More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0500 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0500  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 		 314 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0771469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  39.35 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  39.64 
 
 		 330 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  37.45 
 
 		 346 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  39.71 
 
 		 333 aa  163  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  40.89 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  39 
 
 		 328 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  39.15 
 
 		 340 aa  159  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 339 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 339 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  42.59 
 
 		 313 aa  158  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.71 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3595  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  37.91 
 
 		 315 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  36.79 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  39.42 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 343 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  38.85 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.53 
 
 		 331 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  35.61 
 
 		 838 aa  152  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 340 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.04 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2139  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  42.22 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1583  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3288  hypothetical protein  38.38 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.334199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  36.75 
 
 		 339 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.92 
 
 		 656 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  38.29 
 
 		 337 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  36.26 
 
 		 342 aa  149  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  36.96 
 
 		 337 aa  148  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  36.96 
 
 		 337 aa  148  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0792  inner-membrane translocator  39.19 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.756221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0663  inner-membrane translocator  40 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.722061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  36.53 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2761  inner-membrane translocator  36.74 
 
 		 411 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1383  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 399 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1513  inner-membrane translocator  31.52 
 
 		 399 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  37.41 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  37.19 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  36 
 
 		 324 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 333 aa  146  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1946  inner-membrane translocator  36.12 
 
 		 411 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0059  inner-membrane translocator  38 
 
 		 328 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0244383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3270  ABC transporter related  34.04 
 
 		 313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  36.12 
 
 		 324 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  38.49 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1402  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.744825 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  35.19 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  35.51 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  36.03 
 
 		 840 aa  142  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  34.84 
 
 		 328 aa  142  9e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  33.09 
 
 		 632 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1398  inner-membrane translocator  38.01 
 
 		 329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4000  inner-membrane translocator  37.14 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4270  inner-membrane translocator  36.44 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3242  inner-membrane translocator  38.52 
 
 		 329 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.194129  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6489  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635062  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 334 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5819  inner-membrane translocator  36.53 
 
 		 329 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186482  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8053  inner-membrane translocator  37.74 
 
 		 331 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4452  inner-membrane translocator  37.74 
 
 		 331 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  35.52 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 652 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6725  inner-membrane translocator  37.27 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  36.9 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3425  inner-membrane translocator  38.55 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.76 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3716  inner-membrane translocator  37.26 
 
 		 407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272397  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2558  ABC transporter permease  33.09 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.30876 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3516  inner-membrane translocator  36.71 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3209  inner-membrane translocator  35.64 
 
 		 334 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2770  inner-membrane translocator  36.16 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0631444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1795  inner-membrane translocator  39.08 
 
 		 338 aa  136  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121113  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  36.75 
 
 		 852 aa  136  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 339 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0988  inner-membrane translocator  37.27 
 
 		 349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000237918 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2458  inner-membrane translocator  36.29 
 
 		 318 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 318 aa  135  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3133  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 411 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0698666  normal  0.501006 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  36 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1713  inner-membrane translocator  38.15 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0542902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2714  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00849932  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1285  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  35.1 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3779  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3828  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 406 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0177  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 333 aa  132  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  36.63 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4063  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 632 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141363  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5129  inner-membrane translocator  38.52 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0107834 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1676  inner-membrane translocator  36.96 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102995  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  32.99 
 
 		 621 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>