  normal  0.18618 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02063  translation elongation factor EF-1 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04630)  36.78 
 
 
576 aa  262  8.999999999999999e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.78 
 
 
639 aa  262  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1718  elongation factor Tu GTP binding domain-containing protein  37.2 
 
 
516 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3828  sulfate adenylyltransferase, large subunit  37.62 
 
 
615 aa  260  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02080  translation release factor eRF3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04820)  33.41 
 
 
708 aa  258  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14961  predicted protein  34.57 
 
 
406 aa  257  3e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000165599  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01540  translation release factor, putative  34.03 
 
 
757 aa  256  7e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0824  sulfate adenylyltransferase, large subunit  36.47 
 
 
636 aa  255  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.533102  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1153  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  36.71 
 
 
642 aa  253  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1042  adenylylsulfate kinase  35.99 
 
 
642 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34493  predicted protein  33.56 
 
 
447 aa  248  1e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4017  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.75 
 
 
639 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897015  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2537  adenylylsulfate kinase / sulfate adenylyltransferase subunit 1  34.45 
 
 
599 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1400  sulfate adenylyltransferase, large subunit  37.75 
 
 
645 aa  246  6.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6984  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  35.02 
 
 
636 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4111  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.2 
 
 
598 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1629  protein synthesis factor GTP-binding  37.62 
 
 
408 aa  243  6e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.418105  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3564  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.06 
 
 
641 aa  239  9e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2764  adenylylsulfate kinase  33.82 
 
 
641 aa  237  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36881  predicted protein  33.72 
 
 
481 aa  237  3e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416405  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2586  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.31 
 
 
614 aa  235  9e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8319  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1559  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.37 
 
 
599 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909063  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2971  sulfate adenylate transferase, large subunit/adenylylsulfate kinase  34.4 
 
 
604 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0792  elongation factor Tu  36.55 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.640379  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3126  Sulfate adenylyltransferase., Adenylyl-sulfate kinase  36.19 
 
 
626 aa  233  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3175  elongation factor Tu  35.55 
 
 
395 aa  233  6e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  35.85 
 
 
395 aa  232  8.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2623  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.3 
 
 
470 aa  232  9e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0651162  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  36.71 
 
 
395 aa  230  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0158  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.99 
 
 
470 aa  230  4e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0740316  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  36.45 
 
 
396 aa  230  4e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  36.45 
 
 
396 aa  230  4e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1530  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  34.83 
 
 
651 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861038  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0250  elongation factor Tu  35.9 
 
 
405 aa  229  5e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0263  elongation factor Tu  35.9 
 
 
405 aa  229  5e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516793  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  36.66 
 
 
400 aa  229  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  35.88 
 
 
397 aa  228  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  35.88 
 
 
397 aa  228  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  35.12 
 
 
395 aa  227  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  35.85 
 
 
397 aa  225  9e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  36.21 
 
 
400 aa  225  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  36.08 
 
 
397 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3456  elongation factor Tu  35.31 
 
 
395 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0019954  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1398  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.37 
 
 
639 aa  223  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0369421  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  34.8 
 
 
397 aa  222  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0611  elongation factor Tu  35.03 
 
 
394 aa  222  9.999999999999999e-57  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.016281  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3253  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  33.17 
 
 
644 aa  222  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438405  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  35.05 
 
 
397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1396  elongation factor Tu  36.21 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.147055  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1290  elongation factor Tu  36.21 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000272484  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0635  sulfate adenylyltransferase subunit 1  33.09 
 
 
428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.217595  normal  0.169289 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  35.46 
 
 
397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  35.13 
 
 
397 aa  221  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  35.42 
 
 
396 aa  220  3e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4126  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  32.52 
 
 
632 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  34.51 
 
 
397 aa  219  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  34.66 
 
 
397 aa  218  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  34.28 
 
 
399 aa  218  1e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>