More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_48738 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_48738  predicted protein  100 
 
 
581 aa  1187    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.655952 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02063  translation elongation factor EF-1 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04630)  37.43 
 
 
576 aa  303  8.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04740  conserved hypothetical protein  38.12 
 
 
914 aa  301  3e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.810548  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0647  elongation factor 1-alpha  34.92 
 
 
433 aa  259  1e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000513743  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1196  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  34.62 
 
 
435 aa  254  3e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1745  elongation factor 1-alpha  33.78 
 
 
444 aa  248  3e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83594  elongation release factor  33.11 
 
 
707 aa  241  2.9999999999999997e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.432493  normal  0.18618 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28737  predicted protein  35.15 
 
 
439 aa  241  4e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723788  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18475  translation elongation factor, EF-1, alpha subunit  34.92 
 
 
439 aa  239  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00280729  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0041  elongation factor 1-alpha  32.51 
 
 
435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000171412  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34493  predicted protein  34.75 
 
 
447 aa  231  4e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65303  Elongation factor 1-alpha (EF-1-alpha)  32.8 
 
 
458 aa  230  5e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.977722  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77514  translational elongation factor EF-1 alpha  32.8 
 
 
458 aa  230  5e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01540  translation release factor, putative  31.98 
 
 
757 aa  229  1e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1441  elongation factor 1-alpha  33.48 
 
 
425 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.891927  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01300  translation elongation factor EF1-alpha, putative  32.89 
 
 
459 aa  225  2e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1553  elongation factor 1-alpha  33.94 
 
 
426 aa  224  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1034  elongation factor 1-alpha  31.67 
 
 
432 aa  223  7e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1731  elongation factor 1-alpha  31.21 
 
 
444 aa  223  7e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222772 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0073  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  31.9 
 
 
424 aa  223  8e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000421656  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1362  elongation factor 1-alpha  32.12 
 
 
444 aa  222  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.91449  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1111  elongation factor 1-alpha  31.89 
 
 
444 aa  222  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02080  translation release factor eRF3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04820)  30.79 
 
 
708 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0397  elongation factor 1-alpha  30.75 
 
 
444 aa  220  7e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209425  normal  0.0958678 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36881  predicted protein  32.39 
 
 
481 aa  219  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416405  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0699  elongation factor 1-alpha  32.5 
 
 
425 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.085121 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04218  elongation factor 1-alpha (Broad)  31.64 
 
 
468 aa  214  4.9999999999999996e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300924  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0156  elongation factor 1-alpha  32.13 
 
 
421 aa  213  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0811  elongation factor 1-alpha  33.03 
 
 
423 aa  209  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1170  elongation factor 1-alpha  32.27 
 
 
422 aa  209  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1592  elongation factor 1-alpha  31.75 
 
 
425 aa  207  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3261  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  31.51 
 
 
423 aa  205  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664199  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0497  elongation factor 1-alpha  31.82 
 
 
420 aa  205  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0730  elongation factor 1-alpha  32.43 
 
 
425 aa  203  8e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425571  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15121  predicted protein  31.03 
 
 
450 aa  202  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00103501  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3066  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  31.28 
 
 
420 aa  200  7e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0680  elongation factor 1-alpha  31 
 
 
428 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2516  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  31.74 
 
 
420 aa  199  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0821  elongation factor 1-alpha  30.82 
 
 
424 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0208  elongation factor 1-alpha  31.45 
 
 
428 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371461  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0615  elongation factor 1-alpha  31.45 
 
 
428 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3685  elongation factor 1-alpha  31.67 
 
 
422 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.222951 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1303  elongation factor 1-alpha  31.45 
 
 
428 aa  197  6e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14961  predicted protein  30.99 
 
 
406 aa  192  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000165599  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0782  elongation factor 1-alpha  30.09 
 
 
428 aa  189  8e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0158  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.68 
 
 
470 aa  188  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0740316  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29711  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  30.16 
 
 
467 aa  179  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105785  hitchhiker  0.00273357 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27198  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  30.16 
 
 
467 aa  179  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00593045 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27060  Eukaryotic elongation factor 1 alpha  30.16 
 
 
467 aa  179  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293222  hitchhiker  0.0000941001 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4396  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  28.44 
 
 
640 aa  176  8e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1530  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  28.38 
 
 
651 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861038  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2429  sulfate adenylyltransferase, large subunit  29.02 
 
 
462 aa  167  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.446728 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2586  sulfate adenylyltransferase, large subunit  29.25 
 
 
614 aa  166  8e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8319  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2971  sulfate adenylate transferase, large subunit/adenylylsulfate kinase  29.25 
 
 
604 aa  166  9e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1674  sulfate adenylyltransferase subunit 1  28.73 
 
 
432 aa  164  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.313363  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0911  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  26.9 
 
 
633 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634897  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4545  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  26.9 
 
 
633 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5496  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  28.73 
 
 
640 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2143  sulfate adenylate transferase, subunit 1  27.83 
 
 
466 aa  163  9e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.43414  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1304  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  27.13 
 
 
633 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4421  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  27.13 
 
 
633 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.643598  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2764  adenylylsulfate kinase  27.09 
 
 
641 aa  162  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6392  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  28.38 
 
 
640 aa  161  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.159074 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2450  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  28.48 
 
 
631 aa  161  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3253  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  27.33 
 
 
644 aa  160  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438405  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4376  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.59 
 
 
476 aa  160  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2890  Sulfate adenylyltransferase  31.38 
 
 
469 aa  160  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1718  elongation factor Tu GTP binding domain-containing protein  28.25 
 
 
516 aa  159  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1398  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.29 
 
 
639 aa  159  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0369421  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6984  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  25.28 
 
 
636 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57710  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  26.61 
 
 
633 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0863  sulfate adenylyltransferase subunit 1  30.27 
 
 
476 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0819  sulfate adenylyltransferase subunit 1  30.13 
 
 
481 aa  159  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3564  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.21 
 
 
641 aa  159  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0186  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  27.78 
 
 
644 aa  158  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0471725  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12980  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  26.82 
 
 
633 aa  159  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3933  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.56 
 
 
559 aa  157  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1153  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.99 
 
 
642 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0933  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.48 
 
 
625 aa  157  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861181  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0194  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  28 
 
 
644 aa  157  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0986259  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0793  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.15 
 
 
426 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2945  sulfate adenylyltransferase subunit 1  33.21 
 
 
426 aa  157  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.53268  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5014  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  26.38 
 
 
632 aa  157  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.688954  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3978  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.94 
 
 
422 aa  157  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1693  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.69 
 
 
416 aa  157  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133685  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7379  sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.25 
 
 
446 aa  157  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916136  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1687  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.43 
 
 
469 aa  156  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2987  Sulfate adenylyltransferase  27.39 
 
 
469 aa  156  9e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.410863  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0420  sulfate adenylyltransferase subunit 1  27.89 
 
 
422 aa  156  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3593  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.57 
 
 
617 aa  156  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.876759  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1194  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.25 
 
 
564 aa  156  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.33 
 
 
639 aa  156  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1749  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  27.93 
 
 
642 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1629  protein synthesis factor GTP-binding  27.42 
 
 
408 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.418105  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1648  sulfate adenylyltransferase subunit 1  28.86 
 
 
469 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0754  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  25.36 
 
 
660 aa  155  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0798  sulfate adenylyltransferase, large subunit  26.83 
 
 
469 aa  155  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055345 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2183  sulfate adenylyltransferase, large subunit  26.93 
 
 
537 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4208  sulfate adenylyltransferase subunit 1  27.4 
 
 
432 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4126  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  25.98 
 
 
632 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>