More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1362 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1362  elongation factor 1-alpha  100 
 
 
444 aa  894    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.91449  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1111  elongation factor 1-alpha  96.4 
 
 
444 aa  871    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1731  elongation factor 1-alpha  95.05 
 
 
444 aa  865    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222772 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1745  elongation factor 1-alpha  75.34 
 
 
444 aa  706    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0397  elongation factor 1-alpha  93.02 
 
 
444 aa  860    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209425  normal  0.0958678 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1196  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  61.89 
 
 
435 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0041  elongation factor 1-alpha  60.51 
 
 
435 aa  579  1e-164  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000171412  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0647  elongation factor 1-alpha  61.45 
 
 
433 aa  566  1e-160  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000513743  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1553  elongation factor 1-alpha  56.51 
 
 
426 aa  512  1e-144  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0073  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  56.31 
 
 
424 aa  503  1e-141  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000421656  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1441  elongation factor 1-alpha  54.06 
 
 
425 aa  497  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.891927  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1592  elongation factor 1-alpha  55.92 
 
 
425 aa  494  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0699  elongation factor 1-alpha  53.83 
 
 
425 aa  496  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.085121 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0730  elongation factor 1-alpha  55.92 
 
 
425 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425571  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1034  elongation factor 1-alpha  54.37 
 
 
432 aa  491  9.999999999999999e-139  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0782  elongation factor 1-alpha  55.74 
 
 
428 aa  490  1e-137  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0821  elongation factor 1-alpha  56.18 
 
 
424 aa  485  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1303  elongation factor 1-alpha  54.23 
 
 
428 aa  479  1e-134  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0208  elongation factor 1-alpha  54.23 
 
 
428 aa  479  1e-134  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371461  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3685  elongation factor 1-alpha  54.69 
 
 
422 aa  477  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.222951 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0680  elongation factor 1-alpha  53.76 
 
 
428 aa  476  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0615  elongation factor 1-alpha  53.99 
 
 
428 aa  476  1e-133  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1170  elongation factor 1-alpha  54.03 
 
 
422 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3066  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  52.59 
 
 
420 aa  462  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0156  elongation factor 1-alpha  52.72 
 
 
421 aa  464  1e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3261  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  52.86 
 
 
423 aa  455  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664199  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2516  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  52.24 
 
 
420 aa  456  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0497  elongation factor 1-alpha  52.94 
 
 
420 aa  457  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0811  elongation factor 1-alpha  51.9 
 
 
423 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65303  Elongation factor 1-alpha (EF-1-alpha)  48.29 
 
 
458 aa  450  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.977722  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77514  translational elongation factor EF-1 alpha  48.29 
 
 
458 aa  450  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0163736 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04218  elongation factor 1-alpha (Broad)  46.85 
 
 
468 aa  439  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300924  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01300  translation elongation factor EF1-alpha, putative  47.36 
 
 
459 aa  436  1e-121  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18475  translation elongation factor, EF-1, alpha subunit  49.65 
 
 
439 aa  436  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00280729  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28737  predicted protein  49.41 
 
 
439 aa  434  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723788  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01540  translation release factor, putative  38.32 
 
 
757 aa  311  1e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29711  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  38.26 
 
 
467 aa  305  9.000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105785  hitchhiker  0.00273357 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27198  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  38.26 
 
 
467 aa  305  9.000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00593045 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27060  Eukaryotic elongation factor 1 alpha  38.26 
 
 
467 aa  305  9.000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293222  hitchhiker  0.0000941001 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04740  conserved hypothetical protein  38.94 
 
 
914 aa  298  1e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.810548  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14961  predicted protein  37.97 
 
 
406 aa  295  1e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000165599  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83594  elongation release factor  38.32 
 
 
707 aa  291  1e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.432493  normal  0.18618 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02080  translation release factor eRF3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04820)  36.59 
 
 
708 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02063  translation elongation factor EF-1 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04630)  37.81 
 
 
576 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.61 
 
 
639 aa  259  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3564  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.33 
 
 
641 aa  259  9e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34493  predicted protein  34.61 
 
 
447 aa  259  9e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4017  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.27 
 
 
639 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897015  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1153  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.63 
 
 
642 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2764  adenylylsulfate kinase  33.87 
 
 
641 aa  252  7e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1042  adenylylsulfate kinase  33.63 
 
 
642 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1718  elongation factor Tu GTP binding domain-containing protein  35.05 
 
 
516 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6984  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  32.79 
 
 
636 aa  249  8e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0824  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.33 
 
 
636 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.533102  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36881  predicted protein  33.87 
 
 
481 aa  247  3e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416405  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6447  sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.28 
 
 
601 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.832867  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1194  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.96 
 
 
564 aa  242  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5014  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  34.8 
 
 
632 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.688954  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57710  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  35.03 
 
 
633 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0878  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  34.51 
 
 
632 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.844643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2537  adenylylsulfate kinase / sulfate adenylyltransferase subunit 1  34.25 
 
 
599 aa  236  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12980  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  33.87 
 
 
633 aa  235  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4545  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  33.8 
 
 
633 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4126  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  33.18 
 
 
632 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1304  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  33.8 
 
 
633 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4421  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  33.8 
 
 
633 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.643598  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0891  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  34.1 
 
 
631 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4432  sulfate adenylate transferase, subunit 1/adenylylsulfate kinase  33.1 
 
 
632 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000187918  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0911  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  33.18 
 
 
633 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634897  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4111  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.72 
 
 
598 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1559  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.72 
 
 
599 aa  230  4e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909063  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3828  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.79 
 
 
615 aa  229  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1400  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.94 
 
 
645 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3253  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  33.65 
 
 
644 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1629  protein synthesis factor GTP-binding  34.69 
 
 
408 aa  227  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.418105  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2971  sulfate adenylate transferase, large subunit/adenylylsulfate kinase  31.67 
 
 
604 aa  225  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3126  Sulfate adenylyltransferase., Adenylyl-sulfate kinase  35.01 
 
 
626 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2586  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.67 
 
 
614 aa  225  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8319  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3933  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.72 
 
 
559 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  36.11 
 
 
400 aa  222  9e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48738  predicted protein  32.12 
 
 
581 aa  222  9e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.655952 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  36.7 
 
 
396 aa  219  6e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  36.7 
 
 
396 aa  219  6e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1865  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.12 
 
 
551 aa  219  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  33.8 
 
 
399 aa  219  7.999999999999999e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3933  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  31.15 
 
 
619 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15121  predicted protein  31.57 
 
 
450 aa  218  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00103501  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  35.48 
 
 
396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  35.48 
 
 
396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11312  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  32.79 
 
 
614 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2352  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.44 
 
 
551 aa  216  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.924472  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3918  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  31.15 
 
 
619 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.720978  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2623  sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.42 
 
 
470 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0651162  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3992  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  31.15 
 
 
619 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.610707  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  33.72 
 
 
400 aa  216  7e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  34.35 
 
 
400 aa  216  8e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  33.56 
 
 
399 aa  216  9e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1530  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  32.24 
 
 
651 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861038  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3456  elongation factor Tu  34.64 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0019954  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  35.93 
 
 
405 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>