More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1034 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1034  elongation factor 1-alpha  100 
 
 
432 aa  883    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1196  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  58.41 
 
 
435 aa  539  9.999999999999999e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0647  elongation factor 1-alpha  59.91 
 
 
433 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000513743  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0041  elongation factor 1-alpha  56.07 
 
 
435 aa  529  1e-149  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000171412  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1441  elongation factor 1-alpha  57.88 
 
 
425 aa  525  1e-148  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.891927  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0073  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  57.58 
 
 
424 aa  516  1.0000000000000001e-145  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000421656  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0782  elongation factor 1-alpha  58.37 
 
 
428 aa  514  1e-144  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1553  elongation factor 1-alpha  56.53 
 
 
426 aa  509  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0730  elongation factor 1-alpha  56.57 
 
 
425 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425571  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0821  elongation factor 1-alpha  56.51 
 
 
424 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0156  elongation factor 1-alpha  53.97 
 
 
421 aa  501  1e-140  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0699  elongation factor 1-alpha  54.82 
 
 
425 aa  498  1e-140  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.085121 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0680  elongation factor 1-alpha  55.94 
 
 
428 aa  498  1e-140  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0208  elongation factor 1-alpha  55.58 
 
 
428 aa  500  1e-140  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371461  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0615  elongation factor 1-alpha  55.58 
 
 
428 aa  499  1e-140  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1303  elongation factor 1-alpha  55.58 
 
 
428 aa  499  1e-140  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1592  elongation factor 1-alpha  55.5 
 
 
425 aa  496  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1170  elongation factor 1-alpha  54.78 
 
 
422 aa  497  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0397  elongation factor 1-alpha  54.85 
 
 
444 aa  494  1e-139  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209425  normal  0.0958678 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1362  elongation factor 1-alpha  54.37 
 
 
444 aa  491  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.91449  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3685  elongation factor 1-alpha  55.14 
 
 
422 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.222951 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1745  elongation factor 1-alpha  53.66 
 
 
444 aa  492  9.999999999999999e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1731  elongation factor 1-alpha  54.14 
 
 
444 aa  491  1e-137  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222772 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1111  elongation factor 1-alpha  54.14 
 
 
444 aa  490  1e-137  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0497  elongation factor 1-alpha  53.27 
 
 
420 aa  483  1e-135  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3066  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  52.8 
 
 
420 aa  483  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2516  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  52.25 
 
 
420 aa  476  1e-133  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3261  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  52.25 
 
 
423 aa  475  1e-133  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664199  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28737  predicted protein  53.41 
 
 
439 aa  474  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723788  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0811  elongation factor 1-alpha  52.82 
 
 
423 aa  473  1e-132  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18475  translation elongation factor, EF-1, alpha subunit  53.41 
 
 
439 aa  473  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00280729  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65303  Elongation factor 1-alpha (EF-1-alpha)  50.23 
 
 
458 aa  473  1e-132  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.977722  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77514  translational elongation factor EF-1 alpha  50.23 
 
 
458 aa  473  1e-132  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01300  translation elongation factor EF1-alpha, putative  50.45 
 
 
459 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04218  elongation factor 1-alpha (Broad)  48.31 
 
 
468 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300924  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83594  elongation release factor  36.6 
 
 
707 aa  293  3e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.432493  normal  0.18618 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01540  translation release factor, putative  37.5 
 
 
757 aa  292  9e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27198  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  36.62 
 
 
467 aa  290  2e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00593045 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27060  Eukaryotic elongation factor 1 alpha  36.62 
 
 
467 aa  290  2e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293222  hitchhiker  0.0000941001 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29711  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  36.62 
 
 
467 aa  290  2e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105785  hitchhiker  0.00273357 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04740  conserved hypothetical protein  36.55 
 
 
914 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.810548  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02080  translation release factor eRF3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04820)  34.62 
 
 
708 aa  283  4.0000000000000003e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02063  translation elongation factor EF-1 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04630)  36.07 
 
 
576 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14961  predicted protein  35.24 
 
 
406 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000165599  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36881  predicted protein  33.41 
 
 
481 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416405  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34493  predicted protein  34.54 
 
 
447 aa  254  3e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6447  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.26 
 
 
601 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.832867  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.57 
 
 
639 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1629  protein synthesis factor GTP-binding  36 
 
 
408 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.418105  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2971  sulfate adenylate transferase, large subunit/adenylylsulfate kinase  32.62 
 
 
604 aa  230  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2586  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.62 
 
 
614 aa  230  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8319  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4396  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  34.2 
 
 
640 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2623  sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.99 
 
 
470 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0651162  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1768  GTPases - sulfate adenylate transferase subunit 1  30.54 
 
 
600 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00233348  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1194  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.88 
 
 
564 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48738  predicted protein  30.91 
 
 
581 aa  223  6e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.655952 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0754  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  31.31 
 
 
660 aa  222  9e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3253  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  32.16 
 
 
644 aa  222  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438405  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1153  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.62 
 
 
642 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1559  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.95 
 
 
599 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909063  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1042  adenylylsulfate kinase  31.83 
 
 
642 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0824  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.85 
 
 
636 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.533102  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0841  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  31.31 
 
 
660 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1718  elongation factor Tu GTP binding domain-containing protein  31.49 
 
 
516 aa  219  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3828  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.79 
 
 
615 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6984  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  31.62 
 
 
636 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1398  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.06 
 
 
639 aa  216  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0369421  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3564  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.42 
 
 
641 aa  216  5e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0834  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.9 
 
 
640 aa  216  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788536  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4111  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.55 
 
 
598 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1400  sulfate adenylyltransferase, large subunit  34.96 
 
 
645 aa  216  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2143  sulfate adenylyltransferase subunit 1  31.41 
 
 
471 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1532  sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.43 
 
 
647 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4432  sulfate adenylate transferase, subunit 1/adenylylsulfate kinase  30.5 
 
 
632 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000187918  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4126  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.26 
 
 
632 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0158  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.28 
 
 
470 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0740316  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3933  sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.28 
 
 
559 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4017  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.68 
 
 
639 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897015  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1526  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  31.37 
 
 
633 aa  213  5.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465942 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0070  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.53 
 
 
652 aa  212  9e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.972692  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5014  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.5 
 
 
632 aa  212  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.688954  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15121  predicted protein  29.27 
 
 
450 aa  212  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00103501  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2860  sulfate adenylyltransferase subunit 1  29.48 
 
 
555 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.737389  hitchhiker  0.000171805 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1018  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  31.29 
 
 
634 aa  210  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1235  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.33 
 
 
444 aa  211  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57710  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.26 
 
 
633 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1865  sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.14 
 
 
551 aa  209  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2764  adenylylsulfate kinase  29.72 
 
 
641 aa  209  7e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2352  sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.14 
 
 
551 aa  209  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.924472  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2617  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.25 
 
 
445 aa  209  9e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0878  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.97 
 
 
632 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.844643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4225  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.68 
 
 
647 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279145  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2537  adenylylsulfate kinase / sulfate adenylyltransferase subunit 1  31.25 
 
 
599 aa  208  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0327  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  30.42 
 
 
631 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.171522 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0823  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.26 
 
 
438 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.732187  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1149  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.54 
 
 
427 aa  207  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.760256  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0829  sulfate adenylyltransferase subunit 1  31.83 
 
 
543 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1530  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  29.93 
 
 
651 aa  207  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861038  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3726  sulfate adenylyltransferase subunit 1  32.43 
 
 
475 aa  206  9e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5802  sulfate adenylyltransferase subunit 1  32.71 
 
 
438 aa  206  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0412197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>