More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1319 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1319  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 		 428 aa  818    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2817  inner-membrane translocator  82.79 
 
 		 430 aa  667    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.678214  normal  0.0943993 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1606  inner-membrane translocator  67.14 
 
 		 419 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2652  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  62.88 
 
 		 741 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1334  inner-membrane translocator  56.86 
 
 		 408 aa  328  8e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1295  inner-membrane translocator  57.02 
 
 		 408 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1401  inner-membrane translocator  46.46 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296284  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1752  amino acid ABC transporter permease  55.16 
 
 		 440 aa  316  6e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1493  inner-membrane translocator  45.34 
 
 		 444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.530836  normal  0.532886 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1452  inner-membrane translocator  45.34 
 
 		 444 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0642822  hitchhiker  0.000453493 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1860  inner-membrane translocator  46.55 
 
 		 437 aa  313  5.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22716 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0908  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  61.56 
 
 		 761 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1826  ABC-transporter  61.56 
 
 		 758 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.256194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1439  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.56 
 
 		 755 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0441  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein  61.56 
 
 		 749 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721247  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1672  ABC-transporter  61.56 
 
 		 746 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1650  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.56 
 
 		 752 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4559  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  56.74 
 
 		 409 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.267582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1393  inner-membrane translocator  56.47 
 
 		 409 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.194259 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0721  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.27 
 
 		 746 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1900  inner-membrane translocator  57.51 
 
 		 405 aa  302  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0933  inner-membrane translocator  57.65 
 
 		 409 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.532515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1415  inner-membrane translocator  57.65 
 
 		 409 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.446365  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2932  inner-membrane translocator  48.2 
 
 		 440 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.303159  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0224  inner-membrane translocator  41.85 
 
 		 441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2576  inner-membrane translocator  42.47 
 
 		 430 aa  268  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.262012  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1681  inner-membrane translocator  46.37 
 
 		 445 aa  266  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2023  inner-membrane translocator  46.06 
 
 		 445 aa  266  7e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.102668  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1795  inner-membrane translocator  44.92 
 
 		 422 aa  256  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3310  inner-membrane translocator  42.31 
 
 		 454 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.021749 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1839  inner-membrane translocator  46.98 
 
 		 434 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4169  inner-membrane translocator  41.58 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3167  inner-membrane translocator  48.07 
 
 		 442 aa  251  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581238  normal  0.308914 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1772  putative amino acid transport system permease lipoprotein transmembrane  50.63 
 
 		 430 aa  250  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2389  inner-membrane translocator  42.09 
 
 		 429 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0550478  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2928  inner-membrane translocator  43.63 
 
 		 442 aa  247  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0634587  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1572  inner-membrane translocator  44.52 
 
 		 433 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1851  inner-membrane translocator  47.35 
 
 		 432 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4566  inner-membrane translocator  42.06 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163512  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1578  inner-membrane translocator  47.64 
 
 		 433 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.703431 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0023  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.42 
 
 		 406 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1575  inner-membrane translocator  38.6 
 
 		 408 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832106  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0026  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.04 
 
 		 406 aa  139  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  33.7 
 
 		 339 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  33.7 
 
 		 339 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  33.58 
 
 		 852 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  33.46 
 
 		 351 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  34.69 
 
 		 339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  29.75 
 
 		 333 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4999  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 333 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0649125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.46 
 
 		 355 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0059  inner-membrane translocator  32.82 
 
 		 328 aa  113  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0244383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.13 
 
 		 656 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.85 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6489  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 320 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635062  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  32.58 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4063  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 632 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141363  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2558  ABC transporter permease  31.33 
 
 		 330 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.30876 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 633 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  32.96 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  32.96 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 646 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  33.71 
 
 		 337 aa  110  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0663  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 339 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.722061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  28.87 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  31.05 
 
 		 340 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  30.6 
 
 		 309 aa  108  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.43 
 
 		 646 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8053  inner-membrane translocator  32.82 
 
 		 331 aa  107  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4452  inner-membrane translocator  32.82 
 
 		 331 aa  107  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  31.91 
 
 		 632 aa  106  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  31.7 
 
 		 838 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  33.97 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3320  inner-membrane translocator  31.41 
 
 		 334 aa  106  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  31.51 
 
 		 314 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 342 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  29.32 
 
 		 323 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  30.99 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  32.68 
 
 		 625 aa  102  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  32 
 
 		 320 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4219  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 335 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1946  inner-membrane translocator  29.94 
 
 		 411 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2932  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1205  inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 333 aa  101  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  30.32 
 
 		 322 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  29.28 
 
 		 358 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  30.42 
 
 		 637 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2272  inner-membrane translocator  31.05 
 
 		 332 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3242  inner-membrane translocator  32.43 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.194129  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4109  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 325 aa  101  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.648849 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1583  inner-membrane translocator  33.48 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0155  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 655 aa  100  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  31 
 
 		 642 aa  100  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 328 aa  100  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0173  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 635 aa  100  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0422307  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  30.55 
 
 		 323 aa  100  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  29.29 
 
 		 332 aa  100  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  31.13 
 
 		 339 aa  99.8  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  30.29 
 
 		 328 aa  99.8  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>