142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0429 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0429  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
133 aa  271  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0139  MarR family transcriptional regulator  44.86 
 
 
117 aa  99.4  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2180  transcriptional regulator, putative  43.64 
 
 
116 aa  98.2  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.846727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2092  putative transcriptional regulator  42.73 
 
 
116 aa  97.1  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0731  MarR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
116 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3952  MarR family transcriptional regulator  40.57 
 
 
116 aa  91.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0296  hypothetical protein  40.91 
 
 
116 aa  87.4  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128484  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3360  MarR family transcriptional regulator  42.73 
 
 
114 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0243  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0418  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000420026  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0097  MarR family transcriptional regulator  45.36 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427273  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0251  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.493522  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4197  transcriptional regulator, MarR family  44.76 
 
 
116 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4486  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 
116 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  42.35 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3450  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  39.44 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  43.33 
 
 
163 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0931  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
159 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
224 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  39.08 
 
 
159 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 
141 aa  44.3  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 
165 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  39.77 
 
 
161 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
145 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
208 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
172 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
172 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
172 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 
172 aa  42.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
172 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
172 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0284  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0373  transcriptional regulator, IclR family  29.75 
 
 
274 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
167 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 
167 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  36.36 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
163 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  43.86 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
155 aa  42  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3064  transcriptional regulator  35.38 
 
 
159 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 
161 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
171 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
144 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 
161 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
171 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  38.24 
 
 
191 aa  41.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
176 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  37.68 
 
 
195 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  34.29 
 
 
177 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
181 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  35.29 
 
 
171 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.15 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  36.36 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 
159 aa  40.8  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  28.81 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  40.74 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  24.42 
 
 
160 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2147  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
258 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0088  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
212 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.519459 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>