More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1303 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0680  elongation factor 1-alpha  93.69 
 
 
428 aa  832    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0782  elongation factor 1-alpha  82.94 
 
 
428 aa  748    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1303  elongation factor 1-alpha  100 
 
 
428 aa  874    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0208  elongation factor 1-alpha  99.3 
 
 
428 aa  868    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371461  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0615  elongation factor 1-alpha  99.07 
 
 
428 aa  867    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1553  elongation factor 1-alpha  66.74 
 
 
426 aa  595  1e-169  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0730  elongation factor 1-alpha  66.28 
 
 
425 aa  585  1e-166  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425571  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0699  elongation factor 1-alpha  64.87 
 
 
425 aa  584  1.0000000000000001e-165  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.085121 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1441  elongation factor 1-alpha  63.93 
 
 
425 aa  580  1e-164  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.891927  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1592  elongation factor 1-alpha  65.02 
 
 
425 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0821  elongation factor 1-alpha  65.19 
 
 
424 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3685  elongation factor 1-alpha  64.08 
 
 
422 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.222951 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3066  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  61.72 
 
 
420 aa  558  1e-158  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0073  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  63.08 
 
 
424 aa  560  1e-158  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000421656  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1170  elongation factor 1-alpha  63.59 
 
 
422 aa  556  1e-157  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0156  elongation factor 1-alpha  61.32 
 
 
421 aa  556  1e-157  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0811  elongation factor 1-alpha  60.56 
 
 
423 aa  548  1e-155  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0497  elongation factor 1-alpha  61.48 
 
 
420 aa  548  1e-155  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2516  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  60.29 
 
 
420 aa  547  1e-154  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3261  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  59.67 
 
 
423 aa  538  9.999999999999999e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664199  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0647  elongation factor 1-alpha  57.01 
 
 
433 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000513743  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1034  elongation factor 1-alpha  55.58 
 
 
432 aa  499  1e-140  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1196  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  55.4 
 
 
435 aa  488  1e-137  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0041  elongation factor 1-alpha  54.5 
 
 
435 aa  484  1e-135  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000171412  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1731  elongation factor 1-alpha  53.76 
 
 
444 aa  480  1e-134  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222772 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1362  elongation factor 1-alpha  54.23 
 
 
444 aa  479  1e-134  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.91449  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1111  elongation factor 1-alpha  54.23 
 
 
444 aa  479  1e-134  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0397  elongation factor 1-alpha  53.52 
 
 
444 aa  478  1e-134  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209425  normal  0.0958678 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04218  elongation factor 1-alpha (Broad)  52.78 
 
 
468 aa  471  1e-132  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300924  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1745  elongation factor 1-alpha  53.05 
 
 
444 aa  474  1e-132  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01300  translation elongation factor EF1-alpha, putative  52.81 
 
 
459 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65303  Elongation factor 1-alpha (EF-1-alpha)  52.81 
 
 
458 aa  470  1.0000000000000001e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.977722  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77514  translational elongation factor EF-1 alpha  52.81 
 
 
458 aa  470  1.0000000000000001e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18475  translation elongation factor, EF-1, alpha subunit  52.34 
 
 
439 aa  459  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00280729  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28737  predicted protein  52.1 
 
 
439 aa  457  1e-127  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723788  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29711  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  38.41 
 
 
467 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105785  hitchhiker  0.00273357 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27060  Eukaryotic elongation factor 1 alpha  38.41 
 
 
467 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293222  hitchhiker  0.0000941001 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27198  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  38.41 
 
 
467 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00593045 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02063  translation elongation factor EF-1 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04630)  36.3 
 
 
576 aa  264  3e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83594  elongation release factor  36.47 
 
 
707 aa  262  1e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.432493  normal  0.18618 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1718  elongation factor Tu GTP binding domain-containing protein  35.15 
 
 
516 aa  255  8e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04740  conserved hypothetical protein  35.78 
 
 
914 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.810548  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6984  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  33.26 
 
 
636 aa  247  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01540  translation release factor, putative  33.64 
 
 
757 aa  245  9.999999999999999e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0824  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.87 
 
 
636 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.533102  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4017  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.41 
 
 
639 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897015  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6447  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.82 
 
 
601 aa  242  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.832867  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02080  translation release factor eRF3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04820)  32.95 
 
 
708 aa  241  2.9999999999999997e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1194  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.33 
 
 
564 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.77 
 
 
639 aa  239  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34493  predicted protein  34.71 
 
 
447 aa  239  5.999999999999999e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1153  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.31 
 
 
642 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0829  sulfate adenylyltransferase subunit 1  34.89 
 
 
543 aa  236  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36881  predicted protein  33.26 
 
 
481 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416405  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1042  adenylylsulfate kinase  32.08 
 
 
642 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3564  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.06 
 
 
641 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14961  predicted protein  33.17 
 
 
406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000165599  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2623  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.79 
 
 
470 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0651162  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1400  sulfate adenylyltransferase, large subunit  37.27 
 
 
645 aa  230  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2764  adenylylsulfate kinase  30.82 
 
 
641 aa  230  5e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1629  protein synthesis factor GTP-binding  36.19 
 
 
408 aa  229  9e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.418105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4111  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.33 
 
 
598 aa  229  9e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3828  sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.08 
 
 
615 aa  226  7e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2537  adenylylsulfate kinase / sulfate adenylyltransferase subunit 1  33.33 
 
 
599 aa  225  9e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4126  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  33.41 
 
 
632 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4432  sulfate adenylate transferase, subunit 1/adenylylsulfate kinase  33.26 
 
 
632 aa  222  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000187918  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12980  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  31.84 
 
 
633 aa  220  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5014  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  32.63 
 
 
632 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.688954  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0878  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  33.8 
 
 
632 aa  219  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.844643 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0911  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  36.25 
 
 
633 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634897  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4545  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  36.47 
 
 
633 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2143  sulfate adenylyltransferase subunit 1  32.87 
 
 
471 aa  216  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57710  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  32.39 
 
 
633 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2183  sulfate adenylyltransferase, large subunit  36.18 
 
 
537 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3978  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.24 
 
 
422 aa  216  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0635  sulfate adenylyltransferase subunit 1  32.71 
 
 
428 aa  216  7e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.217595  normal  0.169289 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1304  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  35.95 
 
 
633 aa  216  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4421  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  35.95 
 
 
633 aa  216  9e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.643598  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1559  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.79 
 
 
599 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909063  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0891  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  35.84 
 
 
631 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3253  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  33.33 
 
 
644 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438405  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0158  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.08 
 
 
470 aa  213  5.999999999999999e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0740316  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06015  sulfate adenylyltransferase subunit 1  31.21 
 
 
415 aa  212  9e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0327  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  31.15 
 
 
631 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.171522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2272  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.72 
 
 
618 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0420  sulfate adenylyltransferase subunit 1  31.16 
 
 
422 aa  210  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15121  predicted protein  31.65 
 
 
450 aa  210  5e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00103501  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3726  sulfate adenylyltransferase subunit 1  35.87 
 
 
475 aa  209  7e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0794  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.16 
 
 
435 aa  209  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  35.63 
 
 
395 aa  209  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3933  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.39 
 
 
619 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11312  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  31.67 
 
 
614 aa  208  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1530  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  33.18 
 
 
651 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861038  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1768  GTPases - sulfate adenylate transferase subunit 1  30.75 
 
 
600 aa  208  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00233348  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2860  sulfate adenylyltransferase subunit 1  31.93 
 
 
555 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.737389  hitchhiker  0.000171805 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1247  elongation factor Tu  36.55 
 
 
396 aa  208  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.727206  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0664  sulfate adenylyltransferase subunit 1  31.88 
 
 
479 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0901  sulfate adenylyltransferase subunit 1  31.79 
 
 
480 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0864  sulfate adenylyltransferase subunit 1  32.02 
 
 
480 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2971  sulfate adenylate transferase, large subunit/adenylylsulfate kinase  32.36 
 
 
604 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>