More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1839 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1839  inner-membrane translocator  100 
 
 		 434 aa  858    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2576  inner-membrane translocator  67.51 
 
 		 430 aa  593  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.262012  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2932  inner-membrane translocator  71.46 
 
 		 440 aa  588  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.303159  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2023  inner-membrane translocator  73.92 
 
 		 445 aa  585  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.102668  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1681  inner-membrane translocator  74.16 
 
 		 445 aa  587  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2389  inner-membrane translocator  67.51 
 
 		 429 aa  565  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0550478  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2928  inner-membrane translocator  68.47 
 
 		 442 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0634587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3310  inner-membrane translocator  69.86 
 
 		 454 aa  530  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.021749 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1795  inner-membrane translocator  70.84 
 
 		 422 aa  511  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1851  inner-membrane translocator  61.02 
 
 		 432 aa  469  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1772  putative amino acid transport system permease lipoprotein transmembrane  65.71 
 
 		 430 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1401  inner-membrane translocator  53.16 
 
 		 439 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296284  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1860  inner-membrane translocator  51.09 
 
 		 437 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22716 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1493  inner-membrane translocator  51.2 
 
 		 444 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.530836  normal  0.532886 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1452  inner-membrane translocator  51.2 
 
 		 444 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0642822  hitchhiker  0.000453493 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1752  amino acid ABC transporter permease  51.31 
 
 		 440 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1572  inner-membrane translocator  46.9 
 
 		 433 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0224  inner-membrane translocator  47.95 
 
 		 441 aa  342  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1578  inner-membrane translocator  46.05 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.703431 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4169  inner-membrane translocator  46.23 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4566  inner-membrane translocator  44.63 
 
 		 433 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163512  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3167  inner-membrane translocator  48.74 
 
 		 442 aa  316  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581238  normal  0.308914 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2817  inner-membrane translocator  43.08 
 
 		 430 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.678214  normal  0.0943993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1319  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  45.51 
 
 		 428 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2652  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  48.15 
 
 		 741 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1606  inner-membrane translocator  45.72 
 
 		 419 aa  225  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1334  inner-membrane translocator  44.19 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1439  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  47.81 
 
 		 755 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0908  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  47.81 
 
 		 761 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1650  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  47.81 
 
 		 752 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1672  ABC-transporter  47.81 
 
 		 746 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0441  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein  47.81 
 
 		 749 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721247  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1826  ABC-transporter  47.81 
 
 		 758 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.256194  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1295  inner-membrane translocator  44.52 
 
 		 408 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0721  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  47.47 
 
 		 746 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1900  inner-membrane translocator  45.36 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4559  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  44.04 
 
 		 409 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.267582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1393  inner-membrane translocator  42.19 
 
 		 409 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.194259 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0933  inner-membrane translocator  42.52 
 
 		 409 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.532515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1415  inner-membrane translocator  42.52 
 
 		 409 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.446365  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0023  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.12 
 
 		 406 aa  160  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0026  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.51 
 
 		 406 aa  159  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1575  inner-membrane translocator  36.64 
 
 		 408 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 320 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.58 
 
 		 315 aa  123  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  30.59 
 
 		 358 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4999  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0649125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  30.04 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  30.2 
 
 		 346 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.74 
 
 		 333 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  30.26 
 
 		 852 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  28.38 
 
 		 621 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  30.89 
 
 		 327 aa  112  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  31.95 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1383  inner-membrane translocator  29.86 
 
 		 399 aa  111  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  30.34 
 
 		 351 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  28.68 
 
 		 838 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3320  inner-membrane translocator  29.21 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3270  ABC transporter related  30.82 
 
 		 313 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  29.62 
 
 		 333 aa  106  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  32.58 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6489  inner-membrane translocator  31.95 
 
 		 320 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635062  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 340 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  31.37 
 
 		 328 aa  104  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  31.36 
 
 		 342 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 337 aa  104  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1795  inner-membrane translocator  29.71 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121113  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  31.02 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1402  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.744825 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.4 
 
 		 355 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  28.73 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1513  inner-membrane translocator  28.23 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  31.37 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  29.25 
 
 		 339 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0078  branched-chain amino acid ABC transporter permease protein  30.13 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17119  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  29.13 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1805  inner-membrane translocator  29.71 
 
 		 337 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.50221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  29.25 
 
 		 339 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2558  ABC transporter permease  31 
 
 		 330 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.30876 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0059  inner-membrane translocator  30.57 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0244383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  29.47 
 
 		 330 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4399  inner-membrane translocator  29.5 
 
 		 333 aa  99.4  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  30.37 
 
 		 333 aa  99  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  30.06 
 
 		 594 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  27.18 
 
 		 309 aa  99  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 633 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  27.68 
 
 		 323 aa  97.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  28.94 
 
 		 637 aa  97.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2761  inner-membrane translocator  27.79 
 
 		 411 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  29.79 
 
 		 632 aa  97.4  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1946  inner-membrane translocator  28.01 
 
 		 411 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  26.94 
 
 		 324 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  30.87 
 
 		 840 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  27.31 
 
 		 324 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  29.1 
 
 		 323 aa  96.7  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1583  inner-membrane translocator  28.85 
 
 		 319 aa  96.3  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4452  inner-membrane translocator  30.57 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>