More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3310 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1681  inner-membrane translocator  76.83 
 
 		 445 aa  646    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3310  inner-membrane translocator  100 
 
 		 454 aa  899    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.021749 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2932  inner-membrane translocator  77.78 
 
 		 440 aa  645    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.303159  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2023  inner-membrane translocator  76.61 
 
 		 445 aa  646    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.102668  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2928  inner-membrane translocator  74.18 
 
 		 442 aa  588  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0634587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2576  inner-membrane translocator  68.31 
 
 		 430 aa  590  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.262012  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1795  inner-membrane translocator  75.36 
 
 		 422 aa  559  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2389  inner-membrane translocator  66.12 
 
 		 429 aa  554  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0550478  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1839  inner-membrane translocator  70.24 
 
 		 434 aa  502  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1851  inner-membrane translocator  60.63 
 
 		 432 aa  464  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1772  putative amino acid transport system permease lipoprotein transmembrane  60.94 
 
 		 430 aa  448  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1401  inner-membrane translocator  54.42 
 
 		 439 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296284  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1860  inner-membrane translocator  53.43 
 
 		 437 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22716 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1452  inner-membrane translocator  52.33 
 
 		 444 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0642822  hitchhiker  0.000453493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1493  inner-membrane translocator  52.33 
 
 		 444 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.530836  normal  0.532886 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1752  amino acid ABC transporter permease  51.61 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1572  inner-membrane translocator  47.55 
 
 		 433 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0224  inner-membrane translocator  45.98 
 
 		 441 aa  341  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1578  inner-membrane translocator  47.49 
 
 		 433 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.703431 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4169  inner-membrane translocator  46.08 
 
 		 433 aa  329  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4566  inner-membrane translocator  45.98 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163512  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3167  inner-membrane translocator  47.21 
 
 		 442 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581238  normal  0.308914 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2817  inner-membrane translocator  42 
 
 		 430 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.678214  normal  0.0943993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1319  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  43.91 
 
 		 428 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2652  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  47.68 
 
 		 741 aa  231  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1606  inner-membrane translocator  46.11 
 
 		 419 aa  226  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0908  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  49.01 
 
 		 761 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1672  ABC-transporter  49.01 
 
 		 746 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1295  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 408 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1439  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  49.01 
 
 		 755 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0441  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein  49.01 
 
 		 749 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721247  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1826  ABC-transporter  49.01 
 
 		 758 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.256194  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1334  inner-membrane translocator  37.73 
 
 		 408 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1650  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  49.01 
 
 		 752 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0721  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  48.68 
 
 		 746 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4559  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.82 
 
 		 409 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.267582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1900  inner-membrane translocator  40.05 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1393  inner-membrane translocator  39.44 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.194259 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0933  inner-membrane translocator  39.69 
 
 		 409 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.532515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1415  inner-membrane translocator  39.69 
 
 		 409 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.446365  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1575  inner-membrane translocator  37.47 
 
 		 408 aa  177  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0023  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.95 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0026  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.68 
 
 		 406 aa  170  6e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  30.48 
 
 		 852 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4999  inner-membrane translocator  31.53 
 
 		 333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0649125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  30.97 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.72 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  30.94 
 
 		 340 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  30.57 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  30.57 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.38 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  28.12 
 
 		 358 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  29.77 
 
 		 339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 337 aa  118  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  29.09 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  30.2 
 
 		 320 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  31.46 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  30.12 
 
 		 342 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3320  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 334 aa  113  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  29.7 
 
 		 339 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6489  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 320 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635062  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  26.57 
 
 		 323 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  29.1 
 
 		 351 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1402  inner-membrane translocator  29.02 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.744825 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  29.24 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  30.43 
 
 		 328 aa  108  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  31.08 
 
 		 863 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.39 
 
 		 656 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  29.91 
 
 		 327 aa  107  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0326  inner-membrane translocator  26.94 
 
 		 359 aa  107  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  30.26 
 
 		 332 aa  107  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  30.96 
 
 		 304 aa  107  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  32.85 
 
 		 632 aa  106  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  28.41 
 
 		 322 aa  106  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 333 aa  106  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  27.52 
 
 		 339 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  27.52 
 
 		 339 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0792  inner-membrane translocator  28.47 
 
 		 335 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.756221 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2422  inner-membrane translocator  27.27 
 
 		 355 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  30.08 
 
 		 340 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  29.28 
 
 		 314 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.11 
 
 		 331 aa  104  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 328 aa  104  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2558  ABC transporter permease  30.13 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.30876 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  29.56 
 
 		 314 aa  103  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  29.2 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  29.27 
 
 		 330 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1383  inner-membrane translocator  29.05 
 
 		 399 aa  103  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1982  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 358 aa  103  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  28.32 
 
 		 344 aa  103  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  28.08 
 
 		 324 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  28.42 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.26 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  26.32 
 
 		 838 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  28.45 
 
 		 594 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  27.9 
 
 		 328 aa  101  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  29.59 
 
 		 633 aa  100  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  26.88 
 
 		 840 aa  100  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.05 
 
 		 646 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  29.03 
 
 		 840 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>