More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2714 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2714  inner-membrane translocator  100 
 
 		 351 aa  684    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00849932  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1205  inner-membrane translocator  71.47 
 
 		 333 aa  440  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4109  inner-membrane translocator  63.32 
 
 		 325 aa  354  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.648849 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  35.44 
 
 		 852 aa  149  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  33.88 
 
 		 358 aa  146  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.27 
 
 		 333 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.65 
 
 		 315 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  32.19 
 
 		 340 aa  139  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  33.81 
 
 		 328 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4999  inner-membrane translocator  33.87 
 
 		 333 aa  139  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0649125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  33.81 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3270  ABC transporter related  37.37 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  32.35 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2558  ABC transporter permease  34.88 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.30876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  34.03 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 333 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  37.94 
 
 		 306 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  36.51 
 
 		 840 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  35.08 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4660  inner-membrane translocator  31.93 
 
 		 343 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.77 
 
 		 355 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0079  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 361 aa  129  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  31.15 
 
 		 838 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0177  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 333 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  32.73 
 
 		 597 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 329 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2952  inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  31.85 
 
 		 594 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5097  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 330 aa  122  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282354  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  31.73 
 
 		 337 aa  122  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  33.09 
 
 		 334 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  33.98 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  33.57 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 320 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0634  inner-membrane translocator  31.95 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  30.96 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4399  inner-membrane translocator  30.94 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4746  inner-membrane translocator  32.91 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.333311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1795  inner-membrane translocator  33.46 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121113  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4063  inner-membrane translocator  29.19 
 
 		 632 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141363  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1805  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.50221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1839  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 317 aa  119  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4369  inner-membrane translocator  30.32 
 
 		 346 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0543124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3087  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 321 aa  119  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.878842  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3651  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 335 aa  119  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.33 
 
 		 323 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  34.26 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 339 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  34.26 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2687  inner-membrane translocator  30.68 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.234697  normal  0.118334 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.43 
 
 		 646 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3167  inner-membrane translocator  32.77 
 
 		 442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581238  normal  0.308914 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 652 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  31.73 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  31.05 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3320  inner-membrane translocator  30.32 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  28.72 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  30.25 
 
 		 322 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  29.54 
 
 		 324 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 342 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  35.6 
 
 		 323 aa  116  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  29.89 
 
 		 324 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  34.85 
 
 		 328 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3209  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 334 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1860  inner-membrane translocator  32.41 
 
 		 437 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22716 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0500  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.28 
 
 		 314 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0771469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2458  inner-membrane translocator  28.86 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.32 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0059  inner-membrane translocator  34.22 
 
 		 328 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0244383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1401  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 439 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296284  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0224  inner-membrane translocator  30.93 
 
 		 441 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  29.15 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  34.88 
 
 		 840 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3172  inner-membrane translocator  33.93 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0411504  normal  0.957226 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  32.38 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  32.38 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  29.28 
 
 		 646 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 368 aa  113  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1439  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6489  inner-membrane translocator  32.07 
 
 		 320 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635062  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4000  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 337 aa  112  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 633 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  34.25 
 
 		 840 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  32.62 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1285  inner-membrane translocator  33.2 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168466  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>