More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2687 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2687  inner-membrane translocator  100 
 
 		 318 aa  589  1e-167  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.234697  normal  0.118334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.94 
 
 		 315 aa  168  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  40.82 
 
 		 306 aa  149  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0634  inner-membrane translocator  36.79 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  40.29 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  35.99 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  35.45 
 
 		 838 aa  145  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2714  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 351 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00849932  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0177  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 637 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1205  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1795  inner-membrane translocator  38.24 
 
 		 338 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121113  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  36.02 
 
 		 351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1805  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 337 aa  139  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.50221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3270  ABC transporter related  37.09 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 327 aa  139  8.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  35.29 
 
 		 852 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.77 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4660  inner-membrane translocator  34.91 
 
 		 343 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4209  inner-membrane translocator  37.26 
 
 		 346 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0640071  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 339 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 339 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5129  inner-membrane translocator  38.63 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0107834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  36.07 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4270  inner-membrane translocator  35.61 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0195  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  32.83 
 
 		 368 aa  134  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  37.23 
 
 		 342 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  36.79 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  35.2 
 
 		 840 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 346 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 340 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4369  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 346 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0543124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.01 
 
 		 355 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1583  inner-membrane translocator  36.16 
 
 		 319 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  38.1 
 
 		 339 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5097  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 330 aa  129  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282354  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  35.89 
 
 		 381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 633 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4000  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 337 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  34.04 
 
 		 628 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4109  inner-membrane translocator  34.66 
 
 		 325 aa  126  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.648849 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  34.11 
 
 		 597 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 323 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  35.88 
 
 		 337 aa  125  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4906  inner-membrane translocator  34.32 
 
 		 322 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3829  inner-membrane translocator  34.32 
 
 		 322 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4608  inner-membrane translocator  37.6 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0079  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 361 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2059  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2458  inner-membrane translocator  34.43 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4216  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 630 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  34.09 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3828  inner-membrane translocator  36.63 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  32.71 
 
 		 358 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  36.57 
 
 		 337 aa  123  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4999  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0649125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0663  inner-membrane translocator  35.87 
 
 		 339 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.722061  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.57 
 
 		 331 aa  122  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2952  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 333 aa  122  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211647 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0988  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 349 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000237918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 332 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3425  inner-membrane translocator  34.73 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  33.01 
 
 		 594 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3460  inner-membrane translocator  37.33 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5446  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  37.04 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 642 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4399  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  33.89 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6489  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635062  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  36.01 
 
 		 830 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  34.69 
 
 		 646 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  31.61 
 
 		 652 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 322 aa  119  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  33.57 
 
 		 322 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2272  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 332 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4746  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 340 aa  119  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.333311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0059  inner-membrane translocator  34.65 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0244383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  35.29 
 
 		 840 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.72 
 
 		 646 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0173  inner-membrane translocator  34.42 
 
 		 635 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0422307  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3651  inner-membrane translocator  34.08 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4752  inner-membrane translocator  36.61 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2452  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6573  inner-membrane translocator  34.42 
 
 		 347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176253  normal  0.0417549 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0792  inner-membrane translocator  35.07 
 
 		 335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.756221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>