More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_34493 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_34493  predicted protein  100 
 
 
447 aa  927    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14961  predicted protein  51.09 
 
 
406 aa  427  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000165599  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83594  elongation release factor  47.4 
 
 
707 aa  411  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.432493  normal  0.18618 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01540  translation release factor, putative  45.68 
 
 
757 aa  402  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02080  translation release factor eRF3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04820)  43.96 
 
 
708 aa  384  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01300  translation elongation factor EF1-alpha, putative  37.84 
 
 
459 aa  287  2e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0647  elongation factor 1-alpha  37.7 
 
 
433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000513743  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65303  Elongation factor 1-alpha (EF-1-alpha)  36.26 
 
 
458 aa  279  6e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.977722  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77514  translational elongation factor EF-1 alpha  36.26 
 
 
458 aa  279  6e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0073  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  35.6 
 
 
424 aa  279  7e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000421656  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28737  predicted protein  34.84 
 
 
439 aa  276  7e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723788  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0041  elongation factor 1-alpha  36.32 
 
 
435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000171412  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18475  translation elongation factor, EF-1, alpha subunit  34.84 
 
 
439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00280729  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1196  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  35.2 
 
 
435 aa  271  1e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04218  elongation factor 1-alpha (Broad)  35.57 
 
 
468 aa  271  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300924  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1745  elongation factor 1-alpha  35.87 
 
 
444 aa  263  4.999999999999999e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0699  elongation factor 1-alpha  33.41 
 
 
425 aa  263  6e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.085121 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1441  elongation factor 1-alpha  33.18 
 
 
425 aa  260  3e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.891927  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0156  elongation factor 1-alpha  35.07 
 
 
421 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0397  elongation factor 1-alpha  34.83 
 
 
444 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209425  normal  0.0958678 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3261  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  35.14 
 
 
423 aa  259  9e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664199  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1362  elongation factor 1-alpha  34.61 
 
 
444 aa  259  9e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.91449  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1111  elongation factor 1-alpha  34.61 
 
 
444 aa  257  3e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2516  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  34.55 
 
 
420 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1731  elongation factor 1-alpha  33.93 
 
 
444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222772 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0811  elongation factor 1-alpha  35.23 
 
 
423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1553  elongation factor 1-alpha  32.74 
 
 
426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1034  elongation factor 1-alpha  34.54 
 
 
432 aa  254  3e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04740  conserved hypothetical protein  33.56 
 
 
914 aa  252  7e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.810548  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0497  elongation factor 1-alpha  35.24 
 
 
420 aa  251  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1170  elongation factor 1-alpha  35.78 
 
 
422 aa  249  5e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3066  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  33.56 
 
 
420 aa  248  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1592  elongation factor 1-alpha  34.4 
 
 
425 aa  248  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3685  elongation factor 1-alpha  34.78 
 
 
422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.222951 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0821  elongation factor 1-alpha  34.6 
 
 
424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0615  elongation factor 1-alpha  34.94 
 
 
428 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0680  elongation factor 1-alpha  35.93 
 
 
428 aa  240  4e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0208  elongation factor 1-alpha  34.71 
 
 
428 aa  240  4e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371461  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1303  elongation factor 1-alpha  34.71 
 
 
428 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0730  elongation factor 1-alpha  32.06 
 
 
425 aa  239  9e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425571  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0782  elongation factor 1-alpha  34.25 
 
 
428 aa  236  8e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02063  translation elongation factor EF-1 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04630)  34.17 
 
 
576 aa  233  5e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48738  predicted protein  34.75 
 
 
581 aa  231  2e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.655952 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36881  predicted protein  34.08 
 
 
481 aa  226  9e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416405  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27060  Eukaryotic elongation factor 1 alpha  30.13 
 
 
467 aa  202  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293222  hitchhiker  0.0000941001 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29711  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  30.13 
 
 
467 aa  202  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105785  hitchhiker  0.00273357 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27198  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  30.13 
 
 
467 aa  202  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00593045 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15121  predicted protein  30.11 
 
 
450 aa  192  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00103501  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6447  sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.03 
 
 
601 aa  163  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.832867  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0158  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  26.89 
 
 
470 aa  162  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0740316  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1718  elongation factor Tu GTP binding domain-containing protein  30.93 
 
 
516 aa  160  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1687  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  32.71 
 
 
638 aa  159  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2552  sulfate adenylyltransferase subunit 1  32.4 
 
 
474 aa  158  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1643  sulfate adenylyltransferase, large subunit  29.4 
 
 
424 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1194  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.93 
 
 
564 aa  155  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4111  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.43 
 
 
598 aa  154  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2201  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.67 
 
 
416 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6984  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  28.57 
 
 
636 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1749  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  28.15 
 
 
642 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4225  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  27.78 
 
 
647 aa  150  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279145  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0832  sulfate adenylyltransferase subunit 1  32.27 
 
 
475 aa  150  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1498  sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.67 
 
 
486 aa  149  7e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.57722  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1629  protein synthesis factor GTP-binding  32.22 
 
 
408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.418105  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.59 
 
 
639 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4422  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  31.62 
 
 
618 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1526  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  32.55 
 
 
633 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465942 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2111  sulfate adenylyltransferase, large subunit  29.89 
 
 
437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0738  sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.23 
 
 
435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20107  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1788  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.43 
 
 
476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2971  sulfate adenylate transferase, large subunit/adenylylsulfate kinase  27.79 
 
 
604 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2586  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.79 
 
 
614 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8319  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1296  sulfate adenylyltransferase large subunit  29.56 
 
 
421 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0715  sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.28 
 
 
454 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2735  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.67 
 
 
552 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3342  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  28.34 
 
 
640 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.914743  normal  0.584003 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11312  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  33.23 
 
 
614 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6392  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  28.02 
 
 
640 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.159074 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0420  sulfate adenylyltransferase subunit 1  29.27 
 
 
422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0793  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.22 
 
 
426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1674  sulfate adenylyltransferase subunit 1  27.07 
 
 
432 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.313363  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1400  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.73 
 
 
645 aa  147  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4396  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  28.83 
 
 
640 aa  146  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2429  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.13 
 
 
462 aa  146  9e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.446728 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3517  sulfate adenylyltransferase subunit 1  30.09 
 
 
496 aa  146  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.166737  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0819  sulfate adenylyltransferase subunit 1  30.55 
 
 
481 aa  146  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1235  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.26 
 
 
444 aa  146  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5479  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.85 
 
 
798 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0197363  decreased coverage  0.00943774 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0863  sulfate adenylyltransferase subunit 1  31.09 
 
 
476 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1398  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.79 
 
 
639 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0369421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1693  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.54 
 
 
416 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133685  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3360  sulfate adenylyltransferase subunit 1  30.09 
 
 
496 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4017  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  29.37 
 
 
639 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897015  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2537  adenylylsulfate kinase / sulfate adenylyltransferase subunit 1  31.23 
 
 
599 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4376  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.48 
 
 
476 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3933  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  32.01 
 
 
619 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1799  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.83 
 
 
807 aa  143  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3933  sulfate adenylyltransferase, large subunit  25.9 
 
 
559 aa  143  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3918  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  32.01 
 
 
619 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.720978  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4208  sulfate adenylyltransferase subunit 1  28.51 
 
 
432 aa  142  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3992  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  32.01 
 
 
619 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.610707  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>