More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1839 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1839  inner-membrane translocator  100 
 
 		 350 aa  671    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  38.03 
 
 		 407 aa  179  7e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5395  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 463 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 415 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 443 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4743  inner-membrane translocator  33.03 
 
 		 433 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127702  hitchhiker  0.000000177935 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.49 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4865  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307682  hitchhiker  0.00000605126 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2140  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.49 
 
 		 423 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0895739  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0864  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.49 
 
 		 427 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0137433  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  32.69 
 
 		 407 aa  162  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.48 
 
 		 307 aa  162  9e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4110  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.72 
 
 		 421 aa  162  9e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.015431  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0774  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.48 
 
 		 427 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1139  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.59 
 
 		 418 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1173  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.59 
 
 		 418 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.907427 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4921  inner-membrane translocator  32.42 
 
 		 433 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0573712  decreased coverage  0.000000000000182248 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4278  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.59 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4657  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.123215  decreased coverage  0.00142103 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3847  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.1 
 
 		 421 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0194014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2865  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 384 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267921  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0554  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 433 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0237898  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0599  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 437 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.577839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4917  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein BraE  33.65 
 
 		 437 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.875772  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1156  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.28 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652627  normal  0.0268072 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2439  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  34.68 
 
 		 378 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  38.21 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32 
 
 		 418 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3688  inner-membrane translocator  35.82 
 
 		 330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  34.72 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3206  inner-membrane translocator  32.98 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1750  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40589  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  39.64 
 
 		 830 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2167  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  37.94 
 
 		 299 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2500  inner-membrane translocator  35.26 
 
 		 407 aa  153  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.62609  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.68 
 
 		 418 aa  153  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1778  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 444 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.416814 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  34.36 
 
 		 315 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0260  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.39 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  36 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 319 aa  152  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2727  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 385 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64880  putative permease of ABC branched-chain amino acid transporter  35.02 
 
 		 425 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 297 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4331  inner-membrane translocator  32.79 
 
 		 443 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157197  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2707  inner-membrane translocator  32.56 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2082  inner-membrane translocator  32.4 
 
 		 456 aa  150  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2317  inner-membrane translocator  32.56 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156371  hitchhiker  0.00287138 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2210  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component  32.63 
 
 		 456 aa  150  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.689313  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5636  branched chain amino acid ABC transporter permease  35.33 
 
 		 425 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 300 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.66 
 
 		 339 aa  149  5e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0653  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.51 
 
 		 423 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3337  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  33.97 
 
 		 423 aa  149  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5324  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  33.12 
 
 		 446 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538003  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1724  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.13 
 
 		 459 aa  149  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1621  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 445 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0814712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3201  inner-membrane translocator  35.2 
 
 		 428 aa  149  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.427646 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0343  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 470 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1728  inner-membrane translocator  32.92 
 
 		 363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2612  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 461 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16306  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0065  inner-membrane translocator  39.52 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.123483 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3327  inner-membrane translocator  32.92 
 
 		 463 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.630335 
 
 
-
 
NC_004310  BR1790  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.83 
 
 		 459 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4945  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.54 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1113  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 460 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0230  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.34 
 
 		 427 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.733178 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4430  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.54 
 
 		 423 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460917  hitchhiker  0.00013336 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26110  ABC-transporter permease protein  35.9 
 
 		 424 aa  147  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0693471  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  32.13 
 
 		 562 aa  147  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3071  inner-membrane translocator  32.92 
 
 		 463 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5270  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.2 
 
 		 423 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0100  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  31.48 
 
 		 424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4333  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.66 
 
 		 412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546398  normal  0.109331 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  34.15 
 
 		 350 aa  146  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3625  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.88 
 
 		 423 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3350  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.2 
 
 		 423 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5017  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.2 
 
 		 423 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  34.15 
 
 		 350 aa  146  6e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2317  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.49 
 
 		 425 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433018  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  31.35 
 
 		 318 aa  145  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2111  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34 
 
 		 298 aa  145  9e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01987  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  38.31 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0264  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.9 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00136517  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.56 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.53 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.56 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.56 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0941  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.56 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0498835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6116  branched chain amino acid ABC transporter permease  34.6 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.56 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1850  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.22 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.56 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3972  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.53 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.640531  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3859  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  30.35 
 
 		 425 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.107872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4305  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.31 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0729  inner-membrane translocator  32.8 
 
 		 424 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>