More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1407 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  100 
 
 		 332 aa  652    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  49.49 
 
 		 319 aa  276  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  43.73 
 
 		 321 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  45.51 
 
 		 337 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1482  inner-membrane translocator  52.14 
 
 		 360 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  47.87 
 
 		 317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1821  inner-membrane translocator  49.49 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1732  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  48.83 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  44.81 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2187  inner-membrane translocator  45.58 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2040  inner-membrane translocator  46.08 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000437253 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  43.93 
 
 		 614 aa  231  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  45.86 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3103  inner-membrane translocator  44.03 
 
 		 354 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  42.66 
 
 		 321 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0366  inner-membrane translocator  43.06 
 
 		 310 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000392686  unclonable  0.0000000558621 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1517  inner-membrane translocator  45.29 
 
 		 309 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4795  inner-membrane translocator  41.75 
 
 		 319 aa  199  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341671  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0670  inner-membrane translocator  40.88 
 
 		 335 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2363  inner-membrane translocator  42.46 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0322104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1047  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.16 
 
 		 307 aa  190  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1395  inner-membrane translocator  41.05 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0678  inner-membrane translocator  39.26 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0112  inner-membrane translocator  38.38 
 
 		 327 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 324 aa  179  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4551  inner-membrane translocator  37.34 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  35 
 
 		 297 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1580  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.86 
 
 		 317 aa  176  5e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.571371  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  38.22 
 
 		 358 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.33 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  41.34 
 
 		 589 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  37.79 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2501  inner-membrane translocator  34.68 
 
 		 345 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0891  inner-membrane translocator  37.89 
 
 		 320 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.03 
 
 		 325 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2500  inner-membrane translocator  39.15 
 
 		 407 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.62609  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  37.79 
 
 		 407 aa  170  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2111  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.96 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  39.15 
 
 		 590 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2015  inner-membrane translocator  34.31 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.60727  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  37.73 
 
 		 407 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  38.65 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  37.19 
 
 		 594 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  35.62 
 
 		 593 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0260  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.82 
 
 		 322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2284  inner-membrane translocator  34.1 
 
 		 349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.98813  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  35.62 
 
 		 593 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  36.14 
 
 		 594 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  36.14 
 
 		 594 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  36.14 
 
 		 594 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  34.94 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  36.21 
 
 		 606 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2271  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.900398 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  36.75 
 
 		 327 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1750  inner-membrane translocator  34.12 
 
 		 452 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40589  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.79 
 
 		 594 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0065  inner-membrane translocator  40.15 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.123483 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  35.58 
 
 		 950 aa  162  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  36.14 
 
 		 594 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1595  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 355 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.3 
 
 		 594 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  35.59 
 
 		 594 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  35.94 
 
 		 594 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.94 
 
 		 594 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  35.79 
 
 		 594 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.94 
 
 		 594 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.94 
 
 		 594 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  35.94 
 
 		 594 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  34.27 
 
 		 349 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 326 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  36.62 
 
 		 299 aa  159  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.94 
 
 		 594 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3688  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 330 aa  159  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  36.7 
 
 		 321 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3659  inner-membrane translocator  34.02 
 
 		 341 aa  159  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0535  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 401 aa  158  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000217655 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  35.27 
 
 		 418 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  34.84 
 
 		 593 aa  158  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.96 
 
 		 594 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3206  inner-membrane translocator  34.66 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  37.09 
 
 		 598 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  37.79 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0934  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000511533  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  33.96 
 
 		 594 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  35.83 
 
 		 590 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  34.66 
 
 		 589 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2554  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1135  inner-membrane translocator  38.13 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  33.65 
 
 		 590 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0354  inner-membrane translocator  36.13 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112024  normal  0.284931 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  34.49 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 562 aa  154  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  36.65 
 
 		 830 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 443 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  34.22 
 
 		 594 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  35.97 
 
 		 318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>