More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3685 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3685  elongation factor 1-alpha  100 
 
 
422 aa  870    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.222951 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1553  elongation factor 1-alpha  72.99 
 
 
426 aa  667    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1592  elongation factor 1-alpha  74.17 
 
 
425 aa  651    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1170  elongation factor 1-alpha  82.86 
 
 
422 aa  719    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0699  elongation factor 1-alpha  72.99 
 
 
425 aa  667    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.085121 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1441  elongation factor 1-alpha  69.43 
 
 
425 aa  642    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.891927  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0821  elongation factor 1-alpha  74.11 
 
 
424 aa  661    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0730  elongation factor 1-alpha  76.07 
 
 
425 aa  676    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425571  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0073  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  67.69 
 
 
424 aa  618  1e-176  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000421656  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0156  elongation factor 1-alpha  65.24 
 
 
421 aa  614  1e-175  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3066  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  65.87 
 
 
420 aa  608  1e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0811  elongation factor 1-alpha  64.69 
 
 
423 aa  607  1e-173  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2516  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  65.38 
 
 
420 aa  605  9.999999999999999e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0782  elongation factor 1-alpha  65.96 
 
 
428 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3261  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  63.98 
 
 
423 aa  598  1e-170  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664199  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0497  elongation factor 1-alpha  64.66 
 
 
420 aa  593  1e-168  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0615  elongation factor 1-alpha  64.32 
 
 
428 aa  589  1e-167  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0208  elongation factor 1-alpha  64.55 
 
 
428 aa  590  1e-167  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371461  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1303  elongation factor 1-alpha  64.08 
 
 
428 aa  589  1e-167  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0680  elongation factor 1-alpha  64.32 
 
 
428 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0647  elongation factor 1-alpha  57.34 
 
 
433 aa  528  1e-149  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000513743  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1196  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  56.67 
 
 
435 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1034  elongation factor 1-alpha  55.14 
 
 
432 aa  509  1e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1111  elongation factor 1-alpha  55.63 
 
 
444 aa  499  1e-140  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0397  elongation factor 1-alpha  54.93 
 
 
444 aa  498  1e-140  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209425  normal  0.0958678 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1731  elongation factor 1-alpha  54.93 
 
 
444 aa  495  1e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222772 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0041  elongation factor 1-alpha  53.86 
 
 
435 aa  496  1e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000171412  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1362  elongation factor 1-alpha  54.69 
 
 
444 aa  493  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.91449  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1745  elongation factor 1-alpha  51.41 
 
 
444 aa  476  1e-133  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65303  Elongation factor 1-alpha (EF-1-alpha)  49.43 
 
 
458 aa  469  1.0000000000000001e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.977722  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77514  translational elongation factor EF-1 alpha  49.43 
 
 
458 aa  469  1.0000000000000001e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01300  translation elongation factor EF1-alpha, putative  49.89 
 
 
459 aa  463  1e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04218  elongation factor 1-alpha (Broad)  48.65 
 
 
468 aa  456  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300924  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18475  translation elongation factor, EF-1, alpha subunit  50.35 
 
 
439 aa  455  1e-127  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00280729  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28737  predicted protein  50.12 
 
 
439 aa  451  1.0000000000000001e-126  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723788  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29711  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  37.12 
 
 
467 aa  316  5e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105785  hitchhiker  0.00273357 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27060  Eukaryotic elongation factor 1 alpha  37.12 
 
 
467 aa  316  5e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293222  hitchhiker  0.0000941001 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27198  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  37.12 
 
 
467 aa  316  5e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00593045 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01540  translation release factor, putative  35.46 
 
 
757 aa  280  4e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02063  translation elongation factor EF-1 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04630)  37.53 
 
 
576 aa  278  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83594  elongation release factor  34.6 
 
 
707 aa  275  1.0000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.432493  normal  0.18618 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04740  conserved hypothetical protein  37.16 
 
 
914 aa  271  2e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.810548  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02080  translation release factor eRF3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04820)  35.02 
 
 
708 aa  267  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14961  predicted protein  35.06 
 
 
406 aa  262  6.999999999999999e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000165599  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34493  predicted protein  34.78 
 
 
447 aa  260  4e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1718  elongation factor Tu GTP binding domain-containing protein  34.3 
 
 
516 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6984  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  34.13 
 
 
636 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1194  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.08 
 
 
564 aa  258  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36881  predicted protein  34.86 
 
 
481 aa  257  3e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416405  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0824  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.49 
 
 
636 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.533102  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6447  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.41 
 
 
601 aa  250  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.832867  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1042  adenylylsulfate kinase  33.49 
 
 
642 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.8 
 
 
639 aa  245  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2623  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.45 
 
 
470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0651162  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3564  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.13 
 
 
641 aa  242  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4017  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.94 
 
 
639 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897015  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3828  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.82 
 
 
615 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1153  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.82 
 
 
642 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2764  adenylylsulfate kinase  31.97 
 
 
641 aa  237  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4111  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.87 
 
 
598 aa  236  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1629  protein synthesis factor GTP-binding  36.3 
 
 
408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.418105  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12980  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  31.1 
 
 
633 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4432  sulfate adenylate transferase, subunit 1/adenylylsulfate kinase  32.22 
 
 
632 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000187918  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1400  sulfate adenylyltransferase, large subunit  37.34 
 
 
645 aa  230  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4126  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  31.82 
 
 
632 aa  230  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2537  adenylylsulfate kinase / sulfate adenylyltransferase subunit 1  32.93 
 
 
599 aa  229  8e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5014  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  32.46 
 
 
632 aa  227  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.688954  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1768  GTPases - sulfate adenylate transferase subunit 1  31.21 
 
 
600 aa  225  9e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00233348  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57710  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  32.46 
 
 
633 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06015  sulfate adenylyltransferase subunit 1  31.77 
 
 
415 aa  224  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2971  sulfate adenylate transferase, large subunit/adenylylsulfate kinase  31.07 
 
 
604 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2586  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.07 
 
 
614 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8319  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1304  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  36.45 
 
 
633 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4545  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  36.14 
 
 
633 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4421  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  36.45 
 
 
633 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.643598  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0878  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  32.46 
 
 
632 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.844643 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02716  sulfate adenylyltransferase subunit 1  32.86 
 
 
471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.92691  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3933  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  29.33 
 
 
619 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1296  sulfate adenylyltransferase large subunit  30.31 
 
 
421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  34.11 
 
 
400 aa  221  3e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3253  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  31.31 
 
 
644 aa  220  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438405  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23641  elongation factor Tu  35.81 
 
 
399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0911  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  31.1 
 
 
633 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634897  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3918  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  29.33 
 
 
619 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.720978  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11312  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  29.81 
 
 
614 aa  220  5e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3992  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  29.33 
 
 
619 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.610707  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2183  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.39 
 
 
537 aa  219  6e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0891  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  36.45 
 
 
631 aa  219  6e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  34.44 
 
 
400 aa  219  7e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0158  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  29.67 
 
 
470 aa  219  7e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0740316  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  34.57 
 
 
395 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2724  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.84 
 
 
450 aa  218  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000102615 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3125  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.84 
 
 
450 aa  218  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.565988  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1398  sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.62 
 
 
639 aa  218  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0369421  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  33.73 
 
 
400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1290  elongation factor Tu  33.49 
 
 
400 aa  217  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000272484  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1396  elongation factor Tu  33.49 
 
 
400 aa  217  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.147055  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2450  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  30.58 
 
 
631 aa  216  5e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16311  elongation factor Tu  34.63 
 
 
399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  35.43 
 
 
395 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>