97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0097 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0097  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 109 aa  223  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427273  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3952  MarR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 116 aa  107  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2180  transcriptional regulator, putative  55.42 
 
 		 116 aa  103  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.846727  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0296  hypothetical protein  49.04 
 
 		 116 aa  103  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128484  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2092  putative transcriptional regulator  54.22 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0731  MarR family transcriptional regulator  55.42 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0139  MarR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 117 aa  100  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0243  MarR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 123 aa  97.1  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0251  transcriptional regulator, MarR family  49.47 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.493522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3360  MarR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4486  transcriptional regulator, MarR family  50.5 
 
 		 116 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0418  MarR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000420026  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4197  transcriptional regulator, MarR family  47.52 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0429  MarR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 133 aa  72  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  34.18 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 172 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 172 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  38.67 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 172 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 172 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 172 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 324 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0931  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 168 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 172 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 172 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  36.99 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  34.72 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  34.72 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  34.72 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  34.72 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  34.72 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2380  transcriptional regulator, TrmB  27.59 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.110085  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 220 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  27.18 
 
 		 142 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2545  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00936337  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 208 aa  42.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  32.1 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1308  transcriptional regulator, MarR family  23 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  42  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  27.18 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  40.38 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  33.33 
 
 		 176 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 176 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  33.33 
 
 		 176 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  33.33 
 
 		 176 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 161 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  33.33 
 
 		 176 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  33.33 
 
 		 176 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  33.33 
 
 		 176 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 150 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  33.33 
 
 		 176 aa  41.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 154 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03534  transcriptional regulator for cryptic hemolysin  37.66 
 
 		 210 aa  40.8  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  43.18 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  27.47 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 183 aa  40.8  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  42 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4007  transcriptional regulator, MarR family  38.03 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  36.51 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1768  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 156 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1190  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  30.53 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 156 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 159 aa  40.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 150 aa  40.4  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  40.38 
 
 		 170 aa  40.8  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 200 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  35.09 
 
 		 141 aa  40  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 219 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  31.94 
 
 		 176 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2975  hypothetical protein  34.57 
 
 		 181 aa  40  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 139 aa  40  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>