More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF01540 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006691  CNF01540  translation release factor, putative  100 
 
 
757 aa  1550    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83594  elongation release factor  56.58 
 
 
707 aa  578  1.0000000000000001e-163  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.432493  normal  0.18618 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02080  translation release factor eRF3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04820)  48.91 
 
 
708 aa  575  1.0000000000000001e-162  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14961  predicted protein  50.49 
 
 
406 aa  445  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000165599  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34493  predicted protein  45.68 
 
 
447 aa  401  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0647  elongation factor 1-alpha  40.19 
 
 
433 aa  319  1e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000513743  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1196  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  38.79 
 
 
435 aa  316  9.999999999999999e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0041  elongation factor 1-alpha  39.02 
 
 
435 aa  313  1e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000171412  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1362  elongation factor 1-alpha  38.32 
 
 
444 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.91449  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0397  elongation factor 1-alpha  38.08 
 
 
444 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209425  normal  0.0958678 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1731  elongation factor 1-alpha  38.55 
 
 
444 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222772 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1111  elongation factor 1-alpha  37.85 
 
 
444 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65303  Elongation factor 1-alpha (EF-1-alpha)  36.9 
 
 
458 aa  305  3.0000000000000004e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.977722  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77514  translational elongation factor EF-1 alpha  36.9 
 
 
458 aa  305  3.0000000000000004e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1745  elongation factor 1-alpha  39.49 
 
 
444 aa  303  8.000000000000001e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18475  translation elongation factor, EF-1, alpha subunit  37.76 
 
 
439 aa  300  9e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00280729  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28737  predicted protein  37.53 
 
 
439 aa  296  1e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723788  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0073  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  35.75 
 
 
424 aa  292  2e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000421656  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1034  elongation factor 1-alpha  37.5 
 
 
432 aa  290  7e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01300  translation elongation factor EF1-alpha, putative  34.98 
 
 
459 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04218  elongation factor 1-alpha (Broad)  35.1 
 
 
468 aa  280  6e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300924  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04740  conserved hypothetical protein  35.68 
 
 
914 aa  278  3e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.810548  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1441  elongation factor 1-alpha  35.29 
 
 
425 aa  273  1e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.891927  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1592  elongation factor 1-alpha  34.57 
 
 
425 aa  263  6.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0811  elongation factor 1-alpha  35.35 
 
 
423 aa  263  8e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0821  elongation factor 1-alpha  34.64 
 
 
424 aa  263  1e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3685  elongation factor 1-alpha  35.46 
 
 
422 aa  261  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.222951 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1553  elongation factor 1-alpha  34.35 
 
 
426 aa  260  8e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1170  elongation factor 1-alpha  35.03 
 
 
422 aa  259  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0699  elongation factor 1-alpha  32.86 
 
 
425 aa  258  3e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.085121 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3066  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  34.03 
 
 
420 aa  253  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02063  translation elongation factor EF-1 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04630)  32.95 
 
 
576 aa  252  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0730  elongation factor 1-alpha  34.52 
 
 
425 aa  251  3e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425571  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3261  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  34.02 
 
 
423 aa  251  4e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664199  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0156  elongation factor 1-alpha  32.95 
 
 
421 aa  249  1e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0782  elongation factor 1-alpha  34.68 
 
 
428 aa  244  3e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2516  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  33.41 
 
 
420 aa  244  6e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0680  elongation factor 1-alpha  33.87 
 
 
428 aa  243  7e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0497  elongation factor 1-alpha  33.57 
 
 
420 aa  243  9e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0208  elongation factor 1-alpha  33.87 
 
 
428 aa  243  1e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371461  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0615  elongation factor 1-alpha  33.87 
 
 
428 aa  243  1e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1303  elongation factor 1-alpha  33.64 
 
 
428 aa  242  2e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36881  predicted protein  34.68 
 
 
481 aa  233  1e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416405  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48738  predicted protein  31.9 
 
 
581 aa  221  3.9999999999999997e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.655952 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29711  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  31.24 
 
 
467 aa  209  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105785  hitchhiker  0.00273357 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27060  Eukaryotic elongation factor 1 alpha  31.24 
 
 
467 aa  209  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293222  hitchhiker  0.0000941001 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27198  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  31.24 
 
 
467 aa  209  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00593045 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15121  predicted protein  28.57 
 
 
450 aa  187  5e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00103501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1718  elongation factor Tu GTP binding domain-containing protein  28.47 
 
 
516 aa  178  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3253  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  28.41 
 
 
644 aa  171  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438405  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2537  adenylylsulfate kinase / sulfate adenylyltransferase subunit 1  28.4 
 
 
599 aa  170  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6447  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.41 
 
 
601 aa  169  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.832867  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4111  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.88 
 
 
598 aa  169  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1749  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  29.35 
 
 
642 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1235  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.14 
 
 
444 aa  168  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2450  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  28.6 
 
 
631 aa  167  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5479  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.14 
 
 
798 aa  167  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0197363  decreased coverage  0.00943774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3933  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  27.92 
 
 
619 aa  167  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3342  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  28.12 
 
 
640 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.914743  normal  0.584003 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1526  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  29.77 
 
 
633 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3918  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  27.92 
 
 
619 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.720978  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4376  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.98 
 
 
476 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3992  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  27.92 
 
 
619 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.610707  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1788  sulfate adenylyltransferase, large subunit  26.98 
 
 
476 aa  165  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0933  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.97 
 
 
625 aa  165  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861181  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1296  sulfate adenylyltransferase large subunit  29.12 
 
 
421 aa  165  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4396  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  28.48 
 
 
640 aa  164  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1194  sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.46 
 
 
564 aa  162  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2429  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.61 
 
 
462 aa  161  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.446728 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0841  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  27.15 
 
 
660 aa  161  5e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.68 
 
 
639 aa  160  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0070  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.48 
 
 
652 aa  160  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.972692  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1629  protein synthesis factor GTP-binding  35.19 
 
 
408 aa  160  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.418105  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11312  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  28.31 
 
 
614 aa  160  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0754  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  26.91 
 
 
660 aa  159  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1559  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.27 
 
 
599 aa  159  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909063  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2231  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.48 
 
 
442 aa  158  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0619463  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1530  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  28.84 
 
 
651 aa  158  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861038  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0834  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  28.11 
 
 
640 aa  157  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788536  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1400  sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.13 
 
 
645 aa  157  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2388  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.81 
 
 
438 aa  156  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2476  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.44 
 
 
438 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1860  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.44 
 
 
438 aa  156  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2520  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.81 
 
 
438 aa  156  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2471  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.44 
 
 
438 aa  156  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6984  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  32.84 
 
 
636 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0823  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.71 
 
 
438 aa  154  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.732187  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3828  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.45 
 
 
615 aa  154  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18760  sulfate adenylyltransferase subunit 1  28.57 
 
 
421 aa  154  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.97603  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5802  sulfate adenylyltransferase subunit 1  27.49 
 
 
438 aa  154  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1799  sulfate adenylyltransferase, large subunit  29.03 
 
 
807 aa  154  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0420  sulfate adenylyltransferase subunit 1  27.79 
 
 
422 aa  154  8e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0824  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.09 
 
 
636 aa  154  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.533102  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4017  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.21 
 
 
639 aa  154  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897015  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12980  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  27.29 
 
 
633 aa  154  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0158  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  26.45 
 
 
470 aa  154  8.999999999999999e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0740316  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0064  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.46 
 
 
617 aa  153  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1398  sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.56 
 
 
639 aa  153  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0369421  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0327  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  26.47 
 
 
631 aa  153  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.171522 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3933  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.19 
 
 
559 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>