More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_65303 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_04218  elongation factor 1-alpha (Broad)  84.4 
 
 		 468 aa  814    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300924  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01300  translation elongation factor EF1-alpha, putative  85.52 
 
 		 459 aa  804    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65303  Elongation factor 1-alpha (EF-1-alpha)  100 
 
 		 458 aa  935    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.977722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28737  predicted protein  74.32 
 
 		 439 aa  684    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723788  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18475  translation elongation factor, EF-1, alpha subunit  74.55 
 
 		 439 aa  687    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00280729  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77514  translational elongation factor EF-1 alpha  100 
 
 		 458 aa  935    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0073  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  54.85 
 
 		 424 aa  498  1e-140  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000421656  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0699  elongation factor 1-alpha  53.86 
 
 		 425 aa  499  1e-140  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.085121 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1553  elongation factor 1-alpha  53.41 
 
 		 426 aa  498  1e-140  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1592  elongation factor 1-alpha  54.88 
 
 		 425 aa  497  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1441  elongation factor 1-alpha  52.95 
 
 		 425 aa  495  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.891927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0647  elongation factor 1-alpha  51.8 
 
 		 433 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000513743  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0730  elongation factor 1-alpha  53.99 
 
 		 425 aa  483  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425571  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1196  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  51.48 
 
 		 435 aa  480  1e-134  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0041  elongation factor 1-alpha  51.25 
 
 		 435 aa  479  1e-134  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000171412  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1034  elongation factor 1-alpha  50.23 
 
 		 432 aa  473  1e-132  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0615  elongation factor 1-alpha  52.58 
 
 		 428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0680  elongation factor 1-alpha  52.36 
 
 		 428 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1303  elongation factor 1-alpha  52.81 
 
 		 428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0208  elongation factor 1-alpha  52.81 
 
 		 428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371461  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0782  elongation factor 1-alpha  51.91 
 
 		 428 aa  462  1e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0811  elongation factor 1-alpha  49.43 
 
 		 423 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1745  elongation factor 1-alpha  49.88 
 
 		 444 aa  456  1e-127  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1170  elongation factor 1-alpha  50.46 
 
 		 422 aa  455  1e-127  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0821  elongation factor 1-alpha  50.11 
 
 		 424 aa  455  1e-127  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3066  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  48.05 
 
 		 420 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3685  elongation factor 1-alpha  49.43 
 
 		 422 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.222951 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1111  elongation factor 1-alpha  48.06 
 
 		 444 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2516  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  48.05 
 
 		 420 aa  449  1e-125  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3261  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  47.39 
 
 		 423 aa  450  1e-125  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664199  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1362  elongation factor 1-alpha  48.29 
 
 		 444 aa  450  1e-125  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.91449  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0156  elongation factor 1-alpha  48.97 
 
 		 421 aa  449  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1731  elongation factor 1-alpha  47.38 
 
 		 444 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00222772 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0497  elongation factor 1-alpha  48.97 
 
 		 420 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0397  elongation factor 1-alpha  48.06 
 
 		 444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209425  normal  0.0958678 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27198  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  42.46 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00593045 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27060  Eukaryotic elongation factor 1 alpha  42.46 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293222  hitchhiker  0.0000941001 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29711  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  42.46 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105785  hitchhiker  0.00273357 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01540  translation release factor, putative  36.9 
 
 		 757 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83594  elongation release factor  38.13 
 
 		 707 aa  305  8.000000000000001e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.432493  normal  0.18618 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02063  translation elongation factor EF-1 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04630)  38.24 
 
 		 576 aa  296  6e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04740  conserved hypothetical protein  35.75 
 
 		 914 aa  281  3e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.810548  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34493  predicted protein  36.26 
 
 		 447 aa  279  6e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14961  predicted protein  37.9 
 
 		 406 aa  276  5e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000165599  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02080  translation release factor eRF3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04820)  33.48 
 
 		 708 aa  273  5.000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36881  predicted protein  32.74 
 
 		 481 aa  243  5e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416405  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.77 
 
 		 639 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48738  predicted protein  32.42 
 
 		 581 aa  226  5.0000000000000005e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.655952 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1194  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.02 
 
 		 564 aa  225  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1718  elongation factor Tu GTP binding domain-containing protein  33.04 
 
 		 516 aa  217  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1400  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.97 
 
 		 645 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4017  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.61 
 
 		 639 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897015  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6984  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  31.1 
 
 		 636 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3564  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.21 
 
 		 641 aa  207  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3828  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.04 
 
 		 615 aa  206  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0824  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.97 
 
 		 636 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.533102  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2764  adenylylsulfate kinase  31.99 
 
 		 641 aa  204  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1042  adenylylsulfate kinase  31.54 
 
 		 642 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15121  predicted protein  29.41 
 
 		 450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00103501  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6447  sulfate adenylyltransferase, large subunit  37.13 
 
 		 601 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.832867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1153  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.56 
 
 		 642 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4111  sulfate adenylyltransferase, large subunit  29.89 
 
 		 598 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1526  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.86 
 
 		 633 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.465942 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1559  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  29.98 
 
 		 599 aa  194  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909063  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3253  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.86 
 
 		 644 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438405  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  33.04 
 
 		 405 aa  193  6e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  33.04 
 
 		 405 aa  193  6e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1629  protein synthesis factor GTP-binding  34.02 
 
 		 408 aa  193  7e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.418105  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2971  sulfate adenylate transferase, large subunit/adenylylsulfate kinase  29.14 
 
 		 604 aa  193  7e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2586  sulfate adenylyltransferase, large subunit  29.14 
 
 		 614 aa  192  7e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  32.51 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2537  adenylylsulfate kinase / sulfate adenylyltransferase subunit 1  30.67 
 
 		 599 aa  188  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4560  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  29.64 
 
 		 633 aa  187  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6191  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  29.64 
 
 		 633 aa  187  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  32.07 
 
 		 396 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  32.07 
 
 		 396 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3342  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  29.62 
 
 		 640 aa  186  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.914743  normal  0.584003 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0158  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.41 
 
 		 470 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0740316  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0635  sulfate adenylyltransferase subunit 1  31.15 
 
 		 428 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.217595  normal  0.169289 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0263  elongation factor Tu  32.29 
 
 		 405 aa  185  2.0000000000000003e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516793  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0250  elongation factor Tu  32.29 
 
 		 405 aa  185  2.0000000000000003e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1290  elongation factor Tu  32.59 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000272484  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5479  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.02 
 
 		 798 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0197363  decreased coverage  0.00943774 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1396  elongation factor Tu  32.59 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.147055  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  32.06 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  32.06 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  31 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  32.96 
 
 		 400 aa  183  7e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  31.22 
 
 		 395 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0585  translation elongation factor Tu  32.74 
 
 		 396 aa  182  9.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344387  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  32.14 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  32.14 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  33.18 
 
 		 397 aa  182  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  33.18 
 
 		 397 aa  182  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1247  elongation factor Tu  33.18 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.727206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  32.14 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  32.14 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  32.82 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  32.88 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4396  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.27 
 
 		 640 aa  182  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.108805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>