More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1553 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3685  elongation factor 1-alpha  72.99 
 
 		 422 aa  646    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.222951 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1441  elongation factor 1-alpha  73.82 
 
 		 425 aa  682    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.891927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1553  elongation factor 1-alpha  100 
 
 		 426 aa  879    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1592  elongation factor 1-alpha  76.65 
 
 		 425 aa  683    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1170  elongation factor 1-alpha  75.95 
 
 		 422 aa  675    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0699  elongation factor 1-alpha  87.03 
 
 		 425 aa  786    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.085121 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0821  elongation factor 1-alpha  71.93 
 
 		 424 aa  648    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0730  elongation factor 1-alpha  82.55 
 
 		 425 aa  731    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425571  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0073  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  67.14 
 
 		 424 aa  620  1e-176  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000421656  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0156  elongation factor 1-alpha  65.71 
 
 		 421 aa  610  1e-173  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0811  elongation factor 1-alpha  65.25 
 
 		 423 aa  601  1.0000000000000001e-171  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3066  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  66.11 
 
 		 420 aa  599  1e-170  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2516  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  66.35 
 
 		 420 aa  598  1e-170  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1303  elongation factor 1-alpha  66.74 
 
 		 428 aa  595  1e-169  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3261  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  64.22 
 
 		 423 aa  592  1e-168  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664199  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0615  elongation factor 1-alpha  66.51 
 
 		 428 aa  593  1e-168  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0208  elongation factor 1-alpha  66.28 
 
 		 428 aa  592  1e-168  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371461  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0782  elongation factor 1-alpha  65.11 
 
 		 428 aa  588  1e-167  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0680  elongation factor 1-alpha  65.34 
 
 		 428 aa  587  1e-166  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0497  elongation factor 1-alpha  64.42 
 
 		 420 aa  585  1e-166  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0647  elongation factor 1-alpha  59.35 
 
 		 433 aa  545  1e-154  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000513743  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1111  elongation factor 1-alpha  57.44 
 
 		 444 aa  521  1e-146  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0397  elongation factor 1-alpha  56.05 
 
 		 444 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209425  normal  0.0958678 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1731  elongation factor 1-alpha  56.51 
 
 		 444 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00222772 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1362  elongation factor 1-alpha  56.51 
 
 		 444 aa  512  1e-144  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.91449  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1034  elongation factor 1-alpha  56.53 
 
 		 432 aa  509  1e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1196  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  54.29 
 
 		 435 aa  500  1e-140  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65303  Elongation factor 1-alpha (EF-1-alpha)  53.41 
 
 		 458 aa  498  1e-140  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.977722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77514  translational elongation factor EF-1 alpha  53.41 
 
 		 458 aa  498  1e-140  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1745  elongation factor 1-alpha  53.49 
 
 		 444 aa  496  1e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0041  elongation factor 1-alpha  52.67 
 
 		 435 aa  493  9.999999999999999e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000171412  normal  0.193391 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04218  elongation factor 1-alpha (Broad)  51.46 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300924  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01300  translation elongation factor EF1-alpha, putative  52.16 
 
 		 459 aa  476  1e-133  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18475  translation elongation factor, EF-1, alpha subunit  52.1 
 
 		 439 aa  477  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00280729  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28737  predicted protein  51.87 
 
 		 439 aa  474  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723788  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27060  Eukaryotic elongation factor 1 alpha  38.46 
 
 		 467 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293222  hitchhiker  0.0000941001 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29711  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  38.46 
 
 		 467 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105785  hitchhiker  0.00273357 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27198  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  38.46 
 
 		 467 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00593045 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83594  elongation release factor  35.31 
 
 		 707 aa  281  1e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.432493  normal  0.18618 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02063  translation elongation factor EF-1 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04630)  37.83 
 
 		 576 aa  279  7e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04740  conserved hypothetical protein  36.16 
 
 		 914 aa  278  2e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.810548  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02080  translation release factor eRF3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04820)  34.25 
 
 		 708 aa  263  4e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01540  translation release factor, putative  34.35 
 
 		 757 aa  263  6e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1718  elongation factor Tu GTP binding domain-containing protein  36.72 
 
 		 516 aa  261  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14961  predicted protein  34.65 
 
 		 406 aa  261  2e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000165599  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1194  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.33 
 
 		 564 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34493  predicted protein  32.74 
 
 		 447 aa  254  1.0000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.41 
 
 		 639 aa  254  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36881  predicted protein  35.93 
 
 		 481 aa  252  9.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4111  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.73 
 
 		 598 aa  243  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6984  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  34.13 
 
 		 636 aa  243  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1629  protein synthesis factor GTP-binding  36.32 
 
 		 408 aa  242  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.418105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  36.82 
 
 		 400 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1042  adenylylsulfate kinase  33.1 
 
 		 642 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1153  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.86 
 
 		 642 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  35.53 
 
 		 400 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1290  elongation factor Tu  36.47 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000272484  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0824  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.86 
 
 		 636 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.533102  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1396  elongation factor Tu  36.47 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.147055  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2537  adenylylsulfate kinase / sulfate adenylyltransferase subunit 1  34.35 
 
 		 599 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1400  sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.28 
 
 		 645 aa  237  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3564  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.19 
 
 		 641 aa  236  6e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6447  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33 
 
 		 601 aa  236  7e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.832867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1559  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.67 
 
 		 599 aa  234  3e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909063  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0792  elongation factor Tu  35.45 
 
 		 399 aa  233  4.0000000000000004e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.640379  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4017  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.17 
 
 		 639 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897015  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1140  elongation factor Tu  36.26 
 
 		 400 aa  233  6e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000019246  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0263  elongation factor Tu  35.6 
 
 		 405 aa  233  7.000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516793  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0250  elongation factor Tu  35.6 
 
 		 405 aa  233  7.000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2764  adenylylsulfate kinase  30.95 
 
 		 641 aa  232  9e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6267  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.8 
 
 		 456 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3828  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.9 
 
 		 615 aa  231  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  35.63 
 
 		 395 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  34.98 
 
 		 396 aa  229  5e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  34.98 
 
 		 396 aa  229  5e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3253  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  33.02 
 
 		 644 aa  228  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  34.2 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2623  sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.77 
 
 		 470 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0651162  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  35.29 
 
 		 397 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  35.14 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  35.14 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23641  elongation factor Tu  35.85 
 
 		 399 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0829  sulfate adenylyltransferase subunit 1  33.01 
 
 		 543 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  35.55 
 
 		 399 aa  226  6e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  34.6 
 
 		 399 aa  226  8e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  35.06 
 
 		 396 aa  226  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  35.48 
 
 		 397 aa  226  8e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5496  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  34.47 
 
 		 640 aa  226  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  36.05 
 
 		 397 aa  225  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3456  elongation factor Tu  35.39 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0019954  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  34.51 
 
 		 396 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  34.51 
 
 		 396 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  36.05 
 
 		 397 aa  225  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2971  sulfate adenylate transferase, large subunit/adenylylsulfate kinase  32.52 
 
 		 604 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2586  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.52 
 
 		 614 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  35.39 
 
 		 395 aa  224  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12980  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  31.91 
 
 		 633 aa  223  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  34.05 
 
 		 399 aa  223  4e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12800  sulfate adenylyltransferase subunit 1  33.1 
 
 		 425 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1074  elongation factor Tu  35.7 
 
 		 399 aa  222  8e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>