More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0497 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0811  elongation factor 1-alpha  88.46 
 
 		 423 aa  753    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0497  elongation factor 1-alpha  100 
 
 		 420 aa  852    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3261  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  89.34 
 
 		 423 aa  776    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664199  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3066  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  92.14 
 
 		 420 aa  796    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2516  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  89.76 
 
 		 420 aa  785    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0156  elongation factor 1-alpha  90.02 
 
 		 421 aa  781    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0730  elongation factor 1-alpha  66.35 
 
 		 425 aa  585  1e-166  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425571  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1553  elongation factor 1-alpha  64.42 
 
 		 426 aa  585  1e-166  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1170  elongation factor 1-alpha  66.27 
 
 		 422 aa  580  1e-164  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0699  elongation factor 1-alpha  63.22 
 
 		 425 aa  575  1.0000000000000001e-163  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.085121 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1441  elongation factor 1-alpha  62.74 
 
 		 425 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.891927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3685  elongation factor 1-alpha  64.66 
 
 		 422 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.222951 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1592  elongation factor 1-alpha  65.62 
 
 		 425 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0821  elongation factor 1-alpha  65.31 
 
 		 424 aa  570  1e-161  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0073  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  60.38 
 
 		 424 aa  551  1e-156  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000421656  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1303  elongation factor 1-alpha  61.48 
 
 		 428 aa  548  1e-155  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0782  elongation factor 1-alpha  61.72 
 
 		 428 aa  548  1e-155  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0208  elongation factor 1-alpha  61.72 
 
 		 428 aa  550  1e-155  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371461  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0615  elongation factor 1-alpha  61.72 
 
 		 428 aa  549  1e-155  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0680  elongation factor 1-alpha  61.24 
 
 		 428 aa  543  1e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0647  elongation factor 1-alpha  53.61 
 
 		 433 aa  487  1e-136  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000513743  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1034  elongation factor 1-alpha  53.27 
 
 		 432 aa  483  1e-135  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1196  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  52.8 
 
 		 435 aa  478  1e-134  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0041  elongation factor 1-alpha  50 
 
 		 435 aa  462  1e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000171412  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0397  elongation factor 1-alpha  52.24 
 
 		 444 aa  462  1e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209425  normal  0.0958678 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1731  elongation factor 1-alpha  53.18 
 
 		 444 aa  462  1e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00222772 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1745  elongation factor 1-alpha  52.49 
 
 		 444 aa  459  9.999999999999999e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1111  elongation factor 1-alpha  52.94 
 
 		 444 aa  457  1e-127  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1362  elongation factor 1-alpha  52.94 
 
 		 444 aa  457  1e-127  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.91449  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65303  Elongation factor 1-alpha (EF-1-alpha)  48.97 
 
 		 458 aa  448  1.0000000000000001e-124  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.977722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77514  translational elongation factor EF-1 alpha  48.97 
 
 		 458 aa  448  1.0000000000000001e-124  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01300  translation elongation factor EF1-alpha, putative  48.74 
 
 		 459 aa  443  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28737  predicted protein  50.96 
 
 		 439 aa  440  9.999999999999999e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723788  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18475  translation elongation factor, EF-1, alpha subunit  50.96 
 
 		 439 aa  439  9.999999999999999e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00280729  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04218  elongation factor 1-alpha (Broad)  46.95 
 
 		 468 aa  430  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300924  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27060  Eukaryotic elongation factor 1 alpha  37.72 
 
 		 467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293222  hitchhiker  0.0000941001 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27198  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  37.72 
 
 		 467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00593045 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29711  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  37.72 
 
 		 467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105785  hitchhiker  0.00273357 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04740  conserved hypothetical protein  38.19 
 
 		 914 aa  282  7.000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.810548  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.99 
 
 		 639 aa  270  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6447  sulfate adenylyltransferase, large subunit  37.04 
 
 		 601 aa  269  7e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.832867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1718  elongation factor Tu GTP binding domain-containing protein  38.16 
 
 		 516 aa  265  8e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1194  sulfate adenylyltransferase, large subunit  36.48 
 
 		 564 aa  261  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83594  elongation release factor  33.41 
 
 		 707 aa  258  2e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.432493  normal  0.18618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3828  sulfate adenylyltransferase, large subunit  37.86 
 
 		 615 aa  256  7e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02063  translation elongation factor EF-1 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04630)  36.78 
 
 		 576 aa  255  1.0000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0824  sulfate adenylyltransferase, large subunit  36.78 
 
 		 636 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.533102  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1629  protein synthesis factor GTP-binding  39.08 
 
 		 408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.418105  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4017  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  36.87 
 
 		 639 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897015  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1153  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  37.02 
 
 		 642 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1042  adenylylsulfate kinase  36.78 
 
 		 642 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34493  predicted protein  35.24 
 
 		 447 aa  251  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14961  predicted protein  34.59 
 
 		 406 aa  250  4e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000165599  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6984  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  35.99 
 
 		 636 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02080  translation release factor eRF3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04820)  32.8 
 
 		 708 aa  247  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01540  translation release factor, putative  33.57 
 
 		 757 aa  246  6e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2537  adenylylsulfate kinase / sulfate adenylyltransferase subunit 1  35.07 
 
 		 599 aa  246  8e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1400  sulfate adenylyltransferase, large subunit  38.03 
 
 		 645 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2764  adenylylsulfate kinase  34.94 
 
 		 641 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3564  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.02 
 
 		 641 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36881  predicted protein  34.42 
 
 		 481 aa  240  4e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4111  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.04 
 
 		 598 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1559  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.17 
 
 		 599 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909063  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3126  Sulfate adenylyltransferase., Adenylyl-sulfate kinase  36.8 
 
 		 626 aa  230  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2586  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.54 
 
 		 614 aa  230  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2971  sulfate adenylate transferase, large subunit/adenylylsulfate kinase  34.62 
 
 		 604 aa  230  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1530  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  35.52 
 
 		 651 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861038  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3175  elongation factor Tu  36.26 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2623  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.78 
 
 		 470 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0651162  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0792  elongation factor Tu  36.13 
 
 		 399 aa  227  3e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.640379  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  36.45 
 
 		 397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  35.46 
 
 		 395 aa  226  8e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0250  elongation factor Tu  36.15 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0263  elongation factor Tu  36.15 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516793  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  36.3 
 
 		 396 aa  225  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  36.3 
 
 		 396 aa  225  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  35.31 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  36.36 
 
 		 395 aa  223  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  36.05 
 
 		 400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0158  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.85 
 
 		 470 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0740316  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  35.65 
 
 		 397 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  35.65 
 
 		 397 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  36.07 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  36.45 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  35.83 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3253  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  34.55 
 
 		 644 aa  221  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  35.98 
 
 		 400 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  34.8 
 
 		 395 aa  220  5e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  35.55 
 
 		 397 aa  219  5e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  35.55 
 
 		 396 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  34.79 
 
 		 396 aa  219  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  35.35 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  35.35 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  34.43 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  35.9 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  35.83 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  34.43 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  34.43 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  36.41 
 
 		 396 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  36.41 
 
 		 396 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>