More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2516 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0497  elongation factor 1-alpha  89.76 
 
 
420 aa  785    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0811  elongation factor 1-alpha  88.15 
 
 
423 aa  764    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3066  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  93.81 
 
 
420 aa  816    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2516  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  100 
 
 
420 aa  856    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3261  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  89.98 
 
 
423 aa  786    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664199  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0156  elongation factor 1-alpha  87.65 
 
 
421 aa  770    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0730  elongation factor 1-alpha  68.03 
 
 
425 aa  599  1e-170  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425571  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1553  elongation factor 1-alpha  66.35 
 
 
426 aa  598  1e-170  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1170  elongation factor 1-alpha  67.55 
 
 
422 aa  594  1e-169  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1441  elongation factor 1-alpha  63.7 
 
 
425 aa  588  1e-167  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.891927  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3685  elongation factor 1-alpha  65.38 
 
 
422 aa  587  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.222951 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0699  elongation factor 1-alpha  64.18 
 
 
425 aa  582  1.0000000000000001e-165  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.085121 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1592  elongation factor 1-alpha  65.14 
 
 
425 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0821  elongation factor 1-alpha  65.07 
 
 
424 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0782  elongation factor 1-alpha  61.96 
 
 
428 aa  555  1e-157  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0208  elongation factor 1-alpha  60.29 
 
 
428 aa  548  1e-155  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371461  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0073  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  60.05 
 
 
424 aa  550  1e-155  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000421656  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0615  elongation factor 1-alpha  60.77 
 
 
428 aa  550  1e-155  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1303  elongation factor 1-alpha  60.29 
 
 
428 aa  547  1e-154  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0680  elongation factor 1-alpha  59.81 
 
 
428 aa  543  1e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0647  elongation factor 1-alpha  52.45 
 
 
433 aa  484  1e-136  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000513743  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1196  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  52.1 
 
 
435 aa  479  1e-134  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1034  elongation factor 1-alpha  52.25 
 
 
432 aa  476  1e-133  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1731  elongation factor 1-alpha  52 
 
 
444 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222772 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0041  elongation factor 1-alpha  50 
 
 
435 aa  461  9.999999999999999e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000171412  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0397  elongation factor 1-alpha  51.76 
 
 
444 aa  461  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209425  normal  0.0958678 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1111  elongation factor 1-alpha  52 
 
 
444 aa  456  1e-127  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1362  elongation factor 1-alpha  52.24 
 
 
444 aa  456  1e-127  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.91449  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1745  elongation factor 1-alpha  50.35 
 
 
444 aa  452  1.0000000000000001e-126  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77514  translational elongation factor EF-1 alpha  48.05 
 
 
458 aa  449  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65303  Elongation factor 1-alpha (EF-1-alpha)  48.05 
 
 
458 aa  449  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.977722  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01300  translation elongation factor EF1-alpha, putative  48.63 
 
 
459 aa  443  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18475  translation elongation factor, EF-1, alpha subunit  50.72 
 
 
439 aa  441  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00280729  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28737  predicted protein  50.48 
 
 
439 aa  439  9.999999999999999e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723788  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04218  elongation factor 1-alpha (Broad)  46.73 
 
 
468 aa  436  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300924  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27198  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  37.42 
 
 
467 aa  310  4e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00593045 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29711  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  37.42 
 
 
467 aa  310  4e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105785  hitchhiker  0.00273357 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27060  Eukaryotic elongation factor 1 alpha  37.42 
 
 
467 aa  310  4e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293222  hitchhiker  0.0000941001 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04740  conserved hypothetical protein  37.96 
 
 
914 aa  283  5.000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.810548  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1194  sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.98 
 
 
564 aa  261  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.06 
 
 
639 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6447  sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.15 
 
 
601 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.832867  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02063  translation elongation factor EF-1 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04630)  36.78 
 
 
576 aa  258  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1718  elongation factor Tu GTP binding domain-containing protein  35.99 
 
 
516 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34493  predicted protein  34.55 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14961  predicted protein  34.32 
 
 
406 aa  253  3e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000165599  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83594  elongation release factor  32 
 
 
707 aa  253  6e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.432493  normal  0.18618 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02080  translation release factor eRF3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04820)  32.8 
 
 
708 aa  251  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3828  sulfate adenylyltransferase, large subunit  36.19 
 
 
615 aa  250  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0824  sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.58 
 
 
636 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.533102  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1153  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.82 
 
 
642 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1042  adenylylsulfate kinase  35.42 
 
 
642 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01540  translation release factor, putative  33.41 
 
 
757 aa  246  4e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4017  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.42 
 
 
639 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897015  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1629  protein synthesis factor GTP-binding  37.86 
 
 
408 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.418105  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2537  adenylylsulfate kinase / sulfate adenylyltransferase subunit 1  33.89 
 
 
599 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4111  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.64 
 
 
598 aa  238  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1400  sulfate adenylyltransferase, large subunit  36.06 
 
 
645 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6984  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  33.57 
 
 
636 aa  236  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3564  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.09 
 
 
641 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36881  predicted protein  33.49 
 
 
481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416405  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2971  sulfate adenylate transferase, large subunit/adenylylsulfate kinase  34.4 
 
 
604 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2586  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.4 
 
 
614 aa  234  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8319  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  36.43 
 
 
400 aa  231  1e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3175  elongation factor Tu  35.31 
 
 
395 aa  232  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  35.71 
 
 
397 aa  231  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  35.7 
 
 
395 aa  230  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  35.68 
 
 
396 aa  229  5e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  35.68 
 
 
396 aa  229  5e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1559  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.49 
 
 
599 aa  230  5e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909063  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0792  elongation factor Tu  35.27 
 
 
399 aa  229  6e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.640379  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2764  adenylylsulfate kinase  32.29 
 
 
641 aa  227  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0263  elongation factor Tu  36.07 
 
 
405 aa  227  3e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516793  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0250  elongation factor Tu  36.07 
 
 
405 aa  227  3e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  35.57 
 
 
397 aa  227  4e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  34.35 
 
 
395 aa  226  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  35.57 
 
 
397 aa  227  4e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  35.7 
 
 
395 aa  226  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  35.21 
 
 
397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0158  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.27 
 
 
470 aa  226  8e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0740316  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  35.43 
 
 
400 aa  225  9e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1530  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  34.12 
 
 
651 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861038  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3126  Sulfate adenylyltransferase., Adenylyl-sulfate kinase  35.42 
 
 
626 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  35.28 
 
 
400 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1396  elongation factor Tu  35.83 
 
 
400 aa  223  4e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.147055  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1290  elongation factor Tu  35.83 
 
 
400 aa  223  4e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000272484  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0396  translation elongation factor Tu  36.43 
 
 
395 aa  223  4e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2623  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.11 
 
 
470 aa  223  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0651162  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  35.66 
 
 
400 aa  223  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3456  elongation factor Tu  35.07 
 
 
395 aa  222  9e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0019954  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  34.89 
 
 
397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  34.62 
 
 
399 aa  220  3e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  34.19 
 
 
396 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  34.19 
 
 
396 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  34.43 
 
 
397 aa  220  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  34.84 
 
 
399 aa  220  3e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  35.68 
 
 
396 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  33.8 
 
 
396 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  33.8 
 
 
396 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  34.81 
 
 
396 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>