More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0026 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0026  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 406 aa  792    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0023  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  99.01 
 
 		 406 aa  781    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1575  inner-membrane translocator  66.41 
 
 		 408 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1860  inner-membrane translocator  41.83 
 
 		 437 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22716 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1401  inner-membrane translocator  45.05 
 
 		 439 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296284  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3167  inner-membrane translocator  46.04 
 
 		 442 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581238  normal  0.308914 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0224  inner-membrane translocator  38.84 
 
 		 441 aa  213  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2576  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 430 aa  206  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.262012  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4169  inner-membrane translocator  38.61 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595582  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1752  amino acid ABC transporter permease  46.4 
 
 		 440 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1452  inner-membrane translocator  40 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0642822  hitchhiker  0.000453493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1578  inner-membrane translocator  45.59 
 
 		 433 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.703431 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1493  inner-membrane translocator  42.26 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.530836  normal  0.532886 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4566  inner-membrane translocator  44.49 
 
 		 433 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163512  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2932  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 440 aa  201  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.303159  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2389  inner-membrane translocator  34.05 
 
 		 429 aa  187  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0550478  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2023  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 445 aa  187  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.102668  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1681  inner-membrane translocator  34.24 
 
 		 445 aa  186  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1572  inner-membrane translocator  42.96 
 
 		 433 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2817  inner-membrane translocator  38.56 
 
 		 430 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.678214  normal  0.0943993 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1851  inner-membrane translocator  41.39 
 
 		 432 aa  172  6.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2928  inner-membrane translocator  39.33 
 
 		 442 aa  170  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0634587  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1772  putative amino acid transport system permease lipoprotein transmembrane  35.57 
 
 		 430 aa  169  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1839  inner-membrane translocator  36.09 
 
 		 434 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1319  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.16 
 
 		 428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3310  inner-membrane translocator  36.71 
 
 		 454 aa  163  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.021749 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1795  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 422 aa  153  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  34.89 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  36.51 
 
 		 328 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1295  inner-membrane translocator  39.31 
 
 		 408 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  33.12 
 
 		 322 aa  143  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1334  inner-membrane translocator  39.63 
 
 		 408 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  35.23 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  36.95 
 
 		 314 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 333 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 309 aa  138  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  36.01 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2652  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  40.71 
 
 		 741 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 323 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 332 aa  136  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1439  inner-membrane translocator  34.08 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  31.95 
 
 		 323 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  35.89 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 346 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 342 aa  132  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  33.75 
 
 		 334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 328 aa  131  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.9 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  35.04 
 
 		 306 aa  130  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 330 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3595  inner-membrane translocator  38.77 
 
 		 311 aa  129  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6489  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635062  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  34.03 
 
 		 324 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1606  inner-membrane translocator  40 
 
 		 419 aa  127  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6725  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 329 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.16 
 
 		 656 aa  126  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 318 aa  126  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.56 
 
 		 333 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1393  inner-membrane translocator  38.01 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.194259 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5819  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186482  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.33 
 
 		 323 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  33 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 329 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  35.87 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1795  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 338 aa  124  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121113  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 339 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 339 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  30.71 
 
 		 852 aa  123  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 324 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 324 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  31.89 
 
 		 342 aa  123  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.29 
 
 		 646 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 368 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0059  inner-membrane translocator  35.61 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0244383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3288  hypothetical protein  33.45 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.334199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4559  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.63 
 
 		 409 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.267582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4746  inner-membrane translocator  31.34 
 
 		 340 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.333311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 343 aa  120  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 		 315 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1805  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 337 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.50221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  30.87 
 
 		 340 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  30.7 
 
 		 333 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  32.97 
 
 		 332 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2139  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  35.56 
 
 		 313 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 332 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 332 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  34.81 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3209  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 646 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>