More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0073 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0073  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  100 
 
 
424 aa  872    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000421656  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0821  elongation factor 1-alpha  71.73 
 
 
424 aa  626  1e-178  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1553  elongation factor 1-alpha  67.14 
 
 
426 aa  620  1e-176  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0730  elongation factor 1-alpha  69.72 
 
 
425 aa  620  1e-176  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425571  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0699  elongation factor 1-alpha  66.9 
 
 
425 aa  610  1e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.085121 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1441  elongation factor 1-alpha  65.49 
 
 
425 aa  604  9.999999999999999e-173  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.891927  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1592  elongation factor 1-alpha  68.08 
 
 
425 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3685  elongation factor 1-alpha  67.69 
 
 
422 aa  597  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.222951 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1170  elongation factor 1-alpha  66.51 
 
 
422 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0156  elongation factor 1-alpha  61.08 
 
 
421 aa  564  1e-160  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3066  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  61.32 
 
 
420 aa  562  1.0000000000000001e-159  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1303  elongation factor 1-alpha  63.08 
 
 
428 aa  560  1e-158  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0680  elongation factor 1-alpha  63.32 
 
 
428 aa  561  1e-158  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3261  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  60 
 
 
423 aa  558  1e-158  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664199  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0208  elongation factor 1-alpha  62.7 
 
 
428 aa  558  1e-158  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371461  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0615  elongation factor 1-alpha  62.94 
 
 
428 aa  559  1e-158  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0782  elongation factor 1-alpha  62.7 
 
 
428 aa  555  1e-157  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1196  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  61.03 
 
 
435 aa  553  1e-156  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0497  elongation factor 1-alpha  60.38 
 
 
420 aa  551  1e-156  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0811  elongation factor 1-alpha  59.67 
 
 
423 aa  554  1e-156  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2516  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  60.05 
 
 
420 aa  550  1e-155  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0041  elongation factor 1-alpha  58.91 
 
 
435 aa  541  1e-153  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000171412  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0647  elongation factor 1-alpha  58.24 
 
 
433 aa  534  1e-150  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000513743  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1034  elongation factor 1-alpha  57.58 
 
 
432 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1731  elongation factor 1-alpha  56.78 
 
 
444 aa  510  1e-143  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222772 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1745  elongation factor 1-alpha  56.31 
 
 
444 aa  508  9.999999999999999e-143  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1111  elongation factor 1-alpha  56.78 
 
 
444 aa  508  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1362  elongation factor 1-alpha  56.31 
 
 
444 aa  503  1e-141  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.91449  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0397  elongation factor 1-alpha  55.61 
 
 
444 aa  503  1e-141  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209425  normal  0.0958678 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77514  translational elongation factor EF-1 alpha  54.85 
 
 
458 aa  498  1e-140  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65303  Elongation factor 1-alpha (EF-1-alpha)  54.85 
 
 
458 aa  498  1e-140  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.977722  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01300  translation elongation factor EF1-alpha, putative  55.08 
 
 
459 aa  490  1e-137  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04218  elongation factor 1-alpha (Broad)  52.77 
 
 
468 aa  479  1e-134  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300924  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18475  translation elongation factor, EF-1, alpha subunit  53.77 
 
 
439 aa  476  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00280729  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28737  predicted protein  53.54 
 
 
439 aa  473  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723788  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29711  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  40.04 
 
 
467 aa  349  6e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105785  hitchhiker  0.00273357 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27060  Eukaryotic elongation factor 1 alpha  40.04 
 
 
467 aa  349  6e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293222  hitchhiker  0.0000941001 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27198  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  40.04 
 
 
467 aa  349  6e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00593045 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02063  translation elongation factor EF-1 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04630)  40.38 
 
 
576 aa  298  9e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01540  translation release factor, putative  35.42 
 
 
757 aa  295  8e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34493  predicted protein  35.6 
 
 
447 aa  279  6e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83594  elongation release factor  34.89 
 
 
707 aa  274  2.0000000000000002e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.432493  normal  0.18618 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02080  translation release factor eRF3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04820)  35.4 
 
 
708 aa  272  1e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  36.47 
 
 
639 aa  266  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04740  conserved hypothetical protein  35.01 
 
 
914 aa  264  3e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.810548  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14961  predicted protein  33.99 
 
 
406 aa  259  4e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000165599  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6984  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  35.34 
 
 
636 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1718  elongation factor Tu GTP binding domain-containing protein  36.69 
 
 
516 aa  253  6e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0824  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.57 
 
 
636 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.533102  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3828  sulfate adenylyltransferase, large subunit  36.12 
 
 
615 aa  249  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1194  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.88 
 
 
564 aa  247  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3564  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.25 
 
 
641 aa  248  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1400  sulfate adenylyltransferase, large subunit  39.75 
 
 
645 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4111  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.49 
 
 
598 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36881  predicted protein  34.57 
 
 
481 aa  245  9e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1629  protein synthesis factor GTP-binding  37.53 
 
 
408 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.418105  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1559  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.22 
 
 
599 aa  243  5e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909063  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2623  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.93 
 
 
470 aa  243  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0651162  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1153  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.57 
 
 
642 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6447  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34 
 
 
601 aa  242  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.832867  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1042  adenylylsulfate kinase  33.01 
 
 
642 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4017  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.33 
 
 
639 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897015  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2537  adenylylsulfate kinase / sulfate adenylyltransferase subunit 1  33.89 
 
 
599 aa  240  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2764  adenylylsulfate kinase  32.3 
 
 
641 aa  239  8e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2890  Sulfate adenylyltransferase  34.04 
 
 
469 aa  230  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1526  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  33.25 
 
 
633 aa  228  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465942 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2143  sulfate adenylyltransferase subunit 1  32.55 
 
 
471 aa  227  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3933  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  32.45 
 
 
619 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3978  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.14 
 
 
422 aa  226  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  36.38 
 
 
400 aa  227  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1235  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.41 
 
 
444 aa  226  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2288  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.41 
 
 
424 aa  226  8e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3992  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  32.45 
 
 
619 aa  226  8e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.610707  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3918  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  32.45 
 
 
619 aa  226  8e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.720978  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11312  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  32.2 
 
 
614 aa  224  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3253  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  32.31 
 
 
644 aa  223  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2352  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.67 
 
 
551 aa  223  6e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.924472  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2735  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.46 
 
 
552 aa  223  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2617  sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.86 
 
 
445 aa  223  7e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1865  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.67 
 
 
551 aa  222  8e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0158  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.64 
 
 
470 aa  222  9.999999999999999e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0740316  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18760  sulfate adenylyltransferase subunit 1  32.69 
 
 
421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.97603  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4126  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  32.71 
 
 
632 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0891  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  32.94 
 
 
631 aa  221  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48738  predicted protein  32.58 
 
 
581 aa  221  3e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.655952 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4432  sulfate adenylate transferase, subunit 1/adenylylsulfate kinase  32.47 
 
 
632 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000187918  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0420  sulfate adenylyltransferase subunit 1  32.22 
 
 
422 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  35.36 
 
 
397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3933  sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.59 
 
 
559 aa  220  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0793  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.43 
 
 
426 aa  219  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  33.65 
 
 
400 aa  219  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0901  sulfate adenylyltransferase subunit 1  36.42 
 
 
480 aa  219  7e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2450  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  31.63 
 
 
631 aa  219  7.999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0878  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  33.18 
 
 
632 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.844643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5014  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  32.47 
 
 
632 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.688954  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  34.83 
 
 
396 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  34.83 
 
 
396 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3087  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.07 
 
 
416 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.145056  hitchhiker  0.0072307 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1751  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.26 
 
 
639 aa  218  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.425976  normal  0.0102171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0327  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  31.58 
 
 
631 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.171522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>