More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM01300 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_04218  elongation factor 1-alpha (Broad)  83.12 
 
 
468 aa  806    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.300924  normal  0.728795 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01300  translation elongation factor EF1-alpha, putative  100 
 
 
459 aa  942    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28737  predicted protein  72.5 
 
 
439 aa  673    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723788  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77514  translational elongation factor EF-1 alpha  85.37 
 
 
458 aa  815    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65303  Elongation factor 1-alpha (EF-1-alpha)  85.37 
 
 
458 aa  815    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.977722  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18475  translation elongation factor, EF-1, alpha subunit  72.73 
 
 
439 aa  676    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00280729  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1441  elongation factor 1-alpha  53.08 
 
 
425 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.891927  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0073  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  55.08 
 
 
424 aa  491  1e-137  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000421656  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1592  elongation factor 1-alpha  53.05 
 
 
425 aa  486  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0647  elongation factor 1-alpha  52.25 
 
 
433 aa  485  1e-136  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000513743  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0699  elongation factor 1-alpha  53.1 
 
 
425 aa  484  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.085121 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1553  elongation factor 1-alpha  52.16 
 
 
426 aa  476  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0730  elongation factor 1-alpha  53.33 
 
 
425 aa  472  1e-132  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425571  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0680  elongation factor 1-alpha  52.75 
 
 
428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1303  elongation factor 1-alpha  52.81 
 
 
428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0208  elongation factor 1-alpha  53.44 
 
 
428 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371461  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0615  elongation factor 1-alpha  53.21 
 
 
428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1034  elongation factor 1-alpha  50.45 
 
 
432 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1196  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  51.49 
 
 
435 aa  466  9.999999999999999e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0041  elongation factor 1-alpha  50.8 
 
 
435 aa  463  1e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000171412  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0811  elongation factor 1-alpha  49.44 
 
 
423 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0782  elongation factor 1-alpha  51.61 
 
 
428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.405197  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0156  elongation factor 1-alpha  49.43 
 
 
421 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3261  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  47.84 
 
 
423 aa  448  1e-125  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664199  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3066  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  48.96 
 
 
420 aa  450  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3685  elongation factor 1-alpha  49.89 
 
 
422 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.222951 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0821  elongation factor 1-alpha  50.11 
 
 
424 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1745  elongation factor 1-alpha  49.31 
 
 
444 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2516  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  48.63 
 
 
420 aa  444  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0497  elongation factor 1-alpha  48.74 
 
 
420 aa  444  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1170  elongation factor 1-alpha  49.31 
 
 
422 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1362  elongation factor 1-alpha  47.36 
 
 
444 aa  437  1e-121  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.91449  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1111  elongation factor 1-alpha  46.9 
 
 
444 aa  436  1e-121  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0397  elongation factor 1-alpha  47.13 
 
 
444 aa  432  1e-120  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209425  normal  0.0958678 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1731  elongation factor 1-alpha  46.44 
 
 
444 aa  432  1e-120  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222772 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29711  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  40.73 
 
 
467 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0105785  hitchhiker  0.00273357 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27060  Eukaryotic elongation factor 1 alpha  40.73 
 
 
467 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293222  hitchhiker  0.0000941001 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27198  Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha  40.73 
 
 
467 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00593045 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83594  elongation release factor  38.18 
 
 
707 aa  304  2.0000000000000002e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.432493  normal  0.18618 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01540  translation release factor, putative  34.86 
 
 
757 aa  289  7e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34493  predicted protein  37.84 
 
 
447 aa  287  2e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04740  conserved hypothetical protein  36.05 
 
 
914 aa  286  5e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.810548  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02063  translation elongation factor EF-1 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04630)  37.08 
 
 
576 aa  279  9e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02080  translation release factor eRF3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04820)  34.59 
 
 
708 aa  270  5e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14961  predicted protein  36.5 
 
 
406 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000165599  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36881  predicted protein  34 
 
 
481 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416405  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3064  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.56 
 
 
639 aa  237  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1194  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.79 
 
 
564 aa  225  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48738  predicted protein  32.44 
 
 
581 aa  224  2e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.655952 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1718  elongation factor Tu GTP binding domain-containing protein  33.33 
 
 
516 aa  216  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3828  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.03 
 
 
615 aa  208  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4017  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  32.21 
 
 
639 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897015  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3564  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.39 
 
 
641 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2764  adenylylsulfate kinase  31.39 
 
 
641 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0824  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.36 
 
 
636 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.533102  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6984  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  30.44 
 
 
636 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1400  sulfate adenylyltransferase, large subunit  33.52 
 
 
645 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6447  sulfate adenylyltransferase, large subunit  35.83 
 
 
601 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.832867  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1153  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.1 
 
 
642 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2971  sulfate adenylate transferase, large subunit/adenylylsulfate kinase  30.7 
 
 
604 aa  196  7e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2586  sulfate adenylyltransferase, large subunit  30.7 
 
 
614 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8319  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1042  adenylylsulfate kinase  30.89 
 
 
642 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15121  predicted protein  28.79 
 
 
450 aa  188  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00103501  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1559  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  29.29 
 
 
599 aa  187  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.909063  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4111  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.83 
 
 
598 aa  186  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1629  protein synthesis factor GTP-binding  30.46 
 
 
408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.418105  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3253  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.07 
 
 
644 aa  184  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438405  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3126  Sulfate adenylyltransferase., Adenylyl-sulfate kinase  28.74 
 
 
626 aa  182  8.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1491  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.64 
 
 
412 aa  181  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2537  adenylylsulfate kinase / sulfate adenylyltransferase subunit 1  29.69 
 
 
599 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1674  sulfate adenylyltransferase subunit 1  29.32 
 
 
432 aa  179  8e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.313363  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4396  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  29.93 
 
 
640 aa  179  8e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  31.83 
 
 
400 aa  178  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  31.24 
 
 
396 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  31.24 
 
 
396 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1526  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  28.54 
 
 
633 aa  177  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465942 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  31.45 
 
 
400 aa  176  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0933  sulfate adenylyltransferase, large subunit  29.02 
 
 
625 aa  176  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861181  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2623  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.94 
 
 
470 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0651162  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  32.21 
 
 
405 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0250  elongation factor Tu  31.6 
 
 
405 aa  175  1.9999999999999998e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0263  elongation factor Tu  31.6 
 
 
405 aa  175  1.9999999999999998e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516793  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0420  sulfate adenylyltransferase subunit 1  30.54 
 
 
422 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  32.21 
 
 
405 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0635  sulfate adenylyltransferase subunit 1  34.67 
 
 
428 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.217595  normal  0.169289 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2225  sulfate adenylyltransferase, large subunit  29.55 
 
 
435 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4560  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  28.8 
 
 
633 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6191  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  28.8 
 
 
633 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2685  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.93 
 
 
443 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2143  sulfate adenylate transferase, subunit 1  28.11 
 
 
466 aa  173  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.43414  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0158  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  26.4 
 
 
470 aa  172  9e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0740316  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11312  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  28.05 
 
 
614 aa  172  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12980  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  27.59 
 
 
633 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1751  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.25 
 
 
639 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.425976  normal  0.0102171 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0460  translation elongation factor Tu  31.76 
 
 
398 aa  171  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0070  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.77 
 
 
652 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.972692  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1140  translation elongation factor Tu  31.76 
 
 
398 aa  171  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000136434  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1693  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.05 
 
 
416 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133685  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2429  sulfate adenylyltransferase, large subunit  29.83 
 
 
462 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.446728 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1053  elongation factor Tu  31.22 
 
 
396 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0848244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>