More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_83594 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_83594  elongation release factor  100 
 
 
707 aa  1461    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.432493  normal  0.18618 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02080  translation release factor eRF3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04820)  54.43 
 
 
708 aa  625  1e-178  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01540  translation release factor, putative  56.58 
 
 
757 aa  579  1e-164  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14961  predicted protein  51.5 
 
 
406 aa  431  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000165599  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34493  predicted protein  47.4 
 
 
447 aa  413  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18475  translation elongation factor, EF-1, alpha subunit  40 
 
 
439 aa  328  2.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00280729  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28737  predicted protein  39.76 
 
 
439 aa  325  2e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723788  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0647  elongation factor 1-alpha  39.29 
 
 
433 aa  323  6e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000513743  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1196  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  38.5 
 
 
435 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65303  Elongation factor 1-alpha (EF-1-alpha)  38.13 
 
 
458 aa  306  1.0000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.977722  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77514  translational elongation factor EF-1 alpha  38.13 
 
 
458 aa  306  1.0000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1745  elongation factor 1-alpha  39.11 
 
 
444 aa  304  3.0000000000000004e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01300  translation elongation factor EF1-alpha, putative  38.18 
 
 
459 aa  303  5.000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04218  elongation factor 1-alpha (Broad)  36.18 
 
 
468 aa  297  4e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300924  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0041  elongation factor 1-alpha  36.71 
 
 
435 aa  294  3e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000171412  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1034  elongation factor 1-alpha  36.6 
 
 
432 aa  293  5e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1111  elongation factor 1-alpha  37.47 
 
 
444 aa  293  7e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1362  elongation factor 1-alpha  38.32 
 
 
444 aa  292  2e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.91449  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0397  elongation factor 1-alpha  37.24 
 
 
444 aa  292  2e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209425  normal  0.0958678 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1441  elongation factor 1-alpha  36.38 
 
 
425 aa  290  6e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.891927  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1731  elongation factor 1-alpha  37.7 
 
 
444 aa  290  7e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222772 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0699  elongation factor 1-alpha  36.02 
 
 
425 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.085121 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1553  elongation factor 1-alpha  35.31 
 
 
426 aa  282  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0821  elongation factor 1-alpha  36.47 
 
 
424 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04740  conserved hypothetical protein  35.62 
 
 
914 aa  274  5.000000000000001e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.810548  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0073  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  34.89 
 
 
424 aa  274  5.000000000000001e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000421656  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0782  elongation factor 1-alpha  36.56 
 
 
428 aa  269  1e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1170  elongation factor 1-alpha  34.83 
 
 
422 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0811  elongation factor 1-alpha  33.88 
 
 
423 aa  265  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0156  elongation factor 1-alpha  33.26 
 
 
421 aa  265  2e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0208  elongation factor 1-alpha  35.93 
 
 
428 aa  263  6e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371461  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0615  elongation factor 1-alpha  35.7 
 
 
428 aa  262  1e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1303  elongation factor 1-alpha  36.47 
 
 
428 aa  262  1e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1592  elongation factor 1-alpha  34.83 
 
 
425 aa  262  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0680  elongation factor 1-alpha  37.18 
 
 
428 aa  261  2e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3066  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  32.94 
 
 
420 aa  261  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0730  elongation factor 1-alpha  35.31 
 
 
425 aa  259  9e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3685  elongation factor 1-alpha  34.6 
 
 
422 aa  259  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.222951 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3261  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  33.41 
 
 
423 aa  257  4e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664199  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0497  elongation factor 1-alpha  33.41 
 
 
420 aa  257  5e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2516  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  32 
 
 
420 aa  252  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02063  translation elongation factor EF-1 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04630)  33.72 
 
 
576 aa  237  7e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48738  predicted protein  33.48 
 
 
581 aa  235  2.0000000000000002e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.655952 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36881  predicted protein  33.48 
 
 
481 aa  230  6e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416405  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29711  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  31.1 
 
 
467 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105785  hitchhiker  0.00273357 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27060  Eukaryotic elongation factor 1 alpha  31.1 
 
 
467 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293222  hitchhiker  0.0000941001 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27198  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  31.1 
 
 
467 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00593045 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15121  predicted protein  30.33 
 
 
450 aa  194  7e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00103501  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5479  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.51 
 
 
798 aa  165  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0197363  decreased coverage  0.00943774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1749  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  27.7 
 
 
642 aa  163  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1194  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.33 
 
 
564 aa  162  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3564  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  29.26 
 
 
641 aa  162  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2537  adenylylsulfate kinase / sulfate adenylyltransferase subunit 1  28.13 
 
 
599 aa  162  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3253  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  28.83 
 
 
644 aa  161  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438405  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3342  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  28.95 
 
 
640 aa  160  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.914743  normal  0.584003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6984  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  28.33 
 
 
636 aa  159  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1718  elongation factor Tu GTP binding domain-containing protein  27.23 
 
 
516 aa  158  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1235  sulfate adenylyltransferase, large subunit  26.98 
 
 
444 aa  158  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3978  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.34 
 
 
422 aa  158  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3593  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.93 
 
 
617 aa  157  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.876759  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1799  sulfate adenylyltransferase, large subunit  26.84 
 
 
807 aa  157  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1788  sulfate adenylyltransferase, large subunit  26.79 
 
 
476 aa  156  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2764  adenylylsulfate kinase  28.78 
 
 
641 aa  156  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4017  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  29.27 
 
 
639 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897015  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1526  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  28.51 
 
 
633 aa  156  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465942 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0933  sulfate adenylyltransferase, large subunit  26.33 
 
 
625 aa  155  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861181  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1860  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.89 
 
 
438 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2471  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.89 
 
 
438 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36583  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2476  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.89 
 
 
438 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1559  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.92 
 
 
599 aa  154  5e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909063  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2388  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.22 
 
 
438 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2450  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  28.38 
 
 
631 aa  154  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1400  sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.28 
 
 
645 aa  154  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1153  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.5 
 
 
642 aa  153  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4111  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.01 
 
 
598 aa  153  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2429  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.83 
 
 
462 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.446728 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1530  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  28.1 
 
 
651 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861038  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0158  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.87 
 
 
470 aa  152  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0740316  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2586  sulfate adenylyltransferase, large subunit  25.65 
 
 
614 aa  152  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8319  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0823  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.89 
 
 
438 aa  152  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.732187  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2520  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.99 
 
 
438 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2971  sulfate adenylate transferase, large subunit/adenylylsulfate kinase  25.65 
 
 
604 aa  152  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1068  sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.28 
 
 
652 aa  152  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1260  sulfate adenylyltransferase subunit 1  26.96 
 
 
558 aa  151  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0427263  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.15 
 
 
639 aa  150  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5802  sulfate adenylyltransferase subunit 1  28.44 
 
 
438 aa  150  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3918  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  27.04 
 
 
619 aa  150  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.720978  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3992  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  27.04 
 
 
619 aa  150  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.610707  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3933  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  27.1 
 
 
619 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1483  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.12 
 
 
447 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2735  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.17 
 
 
552 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4225  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.12 
 
 
647 aa  148  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279145  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2024  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.13 
 
 
415 aa  148  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.216556 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2231  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.73 
 
 
442 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0619463  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0824  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.71 
 
 
636 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.533102  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4662  sulfate adenylyltransferase, large subunit  25.8 
 
 
429 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0841  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  26.12 
 
 
660 aa  148  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3828  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.23 
 
 
615 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6308  sulfate adenylyltransferase, large subunit  26.45 
 
 
449 aa  147  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1042  adenylylsulfate kinase  28.74 
 
 
642 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>