More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3167 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0224  inner-membrane translocator  81.97 
 
 		 441 aa  688    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3167  inner-membrane translocator  100 
 
 		 442 aa  850    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581238  normal  0.308914 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4169  inner-membrane translocator  57.21 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1572  inner-membrane translocator  56.77 
 
 		 433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4566  inner-membrane translocator  54.94 
 
 		 433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163512  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1578  inner-membrane translocator  57.01 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.703431 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1401  inner-membrane translocator  50.37 
 
 		 439 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296284  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1452  inner-membrane translocator  50.61 
 
 		 444 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0642822  hitchhiker  0.000453493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1493  inner-membrane translocator  50.37 
 
 		 444 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.530836  normal  0.532886 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1860  inner-membrane translocator  50.64 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22716 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1752  amino acid ABC transporter permease  52.08 
 
 		 440 aa  359  5e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2928  inner-membrane translocator  49.16 
 
 		 442 aa  349  5e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0634587  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2932  inner-membrane translocator  47.71 
 
 		 440 aa  344  2e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.303159  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1681  inner-membrane translocator  48.97 
 
 		 445 aa  333  5e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2023  inner-membrane translocator  48.71 
 
 		 445 aa  332  9e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.102668  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2576  inner-membrane translocator  42.89 
 
 		 430 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.262012  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1851  inner-membrane translocator  52.24 
 
 		 432 aa  315  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2389  inner-membrane translocator  43.37 
 
 		 429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0550478  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3310  inner-membrane translocator  43.92 
 
 		 454 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.021749 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1795  inner-membrane translocator  48.4 
 
 		 422 aa  305  9.000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1839  inner-membrane translocator  47.3 
 
 		 434 aa  298  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1772  putative amino acid transport system permease lipoprotein transmembrane  48.06 
 
 		 430 aa  295  8e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2817  inner-membrane translocator  44.89 
 
 		 430 aa  275  9e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.678214  normal  0.0943993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1319  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.63 
 
 		 428 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1334  inner-membrane translocator  41.79 
 
 		 408 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1295  inner-membrane translocator  42.09 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1606  inner-membrane translocator  42.9 
 
 		 419 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1393  inner-membrane translocator  40.82 
 
 		 409 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.194259 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4559  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.3 
 
 		 409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.267582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2652  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  45.63 
 
 		 741 aa  197  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0933  inner-membrane translocator  39.69 
 
 		 409 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.532515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1415  inner-membrane translocator  39.69 
 
 		 409 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.446365  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1900  inner-membrane translocator  41.03 
 
 		 405 aa  189  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0023  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.74 
 
 		 406 aa  183  6e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0026  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.47 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1575  inner-membrane translocator  36.56 
 
 		 408 aa  177  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832106  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0908  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  46.33 
 
 		 761 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1439  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  46.33 
 
 		 755 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0441  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein  46.33 
 
 		 749 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721247  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1826  ABC-transporter  46.33 
 
 		 758 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.256194  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1650  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  46.33 
 
 		 752 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1672  ABC-transporter  46.33 
 
 		 746 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0721  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  46 
 
 		 746 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 358 aa  150  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  39.71 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  36.13 
 
 		 340 aa  144  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.42 
 
 		 333 aa  143  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  36.13 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  36.13 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 342 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  37.27 
 
 		 337 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 314 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4999  inner-membrane translocator  36.4 
 
 		 333 aa  136  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0649125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  34.69 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  32.19 
 
 		 852 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 314 aa  133  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  34.07 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  34.07 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 332 aa  130  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3288  hypothetical protein  34.44 
 
 		 332 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.334199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  32.8 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.79 
 
 		 656 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  34.66 
 
 		 343 aa  126  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  34.14 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.63 
 
 		 323 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  30.34 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 323 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  34.69 
 
 		 330 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 324 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  30.31 
 
 		 324 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3779  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 349 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  33.47 
 
 		 328 aa  121  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 309 aa  121  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  35.34 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  33.82 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1713  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 332 aa  120  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0542902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6489  inner-membrane translocator  34.57 
 
 		 320 aa  120  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635062  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  32.18 
 
 		 332 aa  120  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 323 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3320  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 334 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  35.63 
 
 		 306 aa  119  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  30.32 
 
 		 322 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  32.36 
 
 		 327 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3133  inner-membrane translocator  34.91 
 
 		 322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  34.65 
 
 		 863 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0059  inner-membrane translocator  33.73 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0244383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  34.82 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0079  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 361 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4660  inner-membrane translocator  33.94 
 
 		 343 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1946  inner-membrane translocator  29.49 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2714  inner-membrane translocator  32.77 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00849932  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  30.63 
 
 		 346 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4452  inner-membrane translocator  33.71 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>