More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2501 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2501  inner-membrane translocator  100 
 
 		 345 aa  684    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3659  inner-membrane translocator  57.57 
 
 		 341 aa  341  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  50.31 
 
 		 324 aa  330  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3979  ABC transporter permease  58.7 
 
 		 342 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00212496 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5974  inner-membrane translocator  52.16 
 
 		 341 aa  288  7e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2167  inner-membrane translocator  47.08 
 
 		 325 aa  249  7e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  33.97 
 
 		 332 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 315 aa  175  9e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 317 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  34 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.4 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  35.28 
 
 		 337 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  37.91 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  33.44 
 
 		 350 aa  166  8e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  33.12 
 
 		 350 aa  164  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0312  inner-membrane translocator  30.28 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.950676  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  37.29 
 
 		 830 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1482  inner-membrane translocator  35.38 
 
 		 360 aa  160  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1395  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  34.81 
 
 		 643 aa  156  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 335 aa  155  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  35.61 
 
 		 646 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.98 
 
 		 646 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3103  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  32.54 
 
 		 593 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  36.52 
 
 		 832 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  33.93 
 
 		 299 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0221  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34 
 
 		 328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 321 aa  152  8e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3553  inner-membrane translocator  36.51 
 
 		 331 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0670  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 335 aa  152  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3499  ABC transporter related  32.15 
 
 		 616 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  32.54 
 
 		 593 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 349 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 357 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1821  inner-membrane translocator  35.52 
 
 		 328 aa  149  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  32.97 
 
 		 582 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3688  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2363  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0322104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 327 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  30.94 
 
 		 407 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  31.55 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1732  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.99 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2040  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000437253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0354  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112024  normal  0.284931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 381 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 358 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  31.33 
 
 		 407 aa  143  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3027  inner-membrane translocator  30.52 
 
 		 393 aa  143  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal  0.739943 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1471  inner-membrane translocator  32.88 
 
 		 376 aa  143  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.959824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2187  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 320 aa  143  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  31.55 
 
 		 348 aa  142  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  34.63 
 
 		 663 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  35.25 
 
 		 647 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  29.77 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6116  branched chain amino acid ABC transporter permease  32.29 
 
 		 332 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0366  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 310 aa  139  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000392686  unclonable  0.0000000558621 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 415 aa  139  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 326 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  34.93 
 
 		 648 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1595  inner-membrane translocator  34.25 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  31.87 
 
 		 599 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2958  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like protein  29.97 
 
 		 389 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  31.32 
 
 		 297 aa  135  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.56 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0112  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0678  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0685  inner-membrane translocator  34.96 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00962366  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  32.88 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  32.24 
 
 		 823 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  35.74 
 
 		 840 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  31.91 
 
 		 823 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2738  inner-membrane translocator  34.07 
 
 		 360 aa  133  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 327 aa  132  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  29.26 
 
 		 603 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0065  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 282 aa  132  9e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.123483 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4795  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 319 aa  132  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341671  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1582  inner-membrane translocator  29.06 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  32.9 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1652  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  29.56 
 
 		 562 aa  132  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0263  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4064  inner-membrane translocator  30.5 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0115  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  31.88 
 
 		 614 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1839  inner-membrane translocator  29.17 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0643  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  30.18 
 
 		 606 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0934  inner-membrane translocator  30.51 
 
 		 327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000511533  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  33.23 
 
 		 608 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4209  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 346 aa  130  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0640071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1850  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 340 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0477  inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 346 aa  129  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>