More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2932 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2023  inner-membrane translocator  82.86 
 
 		 445 aa  671    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.102668  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2932  inner-membrane translocator  100 
 
 		 440 aa  864    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.303159  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1681  inner-membrane translocator  83.1 
 
 		 445 aa  671    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3310  inner-membrane translocator  77.78 
 
 		 454 aa  599  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.021749 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2928  inner-membrane translocator  76.25 
 
 		 442 aa  598  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0634587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2576  inner-membrane translocator  69.18 
 
 		 430 aa  593  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.262012  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2389  inner-membrane translocator  68 
 
 		 429 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0550478  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1795  inner-membrane translocator  76.26 
 
 		 422 aa  571  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1839  inner-membrane translocator  73.17 
 
 		 434 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1772  putative amino acid transport system permease lipoprotein transmembrane  64.86 
 
 		 430 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1851  inner-membrane translocator  62.03 
 
 		 432 aa  458  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1401  inner-membrane translocator  54.92 
 
 		 439 aa  435  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296284  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1860  inner-membrane translocator  55.22 
 
 		 437 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22716 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1493  inner-membrane translocator  55.61 
 
 		 444 aa  418  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.530836  normal  0.532886 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1452  inner-membrane translocator  55.61 
 
 		 444 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0642822  hitchhiker  0.000453493 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1752  amino acid ABC transporter permease  53.22 
 
 		 440 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0224  inner-membrane translocator  48.39 
 
 		 441 aa  350  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1578  inner-membrane translocator  49.5 
 
 		 433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.703431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4566  inner-membrane translocator  48.09 
 
 		 433 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163512  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1572  inner-membrane translocator  48.78 
 
 		 433 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4169  inner-membrane translocator  46.94 
 
 		 433 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3167  inner-membrane translocator  50.14 
 
 		 442 aa  320  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581238  normal  0.308914 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2817  inner-membrane translocator  45.76 
 
 		 430 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.678214  normal  0.0943993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1319  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  48.2 
 
 		 428 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2652  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  48.98 
 
 		 741 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1606  inner-membrane translocator  45.88 
 
 		 419 aa  223  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1334  inner-membrane translocator  41.38 
 
 		 408 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1295  inner-membrane translocator  40.66 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0908  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  47.63 
 
 		 761 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0441  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein  47.63 
 
 		 749 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721247  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1826  ABC-transporter  47.63 
 
 		 758 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.256194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1439  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  47.63 
 
 		 755 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1650  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  47.63 
 
 		 752 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1672  ABC-transporter  47.63 
 
 		 746 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1900  inner-membrane translocator  41.69 
 
 		 405 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0721  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  47.32 
 
 		 746 aa  206  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4559  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.95 
 
 		 409 aa  203  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.267582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1393  inner-membrane translocator  39.68 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.194259 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0933  inner-membrane translocator  45.03 
 
 		 409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.532515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1415  inner-membrane translocator  45.03 
 
 		 409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.446365  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1575  inner-membrane translocator  37.26 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0023  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.6 
 
 		 406 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0026  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.34 
 
 		 406 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  32.11 
 
 		 346 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  31.95 
 
 		 358 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3320  inner-membrane translocator  31.17 
 
 		 334 aa  126  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  32.83 
 
 		 340 aa  126  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 337 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 337 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 		 333 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.88 
 
 		 315 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  29.87 
 
 		 852 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4999  inner-membrane translocator  30.42 
 
 		 333 aa  121  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0649125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  34.22 
 
 		 337 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  32.62 
 
 		 339 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  31.96 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  30.43 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  32.21 
 
 		 315 aa  116  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  30.43 
 
 		 328 aa  116  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  30.85 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  29.52 
 
 		 323 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.74 
 
 		 355 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1383  inner-membrane translocator  29.45 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  32.35 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  29.21 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  29.01 
 
 		 838 aa  111  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1402  inner-membrane translocator  26.57 
 
 		 402 aa  110  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.744825 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  31.35 
 
 		 314 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  28.71 
 
 		 324 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1513  inner-membrane translocator  27.91 
 
 		 399 aa  109  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  29.7 
 
 		 339 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1946  inner-membrane translocator  27.93 
 
 		 411 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  32.38 
 
 		 632 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  27.85 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  29.17 
 
 		 340 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  27.85 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  28.16 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.5 
 
 		 646 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0326  inner-membrane translocator  26.84 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  31.13 
 
 		 637 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 633 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0078  branched-chain amino acid ABC transporter permease protein  29.07 
 
 		 374 aa  107  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17119  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  31.34 
 
 		 342 aa  107  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  30.6 
 
 		 309 aa  107  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  28.76 
 
 		 344 aa  106  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 646 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6489  inner-membrane translocator  31.11 
 
 		 320 aa  106  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635062  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  30.61 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2761  inner-membrane translocator  27.37 
 
 		 411 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  30.51 
 
 		 334 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  31.73 
 
 		 328 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2422  inner-membrane translocator  27.95 
 
 		 355 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  28.3 
 
 		 323 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  32.44 
 
 		 863 aa  103  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  29.21 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  29.75 
 
 		 840 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  31.27 
 
 		 628 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  27.74 
 
 		 562 aa  101  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>