More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0647 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0647  elongation factor 1-alpha  100 
 
 		 433 aa  882    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000513743  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1196  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  63.95 
 
 		 435 aa  588  1e-167  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0041  elongation factor 1-alpha  62.3 
 
 		 435 aa  578  1e-164  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000171412  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1111  elongation factor 1-alpha  62.62 
 
 		 444 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0397  elongation factor 1-alpha  63.08 
 
 		 444 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209425  normal  0.0958678 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1745  elongation factor 1-alpha  61.92 
 
 		 444 aa  570  1e-161  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1731  elongation factor 1-alpha  61.45 
 
 		 444 aa  568  1e-161  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00222772 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1362  elongation factor 1-alpha  61.45 
 
 		 444 aa  566  1e-160  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.91449  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1553  elongation factor 1-alpha  59.35 
 
 		 426 aa  545  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1034  elongation factor 1-alpha  59.91 
 
 		 432 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0821  elongation factor 1-alpha  60.61 
 
 		 424 aa  536  1e-151  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0073  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  58.24 
 
 		 424 aa  534  1e-150  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000421656  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1441  elongation factor 1-alpha  58.18 
 
 		 425 aa  532  1e-150  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.891927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0699  elongation factor 1-alpha  56.78 
 
 		 425 aa  530  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.085121 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0730  elongation factor 1-alpha  56.91 
 
 		 425 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3685  elongation factor 1-alpha  57.34 
 
 		 422 aa  511  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.222951 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0208  elongation factor 1-alpha  57.48 
 
 		 428 aa  509  1e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371461  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1592  elongation factor 1-alpha  56.84 
 
 		 425 aa  511  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1170  elongation factor 1-alpha  57.18 
 
 		 422 aa  510  1e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0615  elongation factor 1-alpha  57.24 
 
 		 428 aa  508  1e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1303  elongation factor 1-alpha  57.01 
 
 		 428 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0680  elongation factor 1-alpha  55.84 
 
 		 428 aa  499  1e-140  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65303  Elongation factor 1-alpha (EF-1-alpha)  51.8 
 
 		 458 aa  494  9.999999999999999e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.977722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77514  translational elongation factor EF-1 alpha  51.8 
 
 		 458 aa  494  9.999999999999999e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0782  elongation factor 1-alpha  55.24 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0156  elongation factor 1-alpha  52.94 
 
 		 421 aa  491  9.999999999999999e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0811  elongation factor 1-alpha  52.9 
 
 		 423 aa  490  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3261  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  53.15 
 
 		 423 aa  491  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664199  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01300  translation elongation factor EF1-alpha, putative  52.25 
 
 		 459 aa  484  1e-136  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18475  translation elongation factor, EF-1, alpha subunit  53.86 
 
 		 439 aa  485  1e-136  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00280729  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0497  elongation factor 1-alpha  53.61 
 
 		 420 aa  487  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3066  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  53.15 
 
 		 420 aa  488  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2516  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  52.45 
 
 		 420 aa  484  1e-135  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28737  predicted protein  53.63 
 
 		 439 aa  483  1e-135  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723788  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04218  elongation factor 1-alpha (Broad)  51 
 
 		 468 aa  472  1e-132  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300924  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83594  elongation release factor  39.29 
 
 		 707 aa  322  6e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.432493  normal  0.18618 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01540  translation release factor, putative  40.47 
 
 		 757 aa  322  9.000000000000001e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02080  translation release factor eRF3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04820)  39.04 
 
 		 708 aa  320  3e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29711  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  37.63 
 
 		 467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105785  hitchhiker  0.00273357 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27198  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  37.63 
 
 		 467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00593045 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27060  Eukaryotic elongation factor 1 alpha  37.63 
 
 		 467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293222  hitchhiker  0.0000941001 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14961  predicted protein  39.05 
 
 		 406 aa  312  7.999999999999999e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000165599  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04740  conserved hypothetical protein  39.63 
 
 		 914 aa  312  9e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.810548  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02063  translation elongation factor EF-1 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04630)  38.84 
 
 		 576 aa  303  5.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34493  predicted protein  37.7 
 
 		 447 aa  287  2.9999999999999996e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36881  predicted protein  35.31 
 
 		 481 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416405  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48738  predicted protein  34.92 
 
 		 581 aa  257  3e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.655952 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1718  elongation factor Tu GTP binding domain-containing protein  35.5 
 
 		 516 aa  252  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.34 
 
 		 639 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3564  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.57 
 
 		 641 aa  245  9e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2764  adenylylsulfate kinase  33.57 
 
 		 641 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0824  sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.12 
 
 		 636 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.533102  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6984  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  35.28 
 
 		 636 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4017  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.28 
 
 		 639 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897015  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6447  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.44 
 
 		 601 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.832867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1042  adenylylsulfate kinase  33.88 
 
 		 642 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1153  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.03 
 
 		 642 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1400  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.04 
 
 		 645 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3828  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.63 
 
 		 615 aa  229  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15121  predicted protein  31.33 
 
 		 450 aa  228  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00103501  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1194  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.65 
 
 		 564 aa  226  8e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1559  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.48 
 
 		 599 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909063  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2537  adenylylsulfate kinase / sulfate adenylyltransferase subunit 1  33.26 
 
 		 599 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4111  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.24 
 
 		 598 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  35.29 
 
 		 405 aa  219  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  35.29 
 
 		 405 aa  219  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  34.77 
 
 		 400 aa  218  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  36.16 
 
 		 396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  36.16 
 
 		 396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1140  translation elongation factor Tu  35.08 
 
 		 398 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000136434  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0460  translation elongation factor Tu  35.08 
 
 		 398 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  35.16 
 
 		 400 aa  216  9e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  35.16 
 
 		 400 aa  216  9e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  35.57 
 
 		 400 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  34.55 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  35.03 
 
 		 399 aa  210  3e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  35.09 
 
 		 396 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  35.09 
 
 		 396 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1629  protein synthesis factor GTP-binding  34.04 
 
 		 408 aa  210  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.418105  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  35.09 
 
 		 396 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  35.09 
 
 		 396 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1290  elongation factor Tu  35.32 
 
 		 400 aa  209  5e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000272484  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1396  elongation factor Tu  35.32 
 
 		 400 aa  209  5e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.147055  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1287  elongation factor Tu  33.03 
 
 		 409 aa  209  7e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2690  translation elongation factor Tu  33.48 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000740208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  34.7 
 
 		 396 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2909  translation elongation factor Tu  33.48 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.124736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3126  Sulfate adenylyltransferase., Adenylyl-sulfate kinase  34.05 
 
 		 626 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  34.69 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1247  elongation factor Tu  34.39 
 
 		 396 aa  207  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.727206  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1536  elongation factor Tu  33.18 
 
 		 409 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3933  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.25 
 
 		 619 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1561  elongation factor Tu  33.18 
 
 		 409 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.052718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  34.7 
 
 		 400 aa  207  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1235  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.78 
 
 		 444 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0263  elongation factor Tu  35.08 
 
 		 405 aa  206  6e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516793  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0250  elongation factor Tu  35.08 
 
 		 405 aa  206  6e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  33.94 
 
 		 400 aa  206  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  33.94 
 
 		 399 aa  206  8e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3992  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.25 
 
 		 619 aa  206  9e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.610707  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>