61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0251 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0251  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
136 aa  269  8.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.493522  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0418  MarR family transcriptional regulator  77.88 
 
 
129 aa  168  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000420026  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0139  MarR family transcriptional regulator  57 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0243  MarR family transcriptional regulator  53.7 
 
 
123 aa  97.1  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2180  transcriptional regulator, putative  49.49 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.846727  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0731  MarR family transcriptional regulator  51.58 
 
 
116 aa  95.1  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2092  putative transcriptional regulator  48.48 
 
 
116 aa  94  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3952  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
116 aa  91.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0296  hypothetical protein  48.89 
 
 
116 aa  88.6  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128484  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4197  transcriptional regulator, MarR family  45.28 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4486  transcriptional regulator, MarR family  44.34 
 
 
116 aa  79.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0097  MarR family transcriptional regulator  48.94 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427273  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3360  MarR family transcriptional regulator  44.76 
 
 
114 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0429  MarR family transcriptional regulator  45.68 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
172 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
172 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
172 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
172 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
172 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1128  transcriptional regulator, MarR family  25.3 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1040  transcriptional regulator, MarR family  25.3 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69196e-21 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
313 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
172 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
172 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  36.36 
 
 
162 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
219 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0013  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
142 aa  44.7  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
200 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0861  MarR family transcriptional regulator  24.1 
 
 
152 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0879  MarR family transcriptional regulator  24.1 
 
 
152 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.544594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0958  MarR family transcriptional regulator  24.1 
 
 
152 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0900  MarR family transcriptional regulator  24.1 
 
 
152 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  30.43 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 
157 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 
166 aa  41.6  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
171 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
171 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
152 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  37.04 
 
 
174 aa  41.2  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1045  MarR family transcriptional regulator  24.1 
 
 
152 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.734934  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
208 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  25.97 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
352 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
320 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1001  transcriptional regulator, MarR family  25.3 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  38.57 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
163 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>