More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1629 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1629  protein synthesis factor GTP-binding  100 
 
 
408 aa  827    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.418105  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1400  sulfate adenylyltransferase, large subunit  41.28 
 
 
645 aa  311  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3564  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  41.29 
 
 
641 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0824  sulfate adenylyltransferase, large subunit  40.96 
 
 
636 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.533102  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1194  sulfate adenylyltransferase, large subunit  38.08 
 
 
564 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2764  adenylylsulfate kinase  40.75 
 
 
641 aa  303  5.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6984  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  41.54 
 
 
636 aa  302  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4017  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  40.65 
 
 
639 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897015  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1153  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  40.15 
 
 
642 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1042  adenylylsulfate kinase  40.79 
 
 
642 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  39.9 
 
 
639 aa  295  7e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3828  sulfate adenylyltransferase, large subunit  40.81 
 
 
615 aa  293  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6447  sulfate adenylyltransferase, large subunit  38.93 
 
 
601 aa  290  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.832867  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1718  elongation factor Tu GTP binding domain-containing protein  43.11 
 
 
516 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1559  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  43.3 
 
 
599 aa  276  4e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909063  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2537  adenylylsulfate kinase / sulfate adenylyltransferase subunit 1  36.34 
 
 
599 aa  265  7e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3126  Sulfate adenylyltransferase., Adenylyl-sulfate kinase  43.17 
 
 
626 aa  264  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4111  sulfate adenylyltransferase, large subunit  36.83 
 
 
598 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0497  elongation factor 1-alpha  39.08 
 
 
420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1441  elongation factor 1-alpha  35.42 
 
 
425 aa  247  2e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.891927  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0156  elongation factor 1-alpha  38.42 
 
 
421 aa  248  2e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3261  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  38.35 
 
 
423 aa  247  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664199  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0811  elongation factor 1-alpha  38.35 
 
 
423 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2516  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  37.86 
 
 
420 aa  246  4.9999999999999997e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0073  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  37.53 
 
 
424 aa  245  9.999999999999999e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000421656  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3066  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  37.62 
 
 
420 aa  243  6e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1553  elongation factor 1-alpha  36.32 
 
 
426 aa  242  9e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0782  elongation factor 1-alpha  36.9 
 
 
428 aa  242  1e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5496  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  40.06 
 
 
640 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0327  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  38.51 
 
 
631 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.171522 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1111  elongation factor 1-alpha  35.41 
 
 
444 aa  233  3e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4225  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  39.59 
 
 
647 aa  232  7.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279145  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0829  sulfate adenylyltransferase subunit 1  36.95 
 
 
543 aa  232  8.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0699  elongation factor 1-alpha  34.86 
 
 
425 aa  232  9e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.085121 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3334  sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.38 
 
 
630 aa  231  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.374493  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1034  elongation factor 1-alpha  36 
 
 
432 aa  231  2e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0041  elongation factor 1-alpha  34.75 
 
 
435 aa  231  2e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000171412  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0397  elongation factor 1-alpha  35.32 
 
 
444 aa  231  2e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209425  normal  0.0958678 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4560  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  35.34 
 
 
633 aa  230  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0730  elongation factor 1-alpha  35.66 
 
 
425 aa  230  4e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425571  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1196  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  35.31 
 
 
435 aa  229  7e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6267  sulfate adenylyltransferase, large subunit  36.3 
 
 
456 aa  229  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1303  elongation factor 1-alpha  36.19 
 
 
428 aa  229  8e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6191  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  35.34 
 
 
633 aa  229  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1731  elongation factor 1-alpha  34.45 
 
 
444 aa  229  9e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1235  sulfate adenylyltransferase, large subunit  39.32 
 
 
444 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1526  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  39.02 
 
 
633 aa  228  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465942 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0615  elongation factor 1-alpha  36.19 
 
 
428 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2225  sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.41 
 
 
435 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2692  sulfate adenylyltransferase subunit 1  35.73 
 
 
434 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561679  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0208  elongation factor 1-alpha  35.95 
 
 
428 aa  227  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371461  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1362  elongation factor 1-alpha  34.69 
 
 
444 aa  227  3e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.91449  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2685  sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.41 
 
 
443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1592  elongation factor 1-alpha  36.23 
 
 
425 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2421  sulfate adenylyltransferase subunit 1 protein  34.69 
 
 
435 aa  226  8e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0680  elongation factor 1-alpha  35.95 
 
 
428 aa  226  8e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1170  elongation factor 1-alpha  36.54 
 
 
422 aa  225  9e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1319  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.9 
 
 
621 aa  225  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.692528  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1398  sulfate adenylyltransferase, large subunit  37.86 
 
 
639 aa  223  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0369421  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0834  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  36.66 
 
 
640 aa  224  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788536  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3685  elongation factor 1-alpha  36.3 
 
 
422 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.222951 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2617  sulfate adenylyltransferase, large subunit  39.12 
 
 
445 aa  221  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3087  sulfate adenylyltransferase, large subunit  39.49 
 
 
416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.145056  hitchhiker  0.0072307 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1483  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.78 
 
 
447 aa  220  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2812  sulfate adenylyltransferase subunit 1  35.25 
 
 
434 aa  221  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0529477  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2231  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.21 
 
 
442 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0619463  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3222  sulfate adenylyltransferase subunit 1  42.3 
 
 
475 aa  220  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.312795 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12800  sulfate adenylyltransferase subunit 1  35.63 
 
 
425 aa  219  5e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3342  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  37.57 
 
 
640 aa  219  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.914743  normal  0.584003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0064  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  39.3 
 
 
617 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2476  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.77 
 
 
438 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1735  sulfate adenylyltransferase, large subunit  37.47 
 
 
476 aa  217  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.218793  normal  0.135983 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1498  sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.61 
 
 
486 aa  217  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.57722  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3059  sulfate adenylyltransferase subunit 1  37.04 
 
 
479 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5802  sulfate adenylyltransferase subunit 1  34.69 
 
 
438 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3124  sulfate adenylyltransferase subunit 1  35.32 
 
 
479 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.962542  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1860  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.93 
 
 
438 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2471  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.93 
 
 
438 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36583  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3085  sulfate adenylyltransferase subunit 1  37.04 
 
 
479 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2183  sulfate adenylyltransferase, large subunit  36.49 
 
 
537 aa  217  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1530  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  37.54 
 
 
651 aa  217  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861038  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3933  sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.84 
 
 
559 aa  217  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3244  sulfate adenylyltransferase subunit 1  37.28 
 
 
479 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2143  sulfate adenylyltransferase subunit 1  35.88 
 
 
471 aa  217  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1865  sulfate adenylyltransferase, large subunit  36.81 
 
 
551 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2987  Sulfate adenylyltransferase  33.9 
 
 
469 aa  216  7e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.410863  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2388  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.21 
 
 
438 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2735  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.95 
 
 
552 aa  216  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2520  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.21 
 
 
438 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2352  sulfate adenylyltransferase, large subunit  36.52 
 
 
551 aa  215  9e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.924472  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1617  sulfate adenylyltransferase subunit 1  38.94 
 
 
431 aa  216  9e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0937  sulfate adenylyltransferase, large subunit  41.04 
 
 
475 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3140  sulfate adenylyltransferase subunit 1  36.75 
 
 
479 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.167503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4003  sulfate adenylyltransferase subunit 1  41.04 
 
 
475 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3933  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  35.18 
 
 
619 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2889  sulfate adenylyltransferase subunit 1  41.04 
 
 
475 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2877  sulfate adenylyltransferase subunit 1  41.04 
 
 
475 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3660  sulfate adenylyltransferase subunit 1  34.68 
 
 
438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2960  Sulfate adenylyltransferase  33.9 
 
 
473 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.938148 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3992  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  35.18 
 
 
619 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.610707  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>