More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0156 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2516  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  87.65 
 
 		 420 aa  770    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0156  elongation factor 1-alpha  100 
 
 		 421 aa  857    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3261  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  85.78 
 
 		 423 aa  757    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664199  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3066  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  88.36 
 
 		 420 aa  774    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0811  elongation factor 1-alpha  87.11 
 
 		 423 aa  757    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0497  elongation factor 1-alpha  90.02 
 
 		 420 aa  781    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0730  elongation factor 1-alpha  67.38 
 
 		 425 aa  608  1e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425571  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1553  elongation factor 1-alpha  65.71 
 
 		 426 aa  610  1e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1170  elongation factor 1-alpha  67.46 
 
 		 422 aa  608  1e-173  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0699  elongation factor 1-alpha  64.52 
 
 		 425 aa  600  1e-170  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.085121 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3685  elongation factor 1-alpha  65.24 
 
 		 422 aa  596  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.222951 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1441  elongation factor 1-alpha  63.88 
 
 		 425 aa  593  1e-168  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.891927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0821  elongation factor 1-alpha  65.8 
 
 		 424 aa  587  1e-166  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1592  elongation factor 1-alpha  64.76 
 
 		 425 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0073  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  61.08 
 
 		 424 aa  564  1e-160  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000421656  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0615  elongation factor 1-alpha  61.79 
 
 		 428 aa  559  1e-158  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0208  elongation factor 1-alpha  61.32 
 
 		 428 aa  557  1e-157  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371461  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1303  elongation factor 1-alpha  61.32 
 
 		 428 aa  556  1e-157  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0782  elongation factor 1-alpha  60.85 
 
 		 428 aa  552  1e-156  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0680  elongation factor 1-alpha  61.37 
 
 		 428 aa  552  1e-156  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1034  elongation factor 1-alpha  53.97 
 
 		 432 aa  501  1e-140  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0647  elongation factor 1-alpha  52.94 
 
 		 433 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000513743  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1196  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  53.04 
 
 		 435 aa  491  1e-137  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0041  elongation factor 1-alpha  50 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000171412  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0397  elongation factor 1-alpha  52.25 
 
 		 444 aa  471  1e-132  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209425  normal  0.0958678 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1745  elongation factor 1-alpha  51.77 
 
 		 444 aa  468  1.0000000000000001e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1111  elongation factor 1-alpha  52.72 
 
 		 444 aa  466  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1731  elongation factor 1-alpha  52.72 
 
 		 444 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00222772 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1362  elongation factor 1-alpha  52.72 
 
 		 444 aa  464  1e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.91449  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01300  translation elongation factor EF1-alpha, putative  49.43 
 
 		 459 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77514  translational elongation factor EF-1 alpha  48.97 
 
 		 458 aa  449  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65303  Elongation factor 1-alpha (EF-1-alpha)  48.97 
 
 		 458 aa  449  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.977722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18475  translation elongation factor, EF-1, alpha subunit  51.07 
 
 		 439 aa  441  9.999999999999999e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00280729  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28737  predicted protein  50.83 
 
 		 439 aa  438  9.999999999999999e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723788  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04218  elongation factor 1-alpha (Broad)  47.53 
 
 		 468 aa  436  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300924  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27198  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  38.65 
 
 		 467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00593045 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29711  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  38.65 
 
 		 467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105785  hitchhiker  0.00273357 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27060  Eukaryotic elongation factor 1 alpha  38.65 
 
 		 467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293222  hitchhiker  0.0000941001 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04740  conserved hypothetical protein  37.73 
 
 		 914 aa  282  7.000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.810548  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02063  translation elongation factor EF-1 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04630)  37.38 
 
 		 576 aa  266  5e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83594  elongation release factor  33.26 
 
 		 707 aa  266  5e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.432493  normal  0.18618 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6447  sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.31 
 
 		 601 aa  265  8e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.832867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.82 
 
 		 639 aa  265  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1718  elongation factor Tu GTP binding domain-containing protein  35.87 
 
 		 516 aa  262  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3828  sulfate adenylyltransferase, large subunit  37.62 
 
 		 615 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34493  predicted protein  35.07 
 
 		 447 aa  259  5.0000000000000005e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14961  predicted protein  34.08 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000165599  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0824  sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.63 
 
 		 636 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.533102  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01540  translation release factor, putative  32.95 
 
 		 757 aa  252  7e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1153  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.22 
 
 		 642 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1042  adenylylsulfate kinase  34.83 
 
 		 642 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02080  translation release factor eRF3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04820)  32.19 
 
 		 708 aa  248  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1194  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.17 
 
 		 564 aa  248  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4017  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.07 
 
 		 639 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897015  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2537  adenylylsulfate kinase / sulfate adenylyltransferase subunit 1  33.65 
 
 		 599 aa  247  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1629  protein synthesis factor GTP-binding  38.42 
 
 		 408 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.418105  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1400  sulfate adenylyltransferase, large subunit  37.75 
 
 		 645 aa  247  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4111  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.18 
 
 		 598 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6984  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  33.97 
 
 		 636 aa  243  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36881  predicted protein  34.18 
 
 		 481 aa  242  9e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416405  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3564  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.17 
 
 		 641 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1559  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.28 
 
 		 599 aa  239  1e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909063  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0792  elongation factor Tu  35.58 
 
 		 399 aa  237  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.640379  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2971  sulfate adenylate transferase, large subunit/adenylylsulfate kinase  34.4 
 
 		 604 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2586  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.31 
 
 		 614 aa  237  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  36.74 
 
 		 400 aa  237  3e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2764  adenylylsulfate kinase  32.86 
 
 		 641 aa  236  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1530  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  35.21 
 
 		 651 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861038  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  37.2 
 
 		 396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  37.2 
 
 		 396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  36.83 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0250  elongation factor Tu  36.81 
 
 		 405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  36.83 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0263  elongation factor Tu  36.81 
 
 		 405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516793  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  36.26 
 
 		 395 aa  233  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  36.05 
 
 		 396 aa  233  5e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  35.46 
 
 		 397 aa  233  6e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3175  elongation factor Tu  34.99 
 
 		 395 aa  232  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  36.34 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  36.34 
 
 		 395 aa  230  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  36.17 
 
 		 397 aa  230  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3253  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  34.87 
 
 		 644 aa  229  5e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438405  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0396  translation elongation factor Tu  37.88 
 
 		 395 aa  229  5e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  37.12 
 
 		 400 aa  229  7e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  35.98 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  35.98 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  36.79 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  36.79 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  35.27 
 
 		 395 aa  228  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  35.13 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  36.17 
 
 		 397 aa  228  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  34.99 
 
 		 399 aa  227  3e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2157  elongation factor Tu  37 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2170  elongation factor Tu  37 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0151946  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2623  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.68 
 
 		 470 aa  226  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0651162  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  35.66 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3456  elongation factor Tu  35.13 
 
 		 395 aa  226  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0019954  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  35.9 
 
 		 397 aa  227  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  34.82 
 
 		 399 aa  226  5.0000000000000005e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  35.25 
 
 		 396 aa  226  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>