More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1111 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1111  elongation factor 1-alpha  100 
 
 
444 aa  891    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0397  elongation factor 1-alpha  94.14 
 
 
444 aa  861    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209425  normal  0.0958678 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1731  elongation factor 1-alpha  95.72 
 
 
444 aa  865    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222772 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1362  elongation factor 1-alpha  96.4 
 
 
444 aa  871    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.91449  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1745  elongation factor 1-alpha  74.66 
 
 
444 aa  705    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1196  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  62.59 
 
 
435 aa  585  1e-166  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0041  elongation factor 1-alpha  60.97 
 
 
435 aa  580  1e-164  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000171412  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0647  elongation factor 1-alpha  62.62 
 
 
433 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000513743  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1553  elongation factor 1-alpha  57.44 
 
 
426 aa  521  1e-146  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0073  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  56.78 
 
 
424 aa  508  9.999999999999999e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000421656  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0699  elongation factor 1-alpha  54.52 
 
 
425 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.085121 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1441  elongation factor 1-alpha  54.29 
 
 
425 aa  499  1e-140  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.891927  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0730  elongation factor 1-alpha  56.38 
 
 
425 aa  499  1e-140  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425571  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0782  elongation factor 1-alpha  56.44 
 
 
428 aa  496  1e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1592  elongation factor 1-alpha  56.15 
 
 
425 aa  496  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1034  elongation factor 1-alpha  54.14 
 
 
432 aa  490  1e-137  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0821  elongation factor 1-alpha  56.64 
 
 
424 aa  486  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3685  elongation factor 1-alpha  55.63 
 
 
422 aa  482  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.222951 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1303  elongation factor 1-alpha  54.23 
 
 
428 aa  479  1e-134  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0680  elongation factor 1-alpha  53.99 
 
 
428 aa  479  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0208  elongation factor 1-alpha  54.23 
 
 
428 aa  479  1e-134  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371461  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0615  elongation factor 1-alpha  53.99 
 
 
428 aa  477  1e-133  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1170  elongation factor 1-alpha  54.74 
 
 
422 aa  474  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0156  elongation factor 1-alpha  52.72 
 
 
421 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3066  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  52.59 
 
 
420 aa  461  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2516  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  52 
 
 
420 aa  456  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0497  elongation factor 1-alpha  52.94 
 
 
420 aa  457  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3261  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  53.1 
 
 
423 aa  455  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664199  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0811  elongation factor 1-alpha  51.9 
 
 
423 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77514  translational elongation factor EF-1 alpha  48.06 
 
 
458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65303  Elongation factor 1-alpha (EF-1-alpha)  48.06 
 
 
458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.977722  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04218  elongation factor 1-alpha (Broad)  46.64 
 
 
468 aa  441  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300924  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01300  translation elongation factor EF1-alpha, putative  46.9 
 
 
459 aa  436  1e-121  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18475  translation elongation factor, EF-1, alpha subunit  49.41 
 
 
439 aa  436  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00280729  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28737  predicted protein  49.17 
 
 
439 aa  433  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723788  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01540  translation release factor, putative  37.85 
 
 
757 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27060  Eukaryotic elongation factor 1 alpha  37.61 
 
 
467 aa  300  4e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293222  hitchhiker  0.0000941001 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27198  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  37.61 
 
 
467 aa  300  4e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00593045 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29711  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  37.61 
 
 
467 aa  300  4e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105785  hitchhiker  0.00273357 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14961  predicted protein  37.72 
 
 
406 aa  298  2e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000165599  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04740  conserved hypothetical protein  38.8 
 
 
914 aa  296  7e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.810548  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83594  elongation release factor  37.47 
 
 
707 aa  293  5e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.432493  normal  0.18618 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02063  translation elongation factor EF-1 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04630)  38.27 
 
 
576 aa  287  2.9999999999999996e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02080  translation release factor eRF3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04820)  36.82 
 
 
708 aa  287  2.9999999999999996e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.38 
 
 
639 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3564  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.1 
 
 
641 aa  257  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34493  predicted protein  34.61 
 
 
447 aa  257  3e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4017  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.03 
 
 
639 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897015  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2764  adenylylsulfate kinase  33.87 
 
 
641 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1153  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.41 
 
 
642 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1042  adenylylsulfate kinase  33.41 
 
 
642 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36881  predicted protein  34.78 
 
 
481 aa  249  9e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416405  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1718  elongation factor Tu GTP binding domain-containing protein  34.81 
 
 
516 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1194  sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.94 
 
 
564 aa  248  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6984  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  32.79 
 
 
636 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0824  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.11 
 
 
636 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.533102  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12980  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  34.57 
 
 
633 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6447  sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.28 
 
 
601 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.832867  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5014  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  35.27 
 
 
632 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.688954  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57710  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  35.27 
 
 
633 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0878  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  34.51 
 
 
632 aa  237  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.844643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2537  adenylylsulfate kinase / sulfate adenylyltransferase subunit 1  34.34 
 
 
599 aa  237  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4126  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  33.18 
 
 
632 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4432  sulfate adenylate transferase, subunit 1/adenylylsulfate kinase  33.1 
 
 
632 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000187918  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4111  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.1 
 
 
598 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1629  protein synthesis factor GTP-binding  35.41 
 
 
408 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.418105  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4545  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  33.57 
 
 
633 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1304  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  33.57 
 
 
633 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4421  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  33.57 
 
 
633 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.643598  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1559  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.72 
 
 
599 aa  232  1e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909063  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0891  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  34.33 
 
 
631 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3126  Sulfate adenylyltransferase., Adenylyl-sulfate kinase  36.01 
 
 
626 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0911  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  32.94 
 
 
633 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634897  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1400  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.41 
 
 
645 aa  230  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3828  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.79 
 
 
615 aa  230  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3253  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  33.49 
 
 
644 aa  227  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438405  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  37.84 
 
 
396 aa  226  8e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  36.57 
 
 
400 aa  226  8e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  37.84 
 
 
396 aa  226  8e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48738  predicted protein  31.89 
 
 
581 aa  223  6e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.655952 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2586  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.43 
 
 
614 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8319  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  36.18 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2971  sulfate adenylate transferase, large subunit/adenylylsulfate kinase  31.43 
 
 
604 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  36.18 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  35.71 
 
 
397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  34.03 
 
 
399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  35.71 
 
 
397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  35.71 
 
 
397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  35.71 
 
 
397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3933  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.03 
 
 
559 aa  219  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  34.66 
 
 
400 aa  219  1e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1140  elongation factor Tu  34.48 
 
 
400 aa  218  1e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000019246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1290  elongation factor Tu  35.4 
 
 
400 aa  219  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000272484  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1396  elongation factor Tu  35.4 
 
 
400 aa  219  1e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.147055  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  36.61 
 
 
405 aa  218  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  36.61 
 
 
405 aa  218  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3933  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  31.15 
 
 
619 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1247  elongation factor Tu  34.63 
 
 
396 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.727206  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0792  elongation factor Tu  34.72 
 
 
399 aa  218  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.640379  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  34.17 
 
 
400 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>