More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1745 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1731  elongation factor 1-alpha  75.79 
 
 
444 aa  711    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222772 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1362  elongation factor 1-alpha  75.34 
 
 
444 aa  706    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.91449  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1111  elongation factor 1-alpha  74.66 
 
 
444 aa  705    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1745  elongation factor 1-alpha  100 
 
 
444 aa  897    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0397  elongation factor 1-alpha  75.11 
 
 
444 aa  713    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209425  normal  0.0958678 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1196  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  63.28 
 
 
435 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0041  elongation factor 1-alpha  62.82 
 
 
435 aa  583  1.0000000000000001e-165  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000171412  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0647  elongation factor 1-alpha  61.92 
 
 
433 aa  570  1e-161  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000513743  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0073  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  56.31 
 
 
424 aa  508  9.999999999999999e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000421656  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1553  elongation factor 1-alpha  53.49 
 
 
426 aa  496  1e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1441  elongation factor 1-alpha  53.76 
 
 
425 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.891927  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1034  elongation factor 1-alpha  53.66 
 
 
432 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0699  elongation factor 1-alpha  53.49 
 
 
425 aa  494  9.999999999999999e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.085121 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0821  elongation factor 1-alpha  54.31 
 
 
424 aa  479  1e-134  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0208  elongation factor 1-alpha  53.05 
 
 
428 aa  476  1e-133  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371461  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0730  elongation factor 1-alpha  53.26 
 
 
425 aa  477  1e-133  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1303  elongation factor 1-alpha  53.05 
 
 
428 aa  474  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0615  elongation factor 1-alpha  52.82 
 
 
428 aa  474  1e-132  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1592  elongation factor 1-alpha  52.94 
 
 
425 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0156  elongation factor 1-alpha  51.77 
 
 
421 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0782  elongation factor 1-alpha  52.93 
 
 
428 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0680  elongation factor 1-alpha  52.11 
 
 
428 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1170  elongation factor 1-alpha  51.88 
 
 
422 aa  462  1e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0497  elongation factor 1-alpha  52.49 
 
 
420 aa  459  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3685  elongation factor 1-alpha  51.41 
 
 
422 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.222951 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3066  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  51.18 
 
 
420 aa  460  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0811  elongation factor 1-alpha  51.43 
 
 
423 aa  455  1e-127  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65303  Elongation factor 1-alpha (EF-1-alpha)  49.88 
 
 
458 aa  456  1e-127  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.977722  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3261  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  51.67 
 
 
423 aa  457  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664199  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77514  translational elongation factor EF-1 alpha  49.88 
 
 
458 aa  456  1e-127  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2516  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  50.35 
 
 
420 aa  452  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01300  translation elongation factor EF1-alpha, putative  49.31 
 
 
459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18475  translation elongation factor, EF-1, alpha subunit  50.12 
 
 
439 aa  442  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00280729  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04218  elongation factor 1-alpha (Broad)  48.17 
 
 
468 aa  441  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300924  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28737  predicted protein  49.88 
 
 
439 aa  439  9.999999999999999e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723788  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27060  Eukaryotic elongation factor 1 alpha  38.91 
 
 
467 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293222  hitchhiker  0.0000941001 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27198  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  38.91 
 
 
467 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00593045 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29711  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  38.91 
 
 
467 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105785  hitchhiker  0.00273357 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04740  conserved hypothetical protein  40.14 
 
 
914 aa  306  3e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.810548  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01540  translation release factor, putative  39.49 
 
 
757 aa  305  8.000000000000001e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83594  elongation release factor  39.11 
 
 
707 aa  304  2.0000000000000002e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.432493  normal  0.18618 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14961  predicted protein  38.46 
 
 
406 aa  298  1e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000165599  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02080  translation release factor eRF3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04820)  37.95 
 
 
708 aa  295  8e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02063  translation elongation factor EF-1 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04630)  39.62 
 
 
576 aa  292  7e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  37.01 
 
 
639 aa  264  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34493  predicted protein  35.87 
 
 
447 aa  263  4.999999999999999e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36881  predicted protein  34.79 
 
 
481 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416405  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1194  sulfate adenylyltransferase, large subunit  36.99 
 
 
564 aa  251  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1718  elongation factor Tu GTP binding domain-containing protein  35.95 
 
 
516 aa  247  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48738  predicted protein  33.78 
 
 
581 aa  248  2e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.655952 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3564  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.56 
 
 
641 aa  243  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6984  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  34.02 
 
 
636 aa  242  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6447  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.79 
 
 
601 aa  242  9e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.832867  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4017  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.49 
 
 
639 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897015  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1153  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.49 
 
 
642 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1559  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.41 
 
 
599 aa  238  1e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909063  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2764  adenylylsulfate kinase  33.1 
 
 
641 aa  238  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0824  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.95 
 
 
636 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.533102  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1042  adenylylsulfate kinase  33.26 
 
 
642 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4111  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.8 
 
 
598 aa  232  9e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2537  adenylylsulfate kinase / sulfate adenylyltransferase subunit 1  33.72 
 
 
599 aa  230  4e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5014  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  34.64 
 
 
632 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.688954  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1526  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  36.13 
 
 
633 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465942 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1400  sulfate adenylyltransferase, large subunit  35 
 
 
645 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3253  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  33.64 
 
 
644 aa  226  7e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438405  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0841  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  34.2 
 
 
660 aa  226  8e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3828  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.63 
 
 
615 aa  225  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29780  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  36.09 
 
 
396 aa  225  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.573725 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57710  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  34.41 
 
 
633 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0585  translation elongation factor Tu  36.01 
 
 
396 aa  224  3e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344387  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0754  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  34.43 
 
 
660 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  34.1 
 
 
399 aa  223  6e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  36.24 
 
 
397 aa  222  8e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  36.24 
 
 
397 aa  222  8e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  36.24 
 
 
397 aa  222  8e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  36.24 
 
 
397 aa  222  8e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3186  sulfate adenylyltransferase subunit 1  34.35 
 
 
480 aa  222  9e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  37.19 
 
 
405 aa  222  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  36.87 
 
 
396 aa  222  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12980  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  33.56 
 
 
633 aa  222  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1247  elongation factor Tu  35.39 
 
 
396 aa  222  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.727206  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  36.87 
 
 
396 aa  222  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  37.19 
 
 
405 aa  222  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4432  sulfate adenylate transferase, subunit 1/adenylylsulfate kinase  33.96 
 
 
632 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000187918  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4126  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  34.04 
 
 
632 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  35.48 
 
 
397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  36.47 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  37.01 
 
 
396 aa  221  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  37.01 
 
 
396 aa  221  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0878  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  33.72 
 
 
632 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.844643 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17111  elongation factor Tu  36.19 
 
 
399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  33.72 
 
 
399 aa  219  6e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  35.25 
 
 
399 aa  219  6e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  35.02 
 
 
400 aa  219  7e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16881  elongation factor Tu  36.34 
 
 
399 aa  219  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16991  elongation factor Tu  35.71 
 
 
399 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1140  elongation factor Tu  34.55 
 
 
400 aa  218  1e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000019246  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0891  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  33.72 
 
 
631 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  35.54 
 
 
396 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  35.32 
 
 
397 aa  219  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>