35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3360 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3360  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 114 aa  227  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0296  hypothetical protein  74.56 
 
 		 116 aa  174  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128484  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2180  transcriptional regulator, putative  73.68 
 
 		 116 aa  164  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.846727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2092  putative transcriptional regulator  72.81 
 
 		 116 aa  163  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4486  transcriptional regulator, MarR family  80.7 
 
 		 116 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4197  transcriptional regulator, MarR family  79.82 
 
 		 116 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0731  MarR family transcriptional regulator  71.05 
 
 		 116 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3952  MarR family transcriptional regulator  64.04 
 
 		 116 aa  144  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0139  MarR family transcriptional regulator  55.75 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0243  MarR family transcriptional regulator  58.93 
 
 		 123 aa  127  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0251  transcriptional regulator, MarR family  45.92 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.493522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0097  MarR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 109 aa  84  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427273  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0418  MarR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000420026  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0429  MarR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 224 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0931  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 156 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 145 aa  42  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  38.6 
 
 		 292 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01154  transcriptional regulator MarR family  37.66 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.819197  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0548  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 143 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 324 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>